Job Description P37906 Confidence 99.52% Date Thu Jan 5 11:57:45 GMT 2012 Rank 57 Aligned Residues 379 % Identity 18% Template c1s3bB_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: B: PDB Molecule:amine oxidase [flavin-containing] b; PDBTitle: crystal structure of maob in complex with n-methyl-n-2 propargyl-1(r)-aminoindan Resolution 1.65 Å

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		27	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.											.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.
Predicted Secondary structure																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.
Query SS confidence																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.
Query Sequence		T	C	D	V	C	V	V	G	G	G	Y	T	G	L	S	S	A	L	H	L	A	E	A	G	F	D	V	V	V	L	E	A	S	R	I	G	F	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	S	G	R	N	G	G	Q	L	V	N	S	Y	S	R	D	I	D	V	I	E	K	S	Y	G	M	D	.	.	.	.	.
Query Conservation																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.
Alig confidence																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	C	D	V	V	V	V	G	G	G	I	S	G	M	A	A	A	K	L	L	H	D	S	G	L	N	V	V	V	L	E	A	R	D	R	V	G	G	R	T	Y	T	L	R	N	Q	K	V	K	Y	V	D	L	G	G	S	Y	V	G	P	T	Q	N	R	I	L	R	L	A	K	E	L	G	L	E	T	Y	K	V	N
Template Known Secondary structure		B		S							B													T	T								S	S	S	S	S	B	T	T							T	T	T					S	S						T	T											T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		4	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.
																									92	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	A	R	M	L	G	S	M	M	F	E	G	G	E	I	I	R	E	R	I	K	R	Y	Q	I	D	C	D	Y	R	P	G	G	L	F	V	A	M	N	D	K	Q	L	A	T	L	E	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	V	E	R	L	I	H	H	V	K	G	K	S	Y	P	F	R	G	P	F	P	P	V	W	N	P	I	T	Y	L	D	H	N	N	F	W	R	T	M	D	D	M	G	R	E	I	P	S	D	A	P	W	K	A	P	L	A	E	E	W	D	N	M	T	M	K	E	L	L	D	K	L	C	W	T	E	S	A	K	Q
Template Known Secondary structure			S	S							T	T							S	S	S					S																			T	T	S		T	T		G	G	G	S	T	T						T	S	B										S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		84	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.
						140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	Q	K	E	N	W	E	R	Y	G	N	K	Q	L	E	L	L	D	A	N	A	I	R	R	E	V	A	S	D	R	Y	T	G	A	L	L	D	H	S	G	G	H	I	H	P	L	N	L	A	I	G	E	A	D	A	I	R	L	N	G	G	R	V	Y	E	L	S	A	V	T	Q	I	Q	H	T	T	P
Query Conservation		.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	A	T	L	F	V	N	L	C	V	T	A	E	T	H	E	V	S	A	L	W	F	L	W	Y	V	K	Q	C	G	G	T	T	R	I	I	S	T	T	N	G	G	Q	E	R	K	F	V	G	G	S	G	Q	V	S	E	R	I	M	D	L	L	G	D	R	V	K	L	E	R	P	V	I	Y	I	D	Q	T	R	E
Template Known Secondary structure												S	S		T	T	T	S	B										T	T	T								S	T	T	S	T	T	S				T	T		T												G	G	G			S	S									S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		164	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.
		216	.	.	.	220			.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250									.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure							.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence							.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	V	V	R	T	.	.	A	K	G	Q	V	T	A	K	Y	V	I	V	A	G	N	A	Y	L	G	D	K	V	E	P	E	L	A	K	R	S	.	.	.	.	.	.	.	.	M	P	C	G	T	Q	V	I	T	T	E	R	L	S	E	D	L	A	R	S	L	I	P	K	N	Y	C	V	E	D	C	N	Y	L	L
Query Conservation							.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence							.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	V	L	V	E	T	L	N	H	E	M	Y	E	A	K	Y	V	I	S	A	I	P	P	T	L	G	M	K	I	H	F	N	P	P	L	P	M	M	R	N	Q	M	I	T	R	V	P	L	G	S	V	I	K	C	I	V	Y	Y	K	E	P	F	W	R	K	K	D	Y	C	G	T	M	I	I	D	G	E	E	A	P
Template Known Secondary structure		S						T	T	S						S						S		G	G	G	G	G	G	S				S										T	T	S			B											S	S		G	G	G	G	G	T									S	S	S		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		244	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.
		286	.	.	.	290	.	.	.	.											.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.
Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																													.
Query SS confidence											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																													.
Query Sequence		D	Y	Y	R	L	T	A	D	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	L	L	Y	G	G	G	V	V	Y	G	A	R	D	P	D	D	V	E	R	L	V	V	P	K	L	L	K	T	F	P	Q	L	K	G	V	K	I	D	Y	R	W	T	G	N	F	L	L	T	L	S	R	M	P	Q	F	G	R	L	D	.
Query Conservation											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																													.
Alig confidence											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																													.
Template Conservation
Template Sequence		V	A	Y	T	L	D	D	T	K	P	E	G	N	Y	A	A	I	M	G	F	I	L	A	H	K	A	R	K	L	A	R	L	T	K	E	E	R	L	K	K	L	C	E	L	Y	A	K	V	L	G	S	L	E	A	L	E	P	V	H	Y	E	E	K	N	W	C	E	E	Q	Y	S	G	G	C	Y	T	T	Y	F	P
Template Known Secondary structure			S								T	T	S		S									T							T	T	S																		T		G	G	G	G			S							G	G	G		T	T	T		S	S	S		B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		324	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.
																	355	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.					.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	N	I	Y	Y	M	Q	G	Y	S	G	H	G	.	.	.	.	V	T	C	T	H	L	A	G	R	L	I	A	E	L	L	R	G	D	A	E	R	F	D	A	F	A	N	L	P	H	Y	P	F	P	G	G	R	T
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	G	I	L	T	Q	Y	G	R	V	L	R	Q	P	V	D	R	I	Y	F	A	G	T	E	T	A	T	H	W	S	G	Y	M	E	G	A	V	E	A	G	E	R	A	A	R	E	I	L	H	A	M	G	K	I	P	E	D	E	I	W	Q	S	E	P	E	S	V	D	V	P
Template Known Secondary structure		T	T						G	G	G	T	T			B	T	T					S	G	G	G		S	S	S	T	T	S																			T	T	S	S		G	G	G	S	S							S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		404	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.