Job Description P0A6U3 Confidence 99.88% Date Thu Jan 5 11:03:55 GMT 2012 Rank 21 Aligned Residues 475 % Identity 17% Template c3gyxA_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: A: PDB Molecule:adenylylsulfate reductase; PDBTitle: crystal structure of adenylylsulfate reductase from2 desulfovibrio gigas Resolution 3.20 Å

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		4	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.							30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.																							.	.	.
Predicted Secondary structure																												.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																												.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	D	P	F	D	V	I	I	I	G	G	G	H	A	G	T	E	A	A	M	A	A	A	R	M	G	.	.	.	.	.	.	Q	Q	T	L	L	L	T	H	N	I	D	T	L	G	Q	M	S	C	N	P	A	I	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	I	G
Query Conservation																												.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																												.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	H	S	V	D	L	L	M	V	G	G	G	M	G	N	C	G	A	A	F	E	A	V	R	W	A	D	K	Y	A	P	E	A	K	I	L	L	V	D	K	A	S	L	E	R	S	G	A	V	A	Q	G	L	S	A	I	N	T	Y	L	G	D	N	N	A	D	D	Y	V	R	M	V	R	T	D	L	M	G	L	V
Template Known Secondary structure						S							S																			T	T								S	S		T	T	T		S	T	T	T	T										T	T	S													T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		22	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.
		56	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100			.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.
Query SS confidence																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.
Query Sequence		K	G	H	L	V	K	E	V	D	A	L	G	G	L	M	A	K	A	I	D	Q	A	G	I	Q	F	R	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	N	A	S	K	G	P	A	V	R	A	T	R	A	Q	A	D	.	.	R	V	L	Y	R	Q	A	V	R	T	A	L	E	N	Q
Query Conservation																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.
Alig confidence																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	E	D	L	I	Y	D	L	G	R	H	V	D	D	S	V	H	L	F	E	E	W	G	L	P	V	W	I	K	D	E	H	G	H	N	L	D	G	A	Q	A	K	A	A	G	K	S	L	R	N	G	D	K	P	V	R	S	G	R	W	Q	I	M	I	N	G	E	S	Y	K	V	I	V	A	E	A	A	K	N	A
Template Known Secondary structure																								T			B					S	S	S												T			T	T	T	T			B			S	S	T	T							T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		102	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.
		116			.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.				.	.	.	.	.	.	.				140	.	.	.	.			.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure			.	.																	.	.	.								.	.	.						.	.
Query SS confidence			.	.																	.	.	.								.	.	.						.	.
Query Sequence		P	.	.	N	L	M	I	F	Q	Q	A	V	E	D	L	I	V	E	N	.	.	.	D	R	V	V	G	A	V	.	.	.	T	Q	M	G	L	.	.	K	F	R	A	K	A	V	V	L	T	V	G	T	F	L	D	G	K	I	H	I	G	L	D	N	Y	S	G	G	R	A	G	D	P	P	S	I	P	L	S	R
Query Conservation			.	.																	.	.	.								.	.	.						.	.
Alig confidence			.	.																	.	.	.								.	.	.						.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	G	Q	D	R	I	I	E	R	I	F	I	V	K	L	L	L	D	K	N	T	P	N	R	I	A	G	A	V	G	F	N	L	R	A	N	E	V	H	I	F	K	A	N	A	M	V	V	A	C	G	G	A	V	N	V	Y	R	P	R	S	V	G	E	G	M	G	R	A	W	Y	P	V	W	N	A	G	S	T	Y
Template Known Secondary structure				T	T	T				S										S	S	S	T	T	B									S	S	S	S								S									B		S	S	S			S			S	G	G	G	G			S	S		T	T		B	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		182	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.
		186	.											.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	E	L	P	L	R	V	G	R	L	K	T	G	T	P	P	R	I	D	A	R	T	I	D	F	S	V	L	A	Q	Q	H	G	D	N	P	M	P	V	F	S	F	M	G	N	A	S	Q	H	P	Q	Q	V	P	C	Y	I	T	H	T	N	E	K	T	H	D	V	I
Query Conservation				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	M	C	A	Q	V	G	A	E	M	T	M	M	E	N	R	F	V	P	A	R	F	K	D	G	Y	G	P	V	G	A	W	F	L	L	F	K	A	K	A	T	N	C	K	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	D	Y	C	A	T	N	R	A	M	L	K	P	Y	E	E	R	G	Y	A	K	G	H	V	I
Template Known Secondary structure						T	T	T						T	T			B						T	T	T																		T	T	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							T	G	G	G	G					T	T	T	S	S	T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		262	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.											.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.
