Job Description P13656 Confidence 99.70% Date Thu Jan 5 11:33:39 GMT 2012 Rank 10 Aligned Residues 355 % Identity 20% Template c3b9eA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:chitinase a; PDBTitle: crystal structure of inactive mutant e315m chitinase a from2 vibrio harveyi Resolution 1.70 Å

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		504	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.			.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.
Predicted Secondary structure																									.	.
Query SS confidence																									.	.
Query Sequence		N	S	R	P	W	K	P	L	G	K	A	Q	S	Y	S	N	E	E	L	N	N	A	P	.	.	Q	F	N	P	E	T	L	Y	A	S	D	T	L	I	R	F	N	G	V	N	Y	I	S	Q	S	K	V	Q	K	V	S	P	S	D	S	N	P	W	R	V	F	V	D	W	T	G	T	K	E	R	V	G	T	P	K
Query Conservation																									.	.
Alig confidence												.													.	.
Template Conservation												.
Template Sequence		K	F	N	Q	W	S	G	T	S	G	.	D	T	Y	N	V	Y	F	D	G	V	K	V	A	T	G	A	I	T	G	S	Q	T	T	A	S	F	E	Y	G	Q	G	G	L	Y	Q	M	E	I	E	A	C	D	A	T	G	C	S	K	S	A	P	V	E	I	T	I	A	D	T	D	G	S	H	L	K	P	L	T	M
Template Known Secondary structure							S	S				.	S							T	T										T	T																							S	S															T	T		T	T	S
Template Predicted Secondary structure												.
Template SS confidence
		66	.	.	.	70	.	.	.	.	.		.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.
		582										.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.		.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620		.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.	.	.															.																									.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence			.	.	.	.	.	.	.	.	.															.																									.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	W	P	K	H	V	Y	A	P	Y	V	D	F	T	.	L	N	T	I	P	D	L	A	A	L	A	K	N	H	N	V	N	H	F	T	L	A	F	V	.	V	S	K	D	A	N	T	C	L	P	T	W	G	T	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation			.	.	.	.	.	.	.	.	.															.																									.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence			.	.	.	.	.	.	.	.	.															.																									.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	V	D	P	N	N	K	S	Y	N	T	D	P	S	I	V	M	G	T	Y	F	V	E	W	G	I	Y	G	R	D	Y	T	V	D	N	M	P	V	D	N	L	T	H	I	L	Y	G	F	I	P	I	C	G	P	N	E	S	V	K	S	V	G	G	N	S	F	N	A	L	Q	T	A	C	R	G	V	N	D	Y	E
Template Known Secondary structure					T	T	S							T	T	S								G	G	G	G	S	T	T				G	G	G	S		G	G	G		S									B	S	S			G	G	G	G	G	T		T	T										T	T	S		T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		145	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.
																						636	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.			.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.				.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.																.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.																.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	G	M	Q	N	Y	A	Q	Y	S	K	I	K	A	L	R	E	A	.	.	G	G	D	V	M	L	S	I	G	G	A	N	N	A	P	.	.	.	L	A	A	S	C	K	N	V	D	D	L	M	Q	H	Y	Y	D	I	V	D	N	L
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.																.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.																.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	V	I	H	D	P	W	A	A	Y	Q	K	S	F	P	Q	A	G	H	E	Y	S	T	P	I	K	G	N	Y	A	M	L	M	A	L	K	Q	R	N	P	D	L	K	I	I	P	S	I	G	G	W	T	L	S	D	P	F	Y	D	F	V	D	K	K	N	R	D	T	F	V	A	S	V	K	K	F	L	K	T	W
Template Known Secondary structure		B			S							T	S			G	G	G	T			T	T		S	S															T	T										T	T	S		G	G	G	G	G	T	T	S																		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		225	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.
		691	.		.	.	.	.	.	.	.	700												.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.		.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure				.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.
Query SS confidence				.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.
Query Sequence		N	L	.	K	V	L	D	F	D	I	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	T	W	V	A	D	Q	A	S	I	E	R	R	N	L	A	V	K	K	V	Q	D	K	W	K	S	E	.	G	K	D	I	A	I	W	Y	T	L	P	I	L	P	T	G	L	T	P	E	G	M	N	V	L	S	D	A	K	A
Query Conservation				.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.
Alig confidence				.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.																												.	.	.
Template Conservation																																																																															.	.	.
Template Sequence		K	F	Y	D	G	V	D	I	D	W	M	F	P	G	G	G	G	A	A	A	D	K	G	D	P	V	N	D	G	P	A	Y	I	A	L	M	R	E	L	R	V	M	L	D	E	L	E	A	E	T	G	R	T	Y	E	L	T	S	A	I	G	V	G	Y	D	K	I	E	D	V	D	Y	A	D	A	V	Q	.	.	.
Template Known Secondary structure		T	T									S		T	T	S		S	S	S	T	T				T	T	T																								S												S					T	T	S						G	G	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																															.	.	.
Template SS confidence
		305	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.
		758	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.												.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790														.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.									.	.	.
Predicted Secondary structure																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	G	V	E	L	A	G	V	N	V	M	T	M	D	Y	G	N	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	C	Q	S	A	N	T	E	G	Q	N	I	H	G	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	C	A	T	S	A	I	A	N	L	H	S	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	L	K	G
Query Conservation																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.
Template Sequence		.	.	.	Y	M	D	Y	I	F	A	M	T	Y	D	F	Y	G	G	W	N	N	V	P	G	H	Q	T	A	L	Y	C	G	S	F	M	R	P	G	Q	C	D	G	G	G	V	D	E	N	G	E	P	Y	K	G	P	A	Y	T	A	D	N	G	I	Q	L	L	L	A	Q	G	V	P	A	N	K	L	V	L	G	T
Template Known Secondary structure		.	.	.	G		S									S	S		T	T	S	S					S	S		S	S			T	T	S		T	T	T	T	T	T		S	B		T	T	S		B		S	S			S													T			G	G	G
Template Predicted Secondary structure		.	.	.
Template SS confidence
					382	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.
		806	.	.	.	810	.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.																		.	.
Predicted Secondary structure								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	H	P	N	K	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	A	E	I	D	A	M	M	G	T	T	P	M	V	G	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	D
Query Conservation								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	M	Y	G	R	G	W	E	G	V	T	P	D	T	L	T	D	P	N	D	P	M	T	G	T	A	T	G	K	L	K	G	S	T	A	Q	G	V	W	E	D	G	V	I	D	Y	K	G	I	K	S	F	M	L	G	A	N	N	T	G	I	N	G	F	E	Y	G	Y	D	A	Q	A	E	A	P	W	V	W	N	R
Template Known Secondary structure			S										G	G	G		S	S	T	T		G	G	G	S			S							G	G	G	T		S	B	T	T											T	T		T	T	S				T	T							T	T	T	T							T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		459	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.
		830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.				.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																		.	.	.
Query SS confidence																		.	.	.
Query Sequence		V	Q	G	E	V	F	Y	L	S	D	A	R	L	V	M	Q	.	.	.	D	A	Q	K	R	N	L	G	M	V	G	I	W	S	I	A	R	D	L	P
Query Conservation																		.	.	.
Alig confidence																		.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		S	T	G	E	L	I	T	F	D	D	H	R	S	V	L	A	K	G	N	Y	A	K	S	L	G	L	A	G	L	F	S	W	E	I	D	A	D	N	G
Template Known Secondary structure		T	T	T																						T		S							G	G	G			S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		539	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.