Job Description P76205 Confidence 99.96% Date Thu Jan 5 12:20:31 GMT 2012 Rank 9 Aligned Residues 167 % Identity 25% Template d2fo1e1 SCOP info beta-hairpin-alpha-hairpin repeat Ankyrin repeat Ankyrin repeat Resolution 3.12

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		400	.	.	.	.	.	.	.	.		.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.									.	470
Predicted Secondary structure											.																																																													.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence											.																																																													.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	P	A	L	F	L	A	M	M	.	N	G	H	T	D	N	V	K	I	F	M	Q	E	I	Q	S	L	V	D	N	H	I	I	H	E	D	N	L	V	K	L	L	Q	T	K	S	A	N	E	T	P	G	L	Y	I	S	M	L	Y	G	F	D	E	I	I	D	I	F	L	N	.	.	.	.	.	.	.	.	A	L
Query Conservation											.																																																													.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence											.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	S	P	I	K	L	H	T	E	A	A	G	S	Y	A	I	T	E	P	I	T	R	E	S	V	N	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	D	P	R	H	N	R	T	V	L	H	W	I	A	S	N	S	S	A	E	K	S	E	D	L	I	V	H	E	A	K	E	C	I	A	A	G
Template Known Secondary structure													S	S	S				S			S	T	T	T	T	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				S	S											T	T			S			T	T												T
Template Predicted Secondary structure																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		1021	.	.	.	.	.	.	.	.	1030	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1040	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	1050	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1060	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1070	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1080	.	.	.	.
		471	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	T	P	I	A	Q	E	L	L	N	K	K	L	V	M	S	I	L	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	D	V	N	A	X	D	C	D	E	N	T	P	L	X	L	A	V	L	A	R	R	R	R	L	V	A	Y	L	X	K	A	G	A	D	P	T	I	Y	N	K	S	E	R	S	A	L	H	Q	A	A	A	N	R	D	F	G	X	X	V	Y	X	L	N	S	T	K	L	K	G	D	I	E	E	L	D	R	N	G	X
Template Known Secondary structure				T	T				T	T	S											T											T	T			S					T	T											T	T									T	T	S						T	T	S				T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		1085	.	.	.	.	1090	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1160	.	.	.	.
																																							490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	K	I	H	D	G	E	P	G	L	Y	A	A	M	E	N	N	H	P	L	C	V	T	R	F	L	S	K	I	N	G	I	A	F	K	Y	K	L	S	K	A	N	I
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	A	L	X	I	V	A	H	N	E	G	R	D	Q	V	A	S	A	K	L	L	V	E	K	G	A	K	V	D	Y	D	G	A	A	R	K	D	S	E	K	Y	K	G	R	T	A	L	H	Y	A	A	Q	V	S	N	X	P	I	V	K	Y	L	V	G	E	K	G	S	N	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure										S		S	T	T												T			S	S			S	G	G	G	T	S	S	S	S						T						S	S													S				T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		1165	.	.	.	.	1170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1230	.	.	.	.
		533	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	D	L	L	K	G	A	T	A	Q	G	T	P	A	L	Y	I	A	M	S	K	G	N	E	D	V	V	L	S	Y	I	S	T	L	G	A	F	A	K	K	H	S	F	S	Q	H	Q	L	F	T	L	L	A	A	K	N	H	D	N	M	S	A	V	H	I	A	I	H	H	K	H	Y	K	T	V	E	T	Y	Y
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	D	K	Q	D	E	D	G	K	T	P	I	X	L	A	A	Q	E	G	R	I	E	V	V	X	Y	L	I	Q	Q	G	A	S	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	A	V	D	A	T	D	H	T	A	R	Q	L	A	Q	A	N	N	H	H	N	I	V	D	I	F	D
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	T				T	T												T											T	T			S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S				S	S	S										T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
						1235	.	.	.	.	1240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1260	.	.	.	.	.	.	.																.	.	1270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1290	.	.	.	.

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
© Structural Bioinformatics Group, Imperial College, London Lawrence Kelley, Benjamin Jefferys   Disclaimer Terms and Conditions