![]() |
|
![]() |
  | Insertion relative to template |
  | Deletion relative to template |
  | Catalytic residue from the CSA |
  | |
Detailed help on interpreting your alignment |
  |   | 168 | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | ||||||
Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Query Sequence |   | R | V | C | T | L | G | E | R | C | H | V | A | S | N | G | D | L | V | Q | I | A | S | F | G | A | N | A | R | I | A | N | S | G | D | N | V | H | I | I | A | S | G | E | N | S | T | V | V | S | T | G | V | V | D | S | I | I | L | G | P | G | G | S | A | A | L | A | Y | H | D | G | E | R | . | . | . | . | . | . | V |
Template Sequence |   | V | G | G | L | K | G | N | V | S | I | A | A | G | V | T | V | E | N | A | I | G | G | S | G | S | D | L | L | I | G | N | D | V | A | N | V | L | K | G | G | A | G | N | D | I | L | Y | G | G | L | G | A | D | . | . | Q | L | W | G | G | A | G | A | D | T | F | V | Y | G | D | I | A | E | S | S | A | A | A | P | D |
Template Known Secondary structure |   | T | T | B | S | ![]() | ![]() | ![]() | T | T | ![]() | ![]() | ![]() | S | S | ![]() | ![]() | ![]() | S | S | ![]() | ![]() | ![]() | S | S | ![]() | ![]() | ![]() | S | S | . | . | ![]() | ![]() | ![]() | S | S | ![]() | ![]() | ![]() | S | S | G | G | G | G | S | S | S | ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||
Template Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | . | . | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | 313 | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 340 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 350 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 360 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 370 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 380 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 390 | ||
  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | 242 | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Query Sequence |   | R | F | A | V | A | I | E | G | E | N | N | I | R | A | G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Template Sequence |   | T | L | R | D | F | V | S | G | Q | D | K | I | D | L | S | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Template Known Secondary structure |   | ![]() | ![]() | T | T | T | T | T | ![]() | ![]() | ![]() | T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Template Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | 391 | . | . | . | . | . | . | . | . | 400 | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |
Download: | Text version | FASTA pairwise alignment | 3D Model in PDB format |
Phyre is for academic use only
Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server | ||||||||
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX] | ||||||||
  | ||||||||
|
|