Job Description P0A6U3 Confidence 99.95% Date Thu Jan 5 11:03:55 GMT 2012 Rank 8 Aligned Residues 365 % Identity 18% Template c1jrxA_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: A: PDB Molecule:flavocytochrome c; PDBTitle: crystal structure of arg402ala mutant flavocytochrome c32 from shewanella frigidimarina Resolution 2.00 Å

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		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.																														.	50	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	P	D	P	F	D	V	I	I	I	G	G	G	H	A	G	T	E	A	A	M	A	A	A	R	M	G	Q	Q	T	L	L	L	T	H	N	I	D	T	L	G	Q	M	S	C	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	A	I	G	G
Query Conservation																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	H	D	T	V	D	V	V	V	V	G	S	G	G	A	G	F	S	A	A	I	S	A	T	D	S	G	A	K	V	I	L	I	E	K	E	P	V	I	G	G	N	A	K	L	A	A	G	G	M	N	A	A	W	T	D	Q	Q	K	A	K	K	I	T	D	S	P	E	L	M	F	E	D	T	M	K	G	G	Q	N
Template Known Secondary structure			S				S							S													T	T								S	S	S	S	S		T	T	G	G	G			S					S	S							T	T																T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		123	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.
		54	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.					.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																										.	.	.	.
Query SS confidence																																										.	.	.	.
Query Sequence		I	G	K	G	H	L	V	K	E	V	D	A	L	G	G	L	M	A	K	A	I	D	Q	A	G	I	Q	F	R	I	L	N	A	S	K	G	P	A	V	R	.	.	.	.	A	T	R	A	Q	A	D	R	V	L	Y	R	Q	A	V	R	T	A	L	E	N	Q	P	N	L	M	I	F	Q	Q	A	V	E	D	L	I
Query Conservation																																										.	.	.	.
Alig confidence																																										.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	N	D	P	A	L	V	K	V	L	S	S	H	S	K	D	S	V	D	W	M	T	A	M	G	A	D	L	T	D	V	G	M	M	G	G	A	S	V	N	R	A	H	R	P	T	G	G	A	G	V	G	A	H	V	V	Q	V	L	Y	D	N	A	V	K	R	N	I	D	L	R	M	N	T	R	G	I	E	V	L
Template Known Secondary structure			S																						T	T										T	T		S	S						S	T	T	T																		T	T					S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		203	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.
		130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.						.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.
Query SS confidence																	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	E	N	D	R	V	V	G	A	V	T	Q	M	G	L	.	.	.	.	.	K	F	R	A	K	A	V	V	L	T	V	G	T	F	L	D	G	K	I	H	I	G	L	D	N	Y	S	G	G	R	A	G	D	P	P	S	I	P	L	S	R	R	L	R	E	L	P	L	R	V	G	R	L	K	T	G	T	P	P	R
Query Conservation																	.	.	.	.	.
Alig confidence																	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	D	D	K	G	T	V	K	G	I	L	V	K	G	M	Y	K	G	Y	Y	W	V	K	A	D	A	V	I	L	A	T	G	G	F	A	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	N	E	R	V	A	K	L	D	P	S	L	K	G	F	I	S	T	N	Q	P	G
Template Known Secondary structure				T	T	S	S									T	T	T								S										T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										G	G	G	T	T			B	S	S		T	T
Template Predicted Secondary structure																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		283	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340
		205	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.						.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																										.	.	.	.	.
Query SS confidence																																										.	.	.	.	.
Query Sequence		I	D	A	R	T	I	D	F	S	V	L	A	Q	Q	H	G	D	N	P	M	P	V	F	S	F	M	G	N	A	S	Q	H	P	Q	Q	V	P	C	Y	I	.	.	.	.	.	T	H	T	N	E	K	T	H	D	V	I	R	S	N	L	D	R	S	P	M	Y	A	G	V	I	E	G	V	G	P	R	Y	C	P	S
Query Conservation																																										.	.	.	.	.
Alig confidence																																										.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	V	G	D	G	L	D	V	A	E	N	A	G	G	A	L	K	D	M	Q	Y	I	Q	A	H	P	T	L	S	V	K	G	G	V	M	V	T	E	A	V	R	G	N	G	A	I	L	V	N	R	E	G	K	R	F	V	N	E	I	T	T	A	D	K	A	S	A	A	I	L	A	Q	T	G	K	S	A	Y	L	I
Template Known Secondary structure			S	S									T	T						T	T										T	T	T		S	B			T					T	T						T	T	S				S		T	T	S											T	S	G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		341	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
		280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.																														.	.	330
Predicted Secondary structure																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	E	D	K	V	M	R	F	A	D	R	N	Q	H	Q	I	F	L	E	P	E	G	L	T	S	N	E	I	Y	P	N	G	I	S	T	S	L	P	F	D	V	Q	M	Q	I	V	R	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	Q	G
Query Conservation																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																		.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																		.
Template Sequence		F	D	D	S	V	R	K	S	L	S	K	I	D	K	Y	I	G	L	G	V	A	P	T	A	D	S	L	V	K	L	G	K	.	M	E	G	I	D	G	K	A	L	T	E	T	V	A	R	Y	N	S	L	V	S	S	G	K	D	T	D	F	E	R	P	N	L	P	R	A	L	N	E	G	N	Y	Y	A	I	E	V
Template Known Secondary structure											T									T						S	S							.			T	S																			T			T	T	T			S						S		S	S
Template Predicted Secondary structure																																		.
Template SS confidence
		421	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.		.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		331	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.		.	.	.	.	.									.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																												.						.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																												.						.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		M	E	N	A	K	I	V	R	P	G	Y	A	I	E	Y	D	F	F	D	P	R	D	L	K	P	T	L	E	S	K	F	I	Q	G	L	F	F	A	G	Q	I	N	.	G	T	T	G	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	E	E	A	A	A	Q	G	L	L	A	G	L	N	A	A	R	L	S
Query Conservation																																												.						.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence														.	.	.	.	.																										.						.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation														.	.	.	.	.
Template Sequence		T	P	G	V	H	H	T	M	G	G	V	M	.	.	.	.	.	I	D	T	K	A	E	V	M	N	A	K	K	Q	V	I	P	G	L	Y	G	A	G	E	V	T	G	G	V	H	G	A	N	R	L	G	G	N	A	I	S	D	I	I	T	F	G	R	L	A	G	E	E	A	A	K	Y	S
Template Known Secondary structure														.	.	.	.	.	B		T	T						T	T											S	T	T			S	S	S	T	T	S			T	T
Template Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.
Template SS confidence
		500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.						.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.