Job Description P23256 Confidence 99.92% Date Thu Jan 5 11:39:19 GMT 2012 Rank 180 Aligned Residues 375 % Identity 16% Template d1ax4a_ SCOP info PLP-dependent transferase-like PLP-dependent transferases Beta-eliminating lyases Resolution 2.10

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		6	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.			.	40	.	.	.				.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.		.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																			.	.						.	.	.																								.
Query SS confidence																																			.	.						.	.	.																								.
Query Sequence		K	V	V	D	R	H	G	T	W	C	T	Q	W	D	Y	V	A	D	R	F	G	T	A	D	L	L	P	F	T	I	S	D	M	.	.	D	F	A	T	A	.	.	.	P	C	I	I	E	A	L	N	Q	R	L	M	H	G	V	F	G	Y	S	R	W	K	N	.	D	E	F	L	A	A	I	A	H	W	F	S	T
Query Conservation																																			.	.						.	.	.																								.
Alig confidence																																			.	.						.	.	.																								.												.	.
Template Conservation																																																																																.	.
Template Sequence		K	M	V	E	K	I	R	V	P	S	R	E	E	R	E	A	A	L	K	E	A	G	Y	N	P	F	L	L	P	S	S	A	V	Y	I	D	L	L	T	D	S	G	T	N	A	M	S	D	H	Q	W	A	A	M	I	T	G	D	E	A	Y	A	G	S	R	N	Y	Y	D	L	K	D	K	A	K	E	L	F	.	.
Template Known Secondary structure		S																				T	T	S		G	G	G	S		G	G	G		S				S		S	S	S														T					S	S	S																.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																																.	.
Template SS confidence
		12	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.								.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																				.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																				.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	H	Y	T	A	I	D	S	Q	T	V	V	Y	G	P	S	V	I	Y	M	V	S	E	L	I	R	Q	W	S	E	T	G	E	G	.	.	.	.	.	.	.	V	V	I	H	T	P	A	Y	D	A	F	Y	K	A	I	E	G	N	Q	R	T	V	M	P	V	A	L	E	K	Q	A	D	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																				.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	N	Y	D	Y	I	I	P	A	H	Q	G	R	G	A	E	N	I	L	F	P	V	L	L	K	Y	K	Q	K	E	G	K	A	K	N	P	V	F	I	S	N	F	H	F	D	T	T	A	A	H	V	E	L	N	G	C	K	A	I	N	I	V	T	E	K	A	F	D	S	E	T	Y	D	D	W
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.									S	S																			T	T			S	S						S	S												T	T							B		G	G	G	G		T	T	S			T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
								90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.
		146	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.					.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.								.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																					.	.	.	.																																								.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																					.	.	.	.																																								.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	W	F	C	D	M	G	K	L	E	A	V	L	A	K	P	E	C	K	.	.	.	.	I	M	L	L	C	S	P	Q	N	P	T	G	K	V	W	T	C	D	E	L	E	I	M	A	D	L	C	E	R	H	G	V	R	V	I	S	D	E	I	.	.	.	.	.	.	.	H	M	D	M	V	W	G	E	Q	P	H
Query Conservation																					.	.	.	.																																								.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																					.	.	.	.																																								.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	G	D	F	D	I	K	K	L	K	E	N	I	A	Q	H	G	A	D	N	I	V	A	I	V	S	T	V	T	C	N	S	A	G	G	Q	P	V	S	M	S	N	L	K	E	V	Y	E	I	A	K	Q	H	G	I	F	V	V	M	D	S	A	R	F	C	E	N	A	Y	F	I	K	A	R	D	P	K	Y	K	N
Template Known Secondary structure		T	T		B														G	G	G								S	S	B	T	T	T	T	S	B																		T								T	T													G	G	G	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		164	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.
		215	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.			.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.		.	290	.
Predicted Secondary structure																																			.	.																																										.
Query SS confidence																																			.	.																																										.
Query Sequence		I	P	W	S	N	V	A	R	G	D	W	A	L	L	T	S	G	S	K	S	F	N	I	P	A	L	T	G	A	Y	G	I	I	.	.	E	N	S	S	S	R	D	A	Y	L	S	A	L	K	G	R	D	G	L	S	S	P	S	V	L	A	L	T	A	H	I	A	A	Y	Q	Q	G	A	P	W	L	.	D	A	L
Query Conservation																																			.	.																																										.
Alig confidence																																			.	.																																										.
Template Conservation
Template Sequence		A	T	I	K	E	V	I	F	D	M	Y	K	Y	A	D	A	L	T	M	S	A	K	D	P	L	L	N	I	G	G	L	V	A	I	R	D	N	E	E	I	F	T	L	A	R	Q	R	C	V	P	M	E	G	F	V	T	Y	G	G	L	A	G	R	D	M	A	A	M	V	Q	G	L	E	E	G	T	E	E	E	Y
Template Known Secondary structure												G	G	G		S												S	S							S	S																T		S	T	T	T	T	T																T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		244	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.
		292	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.								.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																										.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																										.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	I	Y	L	K	D	N	L	T	Y	I	A	D	K	M	N	A	A	F	P	E	L	N	W	Q	I	P	Q	S	T	Y	L	A	W	L	D	L	R	P	L	.	.	.	.	.	.	.	N	I	D	D	N	A	L	Q	K	A	L	I	E	Q	E	K	V	A	I	M	P	G	Y	T	Y	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																										.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																				.	.																					.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																				.	.
Template Sequence		L	H	Y	R	I	G	Q	V	K	Y	L	G	D	R	L	R	E	A	.	.	G	I	P	I	Q	Y	P	T	G	G	H	A	V	F	V	D	C	K	K	L	V	P	Q	I	P	G	D	Q	F	P	A	Q	A	V	I	N	A	L	Y	L	E	S	G	V	R	A	V	E	I	G	S	F	L	L	G	R	D	P	A	T
Template Known Secondary structure																			T	.	.	T			B		S	S			S	S						S	T	T	T		T	T	S		G	G	G																						S						B		T	T	T
Template Predicted Secondary structure																				.	.
Template SS confidence
		325	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.			.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.
					357	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370				.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390
Predicted Secondary structure		.	.	.															.	.	.
Query SS confidence		.	.	.															.	.	.
Query Sequence		.	.	.	G	E	E	G	R	G	F	V	R	L	N	A	G	C	.	.	.	P	R	S	K	L	E	K	G	V	A	G	L	I	N	A	I	R	A	V	R
Query Conservation		.	.	.															.	.	.
Alig confidence		.	.	.															.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	E	Q	K	H	A	D	M	E	F	M	R	L	T	I	A	R	R	V	Y	T	N	D	H	M	D	Y	I	A	D	A	L	I	G	L	K	E	K	F	A
Template Known Secondary structure			S	B				S										T	T	S	S														T	T					T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		403	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.