Job Description P31434 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:47:24 GMT 2012 Rank 6 Aligned Residues 604 % Identity 24% Template c2g3nA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:alpha-glucosidase; PDBTitle: crystal structure of the sulfolobus solfataricus alpha-2 glucosidase mala in complex with beta-octyl-glucopyranoside Resolution 2.55 Å

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		100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.			.	.		.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																		.	.			.
Query SS confidence																		.	.			.
Query Sequence		Y	A	E	F	K	S	G	N	L	S	A	R	V	S	K	G	.	.	E	F	.	W	S	L	D	F	L	R	N	G	E	R	I	T	G	S	Q	V	K	N	N	G	Y	V	Q	D	T	N	N	Q	R	N	Y	M	F	E	R	L	D	L	G	V	G	E	T	V	Y	G	L	G	E	R	F	T	A	L	V	R	N	G
Query Conservation																		.	.			.
Alig confidence																		.	.			.																		.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																								.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	I	Y	E	N	K	G	V	Y	K	V	V	I	G	E	P	F	P	P	I	E	F	P	L	E	Q	K	I	S	S	N	K	S	L	S	E	L	G	.	.	.	.	.	.	L	T	I	V	Q	Q	G	N	K	V	I	V	E	K	S	L	D	L	K	E	H	I	I	G	L	G	E	K	A	F	E	L	D	R	K	R
Template Known Secondary structure							S	S							S	S				S	S					S				B		S			T	T	T	T	T	.	.	.	.	.	.							T	T										T	T							S	S		S	S		S	S			S
Template Predicted Secondary structure																																								.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		5	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.							.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.
		177	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.				.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.				.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250
Predicted Secondary structure														.	.	.															.	.	.
Query SS confidence														.	.	.															.	.	.
Query Sequence		Q	T	V	E	T	W	N	R	D	G	G	T	.	.	.	S	T	E	Q	A	Y	K	N	I	P	F	Y	M	T	.	.	.	N	R	G	Y	G	V	L	V	N	H	P	Q	C	V	S	F	E	V	G	S	E	K	V	S	K	V	Q	F	S	V	E	S	E	Y	L	E	Y	F	V	I	D	G	P	T	P	K	A	V
Query Conservation														.	.	.															.	.	.
Alig confidence														.	.	.															.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	R	Y	V	M	Y	N	V	D	A	G	A	Y	K	K	Y	Q	D	P	L	Y	V	S	I	P	L	F	I	S	V	K	D	G	V	A	T	G	Y	F	F	N	S	A	S	K	V	I	F	D	V	G	L	E	E	Y	D	K	V	I	V	T	I	P	E	D	S	V	E	F	Y	V	I	E	G	P	R	I	E	D	V
Template Known Secondary structure													S			T	T					S											T	T											S							S	S	S	S	T	T							S	S	S										S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		79	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.
		251	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	D	R	Y	T	R	F	T	G	R	P	A	L	P	P	A	W	S	F	G	L	W	L	T	T	S	F	T	T	N	Y	D	E	A	T	V	N	S	F	I	D	G	M	A	E	R	N	L	P	L	H	V	F	H	F	D	C	F	W	M	K	A	F	Q	W	C	D	F	E	W	D	P	L	T	F	P	D	P	E	G
Query Conservation
Alig confidence																															.	.																																		.	.
Template Conservation																															.	.																																		.	.
Template Sequence		L	E	K	Y	T	E	L	T	G	K	P	F	L	P	P	M	W	A	F	G	Y	M	I	S	R	Y	S	Y	Y	.	.	P	Q	D	K	V	V	E	L	V	D	I	M	Q	K	E	G	F	R	V	A	G	V	F	L	D	I	H	Y	M	D	S	Y	K	.	.	L	F	T	W	H	P	Y	R	F	P	E	P	K	K
Template Known Secondary structure																	G	G	G	G	S						T	T			.	.	S														T	T										G	G	G	S	B	T	T	B	.	.	T	T				T	T	T		S
Template Predicted Secondary structure																															.	.																																		.	.
Template SS confidence
		159	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.			.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220			.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.
		331	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	I	R	R	L	K	A	K	G	L	K	I	C	V	W	I	N	P	Y	I	G	Q	K	S	P	V	F	K	E	L	Q	E	K	G	Y	L	L	K	R	P	D	G	S	L	W	Q	W	D	K	W	Q	P	G	L	A	I	Y	D	F	T	N	P	D	A	C	K	W	Y	A	D	K	L	K	G	L	V	A	M	G	V
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		L	I	D	E	L	H	K	R	N	V	K	L	I	T	I	V	D	H	G	I	R	V	D	Q	N	Y	S	P	F	L	S	G	M	G	K	F	C	E	I	E	S	G	E	L	F	V	G	K	M	W	P	G	T	T	V	Y	P	D	F	F	R	E	D	T	R	E	W	W	A	G	L	I	S	E	W	L	S	Q	G	V
Template Known Secondary structure									T	T									S						T	T								T	T	S	B				T	T	S	S	B						T	T						B		T	T	S																T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		235	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.
		411	.	.	.	.	.	.	.	.	420																													.	.	.	.	.	.	.	.				.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.
