Job Description P31434 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:47:24 GMT 2012 Rank 8 Aligned Residues 557 % Identity 22% Template c3ffjA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:glycosyl hydrolase (family 31); PDBTitle: the crystal structure of the glycosyl hydrolase (family 31) from2 ruminococcus obeum atcc 29174 Resolution 1.94 Å

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		146	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.				.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.			.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220
Predicted Secondary structure																																													.	.	.														.	.
Query SS confidence																																													.	.	.														.	.
Query Sequence		Q	R	N	Y	M	F	E	R	L	D	L	G	V	G	E	T	V	Y	G	L	G	E	R	F	T	A	L	V	R	N	G	Q	T	V	E	T	W	N	R	D	G	G	T	.	.	.	S	T	E	Q	A	Y	K	N	I	P	F	Y	M	.	.	T	N	R	G	Y	G	V	L	V	N	H	P	Q	C	V	S	F	E	V
Query Conservation																																													.	.	.														.	.
Alig confidence																																													.	.	.														.	.
Template Conservation
Template Sequence		Q	K	E	G	F	A	F	T	Y	I	X	D	E	D	D	I	V	Y	G	L	G	E	S	N	R	G	I	N	K	R	G	Y	C	Y	I	S	N	C	T	D	D	P	I	H	T	E	D	K	R	S	L	Y	G	A	H	N	F	I	I	V	S	G	K	T	T	F	G	L	F	F	D	Y	P	S	K	L	T	F	D	I
Template Known Secondary structure			T	T	S									T	T							S	S		S	S		S	S		T	T												S		G	G	G		S			S										S	S	S									S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		34	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.
		221	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	S	E	K	V	S	K	V	Q	F	S	V	E	S	E	Y	L	E	Y	F	V	I	D	G	P	T	P	K	A	V	L	D	R	Y	T	R	F	T	G	R	P	A	L	P	P	A	W	S	F	G	L	W	L	T	T	S	F	T	T	N	Y	D	E	A	T	V	N	S	F	I	D	G	M	A	E	R	N	L	P	L
Query Conservation
Alig confidence																																																													.	.
Template Conservation																																																													.	.
Template Sequence		G	Y	T	R	X	D	T	L	K	V	S	C	E	N	A	D	L	D	I	Y	V	I	E	G	E	N	A	Y	D	I	V	K	Q	F	R	R	V	I	G	R	S	Y	I	P	P	K	F	A	F	G	F	G	Q	S	R	W	G	Y	T	.	.	T	K	E	D	F	R	A	V	A	K	G	Y	R	E	N	H	I	P	I
Template Known Secondary structure		S	S	S	S	T	T							S	S											S	S																				G	G	G	G	S						T	T			.	.	S														T	T
Template Predicted Secondary structure																																																													.	.
Template SS confidence
		114	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.			.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.
		301	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.			.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																								.	.
Query SS confidence																																																								.	.
Query Sequence		H	V	F	H	F	D	C	F	W	M	K	A	F	Q	W	C	D	F	E	W	D	P	L	T	F	P	D	P	E	G	M	I	R	R	L	K	A	K	G	L	K	I	C	V	W	I	N	P	Y	I	G	Q	K	S	.	.	P	V	F	K	E	L	Q	E	K	G	Y	L	L	K	R	P	D	G	S	L	W	Q	W	D
Query Conservation																																																								.	.
Alig confidence																.	.																																							.	.
Template Conservation																.	.
Template Sequence		D	X	I	Y	X	D	I	D	Y	X	Q	D	F	K	.	.	D	F	T	V	N	E	K	N	F	P	D	F	P	E	F	V	K	E	X	K	D	Q	E	L	R	L	I	P	I	I	D	A	G	V	K	V	E	K	G	Y	E	V	Y	E	E	G	V	K	N	N	Y	F	C	K	R	E	D	G	S	D	F	V	A	A
Template Known Secondary structure								G	G	G	S	S	T	T		.	.	T	T				T	T	T		T	T										T	T	T									S						T	T										T	T		B		B		T	T	S		B
Template Predicted Secondary structure																.	.
Template SS confidence
		192	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.			.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		379	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Predicted Secondary structure																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	W	Q	P	G	L	A	I	Y	D	F	T	N	P	D	A	C	K	W	Y	A	D	K	L	K	G	L	V	A	M	G	V	D	C	F	K	T	D	F	G	E	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	W	P	G	D	T	H	F	P	D	X	L	N	P	E	A	R	K	W	F	G	D	K	Y	R	F	L	I	D	Q	G	I	E	G	F	W	N	D	X	N	E	P	A	I	F	Y	S	S	E	G	L	A	E	A	K	E	F	A	G	E	F	A	K	D	T	E	G	K	I	H	P	W	A	X	Q	A	K	X	K	D
Template Known Secondary structure			T	T						B		T	T	S										T	T					T	T	T								S	T	T	T			S																					S	S		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.