		256	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	S	N	L	D	R	S	P	M	Y	A	G	V	I	E	G	V	G	P	R	Y	C	P	S	I	E	D	K	V	M	R	F	A	D	R	N	Q	H	Q	I	F	L	E	P	E	G	L	T	S	N	E	I	Y	P	N	G	I	S	T	S	L	P	F	D	V	Q	M	Q	I	V	R	S	M	Q	G	M	E	N	A	K
Query Conservation
Alig confidence																																										.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																										.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	T	C	L	R	N	H	M	M	L	R	E	M	R	E	G	R	G	P	I	Y	M	D	T	K	T	A	L	Q	T	S	F	A	T	M	S	P	A	Q	Q	.	.	.	.	.	.	K	H	L	E	A	E	A	W	E	D	F	L	D	M	C	V	G	Q	A	N	L	W	A	A	T	N	C	A	P	E	E	R	G	S
Template Known Secondary structure							T									T	T																T	T	T	S						.	.	.	.	.	.													T	T											T	T			T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																										.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		332	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.							.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.
		336	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.				.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.
Query SS confidence																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.
Query Sequence		I	V	R	P	G	Y	A	I	E	Y	D	F	F	D	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	D	L	K	P	T	L	E	S	K	F	I	Q	G	L	F	F	A	G	Q	I	N	G	T	T	G	.	.	.	Y	E	E	A	A	A	Q	G	L	L	A	G	L
Query Conservation																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.
Alig confidence																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.																	.	.	.
Template Conservation																																																	.
Template Sequence		E	I	M	P	T	E	P	Y	L	L	G	S	H	S	G	C	C	G	I	W	A	S	G	P	D	E	A	W	V	P	E	D	Y	K	V	R	A	A	N	G	K	V	Y	N	R	M	T	.	T	V	E	G	L	W	T	C	A	D	G	V	G	A	S	G	H	K	F	S	S	G	S	H	A	E	G	R	I	V	G	K
Template Known Secondary structure									B	B		S	S	S	S													T	T	S		G	G	G					T	T	S				T	T	B		.	S	S	B	T					S	S	S	B		S
Template Predicted Secondary structure																																																	.
Template SS confidence
		406	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.		.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.
		390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.			420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.		.	.	.	.	.	460				.	.	.
Predicted Secondary structure																																.	.																																				.							.	.	.
Query SS confidence																																.	.																																				.							.	.	.
Query Sequence		N	A	A	R	L	S	A	D	K	E	G	W	A	P	A	R	S	Q	A	Y	L	G	V	L	V	D	D	L	C	T	.	.	L	G	T	K	E	P	Y	R	M	F	T	S	R	A	E	Y	R	L	M	L	R	E	D	N	A	D	L	R	L	T	E	I	G	R	E	.	L	G	L	V	D	D	.	.	.	E	R	W
Query Conservation																																.	.																																				.							.	.	.
Alig confidence																					.											.	.																																				.							.	.	.
Template Conservation																					.
Template Sequence		Q	M	V	R	W	Y	L	D	H	K	D	F	K	P	E	F	V	E	T	.	A	E	E	L	K	T	L	I	Y	R	P	Y	Y	N	Y	E	K	G	K	G	A	S	T	C	P	V	V	N	P	E	Y	I	S	P	K	N	F	M	M	R	L	I	K	C	T	D	E	Y	G	G	G	V	G	T	Y	Y	N	T	S	K
Template Known Secondary structure										T		S						S	S		.									T										G	G	G		S	S	S	S	S		S	S	S	B																	T	T		T	T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure																					.
Template SS confidence
		485	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.		.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.
		464	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	R	F	N	E	K	L	E	N	I	E	R	E	R	Q	R	L	K	S	T	W	V	T	P	S	A	E	A	A	A	E	V	N
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		A	L	L	D	T	G	F	W	L	M	E	M	L	E	E	D	S	L	K	L	A	A	R	D	L	H	E	L	L	R	C	W	E
Template Known Secondary structure																		G	G	G	B			S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		564	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.