Query SS confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.
Query Sequence		D	C	F	K	T	D	F	G	E	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	P	T	D	V	Q	W	F	.	.	.	D	G	S	D	P	Q	K	M	H	N	H	Y	A	Y	I	Y	N	E	L	V	W	N	V	L	K	D	T	V	G	E	E
Query Conservation												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.
Alig confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.																														.
Template Conservation																																																																																.
Template Sequence		D	G	I	W	L	D	M	N	E	P	T	D	F	S	R	A	I	E	I	R	D	V	L	S	S	L	P	V	Q	F	R	D	D	R	L	V	T	T	F	P	D	N	V	V	H	Y	L	R	G	K	R	V	K	H	E	K	V	R	N	A	Y	P	L	Y	E	A	M	A	T	F	K	G	F	R	T	S	H	R	.	N
Template Known Secondary structure								S	T	T	T	B												S	S	S	S	S							G	G	G	G	B			T	T						T	T									G	G	G																T	T		.	S
Template Predicted Secondary structure																																																																																.
Template SS confidence
		315	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.		.
		460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.							.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																												.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																												.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	A	V	L	F	A	R	S	A	S	V	G	A	Q	K	F	P	V	H	W	G	G	D	C	Y	A	N	Y	E	S	M	A	E	S	L	R	G	G	L	S	I	G	L	S	G	F	G	F	W	S	H	D	I	G	G	F	E	N	.	.	.	.	.	.	T	A	P	A	H	V	Y	K	R	W	C	A	F	G	L	L
Query Conservation																																																												.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																												.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	I	F	I	L	S	R	A	G	Y	A	G	I	Q	R	Y	A	F	I	W	T	G	D	N	T	P	S	W	D	D	L	K	L	Q	L	Q	L	V	L	G	L	S	I	S	G	V	P	F	V	G	C	D	I	G	G	F	Q	G	R	N	F	A	E	I	D	N	S	M	D	L	L	V	K	Y	Y	A	L	A	L	F
Template Known Secondary structure		S						S	S			T	T	G	G	G	T							S				S																T	T	T			S						T		S			S	S	S	S	S															T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		394	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.
		534	.	.	.	.	.	540	.			.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.
Predicted Secondary structure										.	.
Query SS confidence										.	.
Query Sequence		S	S	H	S	R	L	H	G	.	.	S	K	S	Y	R	V	P	W	A	Y	D	D	E	S	C	D	V	V	R	F	F	T	Q	L	K	C	R	M	M	P	Y	L	Y	R	E	A	A	R	A	N	A	R	G	T	P	M	M	R	A	M	M	M	E	F	P	D	D	P	A	C	D	Y	L	D	R	Q	Y	M	L	G
Query Conservation										.	.
Alig confidence										.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	P	F	Y	R	S	H	K	A	T	D	G	I	D	T	E	P	V	F	L	P	D	Y	Y	K	E	K	V	K	E	I	V	E	L	R	Y	K	F	L	P	Y	I	Y	S	L	A	L	E	A	S	E	K	G	H	P	V	I	R	P	L	F	Y	E	F	Q	D	D	D	D	M	Y	R	I	E	D	E	Y	M	V	G
Template Known Secondary structure			S								T	T	S					G	G	G	S																																				S									T	T		G	G	G	G	G			S					T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		474	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.
		612	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.				.	680	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																					.	.	.
Query SS confidence																																																																					.	.	.
Query Sequence		D	N	V	M	V	A	P	V	F	T	E	A	G	D	V	Q	F	Y	L	P	E	G	R	W	T	H	L	W	H	N	D	E	L	D	G	S	R	W	H	K	Q	Q	H	G	F	L	S	L	P	V	Y	V	R	D	N	T	L	L	A	L	G	N	N	D	Q	R	P	.	.	.	D	Y	V	W	H	E	G	T	A	F
Query Conservation																																																																					.	.	.
Alig confidence																																									.	.	.																										.	.	.
Template Conservation																																									.	.	.
Template Sequence		K	Y	L	L	Y	A	P	I	V	S	K	E	E	S	R	L	V	T	L	P	R	G	K	W	Y	N	Y	W	N	G	E	I	I	N	G	K	S	V	V	.	.	.	K	S	T	H	E	L	P	I	Y	L	R	E	G	S	I	I	P	L	E	G	D	E	L	I	V	Y	G	E	T	S	F	K	R	Y	D	N	A	E
Template Known Secondary structure		T	T								S	S	S	S								S	S					T	T	T						S	S				.	.	.				S	S	S						S	S						T	T	T						S	S						T	T	S
Template Predicted Secondary structure																																									.	.	.
Template SS confidence
		554	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.				.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630
		689	690	.	.	.	.	.																.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		H	L	F	N	L	Q	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	H	E	A	V	C	E	V	P	A	A	D	G	S	V	I	F	T	L	K	A	A
Query Conservation									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	T	S	S	S	N	E	I	K	F	S	R	E	I	Y	V	S	K	L	T	I	T	S	E	K	P	V	S	K	I	I	V	D	D	S	K	E	I	Q	V	E	K	T	M
Template Known Secondary structure						S	S					S	S												S	S								T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		631	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.