											421	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	P	T	D	V	Q	W	F	D	G	S	D	P	Q	K	M	H	N	H	Y	A	Y	I	Y	N	E	L	V	W	N	V	L	K	D	T	V	G	E	E	E	A	V	L	F	A	R	S	A	S	V	G	A	Q	K	F	P	V	H	W	G	G	D	C	Y	A	N	Y	E	S	M	A
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	V	N	S	P	E	D	Y	K	R	F	Y	H	N	V	N	G	K	K	I	R	H	D	K	V	H	N	L	F	G	Y	N	X	T	R	A	A	G	E	A	F	E	R	I	D	P	E	K	R	F	L	X	F	S	R	S	S	Y	I	G	X	H	R	Y	G	G	I	W	X	G	D	N	K	S	W	W	S	H	I	L
Template Known Secondary structure		T	T	T						T	S						T	T					G	G	G	G	G	G	G																		T	T								S	S			T	T	G	G	G	T									T	T		T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		492	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.			.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																					.	.
Query SS confidence																																																					.	.
Query Sequence		E	S	L	R	G	G	L	S	I	G	L	S	G	F	G	F	W	S	H	D	I	G	G	F	E	N	T	A	P	A	H	V	Y	K	R	W	C	A	F	G	L	L	S	S	H	S	R	L	H	G	S	.	.	K	S	Y	R	V	P	W	A	Y	D	D	E	S	C	D	V	V	R	F	F	T	Q	L	K	C	R	M
Query Conservation																																																					.	.
Alig confidence																																																					.	.										.	.
Template Conservation																																																																.	.
Template Sequence		L	N	L	K	X	L	P	S	L	N	X	C	G	F	X	Y	T	G	A	D	L	G	G	F	G	D	D	T	T	R	D	L	L	L	R	F	L	A	L	G	V	F	T	P	L	X	R	D	H	A	A	E	G	T	R	E	Q	E	C	Y	Q	F	.	.	E	N	I	E	D	F	R	S	V	I	N	A	R	Y	R	L
Template Known Secondary structure													T	T			S										T															T	T	S	S	S						S				S			S	T	T	S	S	.	.	S
Template Predicted Secondary structure																																																																.	.
Template SS confidence
		430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.			.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.
		570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.		.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.						640	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																								.																	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																								.																	.	.	.	.	.
Query Sequence		M	P	Y	L	Y	R	E	A	A	R	A	N	A	R	G	T	P	M	M	R	A	M	M	M	E	F	P	D	D	P	A	C	D	Y	L	D	R	Q	Y	M	L	G	D	N	V	M	V	A	P	V	F	T	E	A	.	G	D	V	Q	F	Y	L	P	E	G	R	W	T	H	L	W	.	.	.	.	.	H	N	D	E
Query Conservation																																																								.																	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																								.																	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	P	Y	L	Y	S	E	Y	X	K	A	A	L	N	D	D	X	Y	F	K	P	L	G	F	V	Y	P	D	D	K	X	A	I	R	V	E	D	Q	L	X	L	G	N	E	I	X	I	A	P	V	Y	E	Q	N	A	R	G	R	Y	V	Y	L	P	E	E	X	K	F	I	K	F	X	P	D	G	S	I	S	E	E
Template Known Secondary structure															T	T			S									T	T		T	T	G	G	G			S					T	T	T								S	T	T		S							S	S									T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		508	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.
		644	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	D	G	S	R	W	H	K	Q	Q	H	G	F	L	S	L	P	V	Y	V	R	D	N	T	L	L	A	L	G	N	N	D	Q	R	P	D	Y	V	W	H	E	G	T	A	F	H	L	F	N	L	Q	D	G	H	E	A	V	C	E	V	P	A	A	D	G	S	V	I	F	T
Query Conservation
Alig confidence																																																				.	.	.	.	.
Template Conservation																																																				.	.	.	.	.
Template Sequence		V	L	E	K	G	V	H	Y	V	D	V	A	L	N	E	V	P	L	F	I	R	S	G	K	C	I	P	V	A	E	A	A	E	C	V	K	D	I	D	T	E	N	X	Q	L	I	G	Y	E	G	.	.	.	.	.	S	S	Y	T	L	Y	E	D	D	G	I	H	K	D	Y
Template Known Secondary structure					S									T	T								T	T										S	S	G	G	G				T	T							T	T	.	.	.	.	.										S	S	S			T
Template Predicted Secondary structure																																																				.	.	.	.	.
Template SS confidence
		588	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.						.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.