Job Description P42640 Confidence 99.41% Date Thu Jan 5 12:02:01 GMT 2012 Rank 25 Aligned Residues 251 % Identity 18% Template c2d1gB_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: B: PDB Molecule:acid phosphatase; PDBTitle: structure of francisella tularensis acid phosphatase a (acpa) bound to2 orthovanadate Resolution 1.75 Å

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		204	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.		.	.	240	.	.
Predicted Secondary structure																																				.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																				.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	S	I	A	N	T	V	P	Y	F	Q	L	S	V	R	D	T	G	I	D	T	Y	V	L	I	V	G	E	S	V	R	V	D	N	.	M	S	L	Y	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																				.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																				.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	D	Y	Q	K	L	F	N	N	A	N	T	L	K	T	T	T	P	I	K	H	V	V	I	I	F	Q	E	N	N	S	F	D	R	Y	F	G	M	Y	P	N	A	K	N	P	E	G	E	P	K	F	V	A	K	E	N	T	P	N	V	N	G	L	T	K	Q	L	L	E	N	N	P	N	T	K	N	P	Y	R	L
Template Known Secondary structure						B					G	G	G	S			S	S	S											S								T	T	T	T						T	T	S							T	T					S									S		S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		9	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.
																																											243	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.		270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	T	R	S	T	T	P	Q	V	E	A	Q	R	K	Q	I	K	L	F	N	Q	A	I	S	G	A	P	.	Y	T	A	L	S	V	P	L	S	L	T
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.
Template Conservation
Template Sequence		D	R	N	F	Q	P	C	S	Q	N	H	E	Y	H	Q	E	I	S	S	F	N	G	G	L	M	N	K	F	V	E	H	G	G	C	D	G	Q	V	M	G	Y	Y	D	G	N	T	V	T	A	L	W	N	Y	A	Q	N	F	A	L	N	D	N	T	F	G	T	T	F	G	P	S	T	P	G	A	L	N	L	V	A
Template Known Secondary structure			T	T	S																	G	G	G	T											T	T	G	G	G					T	T	T	S										S				S	S				S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		96	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.
		281	.	.	.	.	.	.	.	.	290																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.
Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	D	S	V	L	S	H	D	I	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	Y	P	D	N	I	I	N	M	A	N	Q	A	G	F	Q	T	F	W	L	S	S	Q	S	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	A	N	G	P	A	M	S	P	S	G	N	L	E	N	I	E	N	N	Y	I	I	D	D	P	N	P	Y	Y	D	D	C	S	Y	G	T	S	K	S	G	D	T	N	T	A	V	A	K	I	T	D	G	Y	N	I	G	H	Y	L	T	Q	K	G	I	T	W	G	W	F	Q	G	G	F	K	P	T	S	Y	S	G
Template Known Secondary structure		S				S				T	T		S	T	T	T			T	T				S					S	S		G	G	G	S	T	T	S	T	T	S		T	T	S							S												T								T	T		S		S				T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		185	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.
																															315	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	F	R	Q	N	G	T	A	V	T	S	I	A	M	R	A	M	E	T	V	Y	V	R	G	F	D	E	L	L	L	P	H	L	S	Q	A	L	Q	Q	N	T	Q	Q	K	K	L	I	V	L	H	L
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																									.
Template Conservation																																																																							.
Template Sequence		K	T	A	I	C	D	A	M	S	T	N	K	F	G	V	K	S	R	D	Y	I	P	H	H	E	P	F	N	Y	W	K	E	T	S	N	P	H	H	L	A	P	S	D	D	K	Y	I	G	S	N	D	Q	A	N	H	Q	Y	D	I	S	E	F	W	K	A	L	D	Q	N	.	N	M	P	A	V	S	Y	L	K	A
Template Known Secondary structure		T											T	T	S					S			G	G	G		G	G	G	G	S	S	T	T			T	T					S		G	G	G	T	T	S	B	S	T	T	T	T				T									T	T	.				S
Template Predicted Secondary structure																																																																							.
Template SS confidence
		265	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.		.	.	.	.	.	.	340	.	.	.
		366	.				.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.					.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.
Predicted Secondary structure				.	.	.																																															.	.	.	.																						.	.	.	.
Query SS confidence				.	.	.																																															.	.	.	.																						.	.	.	.
Query Sequence		N	G	.	.	.	S	H	E	P	A	C	S	A	Y	P	Q	S	S	A	V	F	Q	P	Q	D	D	Q	D	A	C	Y	D	N	S	I	H	Y	T	D	S	L	L	G	Q	V	F	E	L	L	K	D	.	.	.	.	R	R	A	S	V	M	Y	F	A	D	H	G	L	E	R	D	P	T	K	K	N	.	.	.	.
Query Conservation				.	.	.																																															.	.	.	.																						.	.	.	.
Alig confidence				.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.																						.	.	.	.
Template Conservation														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	G	Y	Q	D	G	H	G	G	Y	S	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	L	D	E	Q	E	W	L	V	N	T	I	N	R	I	Q	Q	S	K	D	W	D	S	T	A	I	I	I	I	Y	D	D	S	D	G	D	Y	D	H	V	Y	S	P	K	S	Q
Template Known Secondary structure			G	G	G	S			T	T	T			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		S	T	T	G	G	G								S			T	T											T
Template Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		344	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.
								435	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	V	Y	F	H	G	G	R	E	A	S	Q	Q	A	Y	H	V	P	M	F	I	W	Y	S	P	V	L	G	D	G	V	D	R	T	T	E	N	N	I	F	S	T	A	Y	N	N	Y	L	I	N	A	W	M	G	V	T
Query Conservation		.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.
Template Conservation													.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.
Template Sequence		F	S	D	I	K	G	R	Q	G	Y	G	.	.	.	.	.	.	.	.	P	R	L	P	M	L	V	I	S	P	Y	A	K	A	N	.	.	.	.	Y	V	D	H	S	L	L	N	Q	A	S	V	L	K	F	I	E	Y	N	W	G	I	G
Template Known Secondary structure		T	T	T	S	T	T						.	.	.	.	.	.	.	.		B							S	T	T	B		S	S	.	.	.	.									T												T
Template Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.
Template SS confidence
		402	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.									.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.					.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450