Job Description P33913 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:52:42 GMT 2012 Rank 18 Aligned Residues 459 % Identity 17% Template c3rqtA_ PDB info PDB header:unknown function Chain: A: PDB Molecule:putative uncharacterized protein; PDBTitle: 1.5 angstrom crystal structure of the complex of ligand binding2 component of abc-type import system from staphylococcus aureus with3 nickel and two histidines Resolution 1.50 Å

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		53	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	G	Q	I	T	L	S	A	L	G	T	F	D	N	F	N	R	Y	A	L	R	G	N	P	G	A	R	T	E	Q	L	Y	D	T	L	F	T	T	S	D	D	E	P	G	S	Y	Y	P	L	I	A	E	S	A	R	Y	A	D	D	Y	S	W	V	E	V	A	I	N	P	R	A	R	F	H	D	G	S	P	I	T
Query Conservation
Alig confidence																							.	.	.																		.	.															.
Template Conservation																							.	.	.																		.	.															.
Template Sequence		G	K	D	L	N	I	S	L	P	L	K	T	K	S	I	A	P	Y	E	T	D	.	.	.	V	P	V	K	I	G	A	A	E	S	L	F	K	T	N	D	Q	.	.	G	K	I	E	K	A	L	V	K	S	Y	H	Q	P	.	N	D	T	T	L	D	I	E	L	K	D	N	I	K	F	Q	N	G	Q	K	L	T
Template Known Secondary structure										S	S			S				T	T	T		S	.	.	.					T	T	S		B		S					T	T	.	.	S					S	S								.		T	T								S	S		B		T	T	S		B
Template Predicted Secondary structure																							.	.	.																		.	.															.
Template SS confidence
		5	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.				.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.			.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.		.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.
		133	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	R	D	V	E	F	T	F	Q	K	F	M	T	E	G	V	P	Q	F	R	L	V	Y	K	G	T	T	V	K	A	I	A	P	L	T	V	R	I	E	L	A	K	P	G	K	E	D	M	L	S	L	F	S	L	P	V	F	P	E	K	Y	W	K	D	H	K	L	S	D	P	L	A	T	P	P	L	A	S	G	P
Query Conservation
Alig confidence																.	.																																																							.	.	.	.
Template Conservation																.	.																																																							.	.	.	.
Template Sequence		A	E	K	V	K	S	S	L	E	N	S	X	K	K	.	.	S	D	L	V	K	Y	S	L	P	I	S	S	I	T	A	K	G	Q	K	L	T	I	K	T	N	S	A	Y	P	E	L	V	S	E	L	A	N	P	F	X	A	I	Y	D	T	D	A	K	S	D	V	N	Q	T	.	.	.	.	P	V	G	T	G	P
Template Known Secondary structure																.	.																	T	T							S	S			T	T					T	T	S	G	G	G		B			T	T		S	S		T	T	T	S	.	.	.	.				S	S	S
Template Predicted Secondary structure																.	.																																																							.	.	.	.
Template SS confidence
		79	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.			.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.					.	.	.	150	.	.
		213	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	R	V	T	S	W	K	M	G	Q	N	I	V	Y	S	R	V	K	D	Y	W	A	A	N	L	P	V	N	R	G	R	W	N	F	D	T	I	R	Y	D	Y	Y	L	D	D	N	V	A	F	E	A	F	K	A	G	A	F	D	L	R	M	E	N	D	A	K	N	W	A	T	R	Y	T	G	K	N	F	D	K	K
Query Conservation
Alig confidence																							.	.	.	.	.	.	.																																																		.	.	.
Template Conservation																							.	.	.	.	.	.	.																																																		.	.	.
Template Sequence		Y	Q	I	K	D	Y	K	Q	S	R	K	I	S	L	S	N	F	K	D	Y	W	.	.	.	.	.	.	.	Q	G	K	P	K	L	D	H	I	T	V	T	Y	Q	E	D	G	N	N	R	V	R	N	L	E	S	Q	K	D	D	L	I	T	D	V	P	V	N	K	V	Q	D	I	E	N	N	Q	N	L	.	.	.
