Job Description P0AAF1 Confidence 98.50% Date Thu Jan 5 11:12:44 GMT 2012 Rank 6 Aligned Residues 418 % Identity 13% Template d2a65a1 SCOP info SNF-like SNF-like SNF-like Resolution 1.65

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Show / Hide Conservation and Alignment quality

		10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.		.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.					.	.
Predicted Secondary structure																			.																																																									.	.	.	.
Query SS confidence																			.																																																									.	.	.	.
Query Sequence		G	V	V	Q	L	T	I	L	T	M	V	N	M	M	G	S	G	.	I	I	M	L	P	T	K	L	A	E	V	G	T	I	S	I	I	S	W	L	V	T	A	V	G	S	M	A	L	A	W	A	F	A	K	C	G	M	F	S	R	K	S	G	G	M	G	G	Y	A	E	Y	A	F	G	K	.	.	.	.	S	G
Query Conservation																			.																																																									.	.	.	.
Alig confidence																			.																																																									.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	R	L	G	L	I	L	A	M	A	G	N	A	V	G	L	G	N	F	L	R	F	P	V	Q	A	A	E	N	G	G	G	A	F	M	I	P	Y	I	I	A	F	L	L	V	G	I	P	L	M	W	I	E	W	A	M	G	R	Y	G	G	A	Q	G	H	G	T	T	P	A	I	F	Y	L	L	W	R	N	R	F
Template Known Secondary structure															S	S					T									T	T	T														T																	T	T	T			S									S		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		85	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.																																										.	.
Predicted Secondary structure																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		N	F	M	A	N	Y	T	Y	G	V	S	L	L	I	A	N	V	A	I	A	I	S	A	V	G	Y	G	T	E	L	L	G	A	S	L	S	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	Q
Query Conservation																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	K	I	L	G	V	F	G	L	W	I	P	L	V	V	A	I	Y	Y	V	Y	I	E	S	W	T	L	G	F	A	I	K	F	L	V	G	L	V	P	E	P	P	P	T	D	P	D	S	I	L	R	P	F	K	E	F	L	Y	S	Y	I	G	V	P	K	G	D	E	P	I	L	K	P	S	L	F	A	Y	I	V
Template Known Secondary structure							T																														T																										T			S	S	S	S		B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		124	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.					170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																.	.	.	.
Query SS confidence																																																.	.	.	.
Query Sequence		I	G	L	A	T	I	G	V	L	W	I	C	T	V	A	N	F	G	G	A	R	I	T	G	Q	I	S	S	I	T	V	W	G	V	I	I	P	V	V	G	L	C	I	I	G	W	.	.	.	.	F	W	F	S	P	T	L	Y	V	D	S	W	N	P	H	H	A	P	F	F	S	A	V	G	S	S	I	A	M	T
Query Conservation																																																.	.	.	.
Alig confidence																																																.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	L	I	T	M	F	I	N	V	S	I	L	I	R	G	I	S	K	G	I	E	R	F	A	K	I	A	M	P	T	L	F	I	L	A	V	F	L	V	I	R	V	F	L	L	E	T	P	N	G	T	A	A	D	G	L	N	F	L	W	T	P	D	F	E	K	L	K	D	P	G	V	W	I	A	A	V	G	Q	I
Template Known Secondary structure														T	T		T	T	T	T																								T	T				T	T												S			T	T	S	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		172	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.
		200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.												.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	W	A	F	L	G	L	E	S	A	C	A	N	T	D	V	V	E	N	P	E	R	N	V	P	I	A	V	L	G	G	T	L	G	A	A	V	I	Y	I	V	S	T	N	V	I	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	I	V	P	N	M	E	L	A	N	S	T	A	P	F	G	L	A	F	A	Q	M
Query Conservation																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	F	T	L	S	L	G	F	G	A	I	I	T	Y	A	S	Y	V	R	K	D	Q	D	I	V	L	S	G	L	T	A	A	T	L	N	E	K	A	E	V	I	L	G	G	S	I	S	I	P	A	A	V	A	F	F	G	V	A	N	A	V	A	I	A	K	A	G	A	F	N	L	G	F	I	T	L	P	A	I	F
Template Known Secondary structure						T	T	T	S	S							T	T	S		T	T	S																			T	T																										S	S					T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		252	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.
		269	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	T	P	E	V	G	K	V	I	M	A	L	M	V	M	S	C	C	G	S	L	L	G	W	Q	F	T	I	A	Q	V	F	K	S	S	S	D	E	G	Y	F	P	K	I	F	S	R	V	T	K	V	D	A	P	V	Q	G	M	L	T	I	V	I	I	Q	S	G	L	A	L	M	T	I	S	P	S	L	N	S	Q
Query Conservation
Alig confidence																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	Q	T	A	G	G	T	F	L	G	F	L	W	F	F	L	L	F	F	A	G	L	T	S	S	I	A	I	M	Q	P	M	I	A	F	L	E	D	E	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	L	S	R	K	H	A	V	L	W	T	A	A	I	V	F	F	S	A	H	L	V	M	F	L	N	K	S	L	D	E
Template Known Secondary structure		T	T	S	T	T																																		T	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									B	T	T
Template Predicted Secondary structure																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		332	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.										.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.
		349	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.												.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.												.	.
Predicted Secondary structure																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		F	N	V	L	V	N	L	A	V	V	T	N	I	I	P	Y	I	L	S	M	A	A	L	V	I	I	Q	K	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	N	V	P	P	S	K	A	K	V	A	N	F	V	A	F	V	G	A	M	Y	S	F	Y	A	L	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S
Query Conservation																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		M	D	F	W	A	G	T	I	G	V	V	F	F	G	L	T	E	L	I	I	F	F	W	I	F	G	A	D	K	A	W	E	E	I	N	R	G	G	I	I	K	V	P	R	I	Y	Y	Y	V	M	R	Y	I	T	P	A	F	L	A	V	L	L	V	V	W	A	R	E	Y	I	P	K	I	M	E	E	T	H	W	T
Template Known Secondary structure						T	T	T																T	T	S											T	T		S	S				T								T																	T							S	S		T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		403	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.
		407	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	E	E	A	M	L	Y	G	S	I	V	T	F	L	G	W	T	L	Y	G	L	V	S	P	R	F	E	L	K	N
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		V	W	I	T	R	F	Y	I	I	G	L	F	L	F	L	T	F	L	V	F	L	A	E	R	R	R	N	H	E	S
Template Known Secondary structure
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		483	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.