Template Known Secondary structure									T	T	T								T	T		T	.	.	.	.	.	.	.	T	S			S		S																			T	T	S		S				S			G	G	G								T	T		.	.	.
Template Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.	.	.																																																		.	.	.
Template SS confidence
		153	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.								.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.
		293	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	I	I	K	D	E	Q	K	N	E	S	A	Q	D	T	R	W	L	A	F	N	I	Q	R	P	V	F	S	D	R	R	V	R	E	A	I	T	L	A	F	D	F	E	W	M	N	K	A	L	F	Y	N	A	W	S	R	T	N	S	Y	F	Q	N	T	E	Y	A	A	R	N	Y	P	D	A	A	E	L	V	L	L
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.																				.																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.																				.																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	K	V	S	K	E	S	G	F	R	T	S	L	L	X	Y	N	H	T	N	.	K	K	X	T	K	S	V	R	E	A	L	D	H	I	I	D	R	Q	G	I	A	D	H	I	Y	Q	G	Y	A	K	P	A	T	S	P	F	N	D	K	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.																	T	T	S	.	T	T																						T	S	T	T	S					S	S	S	S		T	T	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.																				.																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
							223	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.		.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.
		373	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	P	M	K	K	D	L	P	S	E	V	F	T	Q	I	Y	Q	P	P	V	S	K	G	D	G	Y	D	R	D	N	L	L	K	A	D	K	L	L	N	E	A	G	W	V	L	K	G	Q	Q	R	V	N	A	T	T	G	Q	P	L	S	F	E	L	L	L	P	A	S	S	N	S	Q	W	V	L	P	F	Q	H	S
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	Y	I	K	E	P	K	L	T	K	Q	N	I	E	Q	A	K	X	L	L	A	K	D	G	Y	T	K	E	.	.	.	.	.	.	.	.	H	P	L	K	I	K	L	I	T	Y	D	G	R	P	E	L	S	K	I	A	Q	V	L	Q	S	D
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T																				T	T	T			S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	S										S	S	S	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																				282	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.									310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.
		453	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.		470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.
Predicted Secondary structure																			.
Query SS confidence																			.
Query Sequence		L	Q	R	L	G	I	N	M	D	I	R	K	V	D	N	S	Q	.	I	T	N	R	M	R	S	R	D	Y	D	M	M	P	R	V	W	R	A	M	P	W	P	S	S	D	L	Q	I	S	W	S	S	E	Y	I	N	S	T	Y	N	A	P	G	V	Q	S	P	V	I	D	S	L	I	N	Q	I	I	A	A	Q	G
Query Conservation																			.
Alig confidence																			.																																			.	.	.																									.
Template Conservation																																																						.	.	.																									.
Template Sequence		A	K	K	A	N	I	E	I	D	I	K	S	V	D	D	I	E	G	Y	L	K	D	R	S	A	W	D	A	T	X	Y	S	F	G	T	I	P	R	G	D	T	G	Y	F	F	N	Q	A	Y	K	K	D	.	.	.	G	A	I	N	K	G	D	Y	N	N	S	N	V	D	D	L	I	N	Q	L	N	H	T	V	.
Template Known Secondary structure				T	T	T									S						T	T		T	T	S		S								S		T	T	S		T								T	S	T	T	.	.	.		T	T		T	T																T			.
Template Predicted Secondary structure																																																						.	.	.																									.
Template SS confidence
		336	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.				.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.
		532	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	K	E	K	L	L	P	L	G	R	A	L	D	R	V	L	T	W	N	Y	Y	M	L	P	M	W	Y	M	A	E	D	R	L	A	W	W	D	K	F	S	Q	P	A	V	R	P	I	Y	S	L	G	I	D	T
Query Conservation
Alig confidence																																	.
Template Conservation																																	.
Template Sequence		D	V	K	E	R	H	N	I	S	N	D	I	I	K	L	S	S	R	D	V	P	N	S	Y	I	A	Y	N	D	Q	I	.	V	A	A	N	S	K	V	K	N	Y	K	V	T	P	E	G	I	Y	L	I	D	Y
Template Known Secondary structure																						S											.					T	T								T	T	S						T
Template Predicted Secondary structure																																	.
Template SS confidence
		412	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.		.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.