Job Description P38104 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:57:58 GMT 2012 Rank 60 Aligned Residues 361 % Identity 21% Template c3n6jA_ PDB info PDB header:isomerase Chain: A: PDB Molecule:mandelate racemase/muconate lactonizing protein; PDBTitle: crystal structure of mandelate racemase/muconate lactonizing protein2 from actinobacillus succinogenes 130z Resolution 2.40 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.															.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	I	V	K	A	E	V	F	V	T	C	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	R	N	F	V	T	L	K	I	T	T	E	D	G	I	T	G	L	G	D	A	T	L	N	G	R	E	L	S	V	A	S	Y	L	Q	D	H	L	C	P	Q	L	I	G	R	D	A	H	R	I	E	D	I	W
Query Conservation														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.
Template Conservation																																																			.	.	.	.
Template Sequence		V	I	T	D	X	K	V	I	P	V	A	G	H	D	S	X	L	X	N	V	G	G	A	H	S	P	Y	F	T	R	N	I	V	I	L	T	D	N	S	G	H	T	G	V	G	E	A	P	G	.	.	.	.	G	A	T	I	E	N	A	L	T	E	A	I	P	H	V	V	G	R	P	I	S	I	L	N	K	I	V
Template Known Secondary structure		B																B			T	T					S												T	T											.	.	.	.	S									T	T	G	G	G	T	T	T		B	G	G	G
Template Predicted Secondary structure																																																			.	.	.	.
Template SS confidence
		10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.					.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.
		68	.	70	.	.	.	.	.	.											.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110		.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	F	F	Y	K	G	A	Y	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	R	G	P	V	T	M	S	A	I	S	A	V	D	M	A	L	W	D	I	K	A	K	A	A	N	M	P	L	Y	Q	L	L	G	.	G	A	S	R	E	G	V	M	V	Y	C	H	T	T	G	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	D	X	H	N	G	Y	L	D	A	D	Y	D	T	F	G	K	G	A	W	T	F	E	L	R	V	N	A	V	A	A	L	E	A	A	L	L	D	L	X	G	Q	F	L	G	V	P	V	A	E	L	L	G	P	G	K	Q	R	D	E	V	T	V	L	G	Y	L	F	Y	V	G	D	D	K	I	T	D	L	P	Y
Template Known Secondary structure																			S			T	T	S	S	T																				T	S	B	G	G	G	T	S	T	T					S				B							B			G	G	G	S		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		86	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.
																					127	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.		.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	I	D	E	A	L	D	D	Y	A	R	H	Q	E	L	.	G	F	K	A	I	R	V	Q	C	G	I	P	G	M	K	T	T	Y	G	M	S	K	G	K	G	L	A	Y	E	P	A	T	K	G	Q	W	P	E	E	Q	L	W	S	T	E
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	Q	P	V	T	G	K	H	E	W	Y	D	I	R	R	K	K	A	X	D	T	Q	A	V	I	E	L	A	A	A	S	K	D	R	Y	G	F	K	D	F	K	L	K	G	G	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure							S	S							T	T	S		B		S																		S							S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		166	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.
		187	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.					.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.
Predicted Secondary structure																																																													.	.	.	.
Query SS confidence																																																													.	.	.	.
Query Sequence		K	Y	L	D	F	M	P	K	L	F	D	A	V	R	N	K	F	G	F	N	E	H	L	L	H	D	M	H	H	R	L	T	P	I	E	A	A	R	F	G	K	S	I	E	D	Y	R	M	F	W	M	E	D	P	T	P	A	E	N	.	.	.	.	Q	E	C	F	R	L	I	R	Q	H	T	V	T	P	I	A	V
Query Conservation																																																													.	.	.	.
Alig confidence																		.																														.													.	.	.	.
Template Conservation																		.																														.
Template Sequence		F	E	G	S	K	E	I	D	T	V	I	E	L	K	K	H	.	F	P	D	A	R	I	T	L	D	P	N	G	C	W	S	L	D	E	A	I	Q	L	C	K	G	L	N	D	V	.	L	T	Y	A	E	D	P	C	I	G	E	N	G	Y	S	G	R	E	I	X	A	E	F	R	R	R	T	G	I	P	T	A	T
Template Known Secondary structure		S																.		S	S	S							T	T	B	B										T	T		T	T	T	.		S				S		B			B	T	T	B
Template Predicted Secondary structure																		.																														.
Template SS confidence
		212	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.		.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.		.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		263	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	E	V	F	N	S	I	W	D	C	K	Q	L	I	E	E	Q	L	I	D	Y	I	R	T	T	L	T	H	A	G	G	I	T	G	M	R	R	I	A	D	F	A	S	L	Y	Q	V	R	T	G	S	H	G	P	S	D	L	S	P	V	C	M	A	A	A	L	H	F	D	L	W	V	P	N	F	G	V	Q	E	Y
Query Conservation
Alig confidence																												.																														.
Template Conservation																												.																														.
Template Sequence		N	X	I	A	T	N	W	R	E	X	C	H	A	I	X	L	Q	S	V	D	I	P	L	A	D	P	.	H	F	W	T	L	T	G	A	S	R	V	A	Q	L	C	N	E	W	G	L	T	W	G	C	H	S	N	N	H	.	F	D	I	S	L	A	X	F	S	H	V	G	A	A	A	P	G	N	P	T	A	L	D
Template Known Secondary structure		S	S	S			S											T			S			B				.																			T				B					S		.														T			S					B
Template Predicted Secondary structure																												.																														.
Template SS confidence
		290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.		.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.		.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.
		343	.	.	.	.	.	.	350	.			.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.						.	400	.	.	.	.
Predicted Secondary structure											.	.																																																.	.	.	.	.
Query SS confidence											.	.																																																.	.	.	.	.
Query Sequence		M	G	Y	S	E	Q	M	L	E	.	.	V	F	P	H	N	W	T	F	D	N	G	Y	M	H	P	G	D	K	P	G	L	G	I	E	F	D	E	K	L	A	A	K	Y	P	Y	E	P	A	Y	L	P	V	A	R	L	E	D	.	.	.	.	.	G	T	L	W	N	W
Query Conservation											.	.																																																.	.	.	.	.
Alig confidence											.	.																																																.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	H	W	I	W	Q	E	G	D	F	Y	L	T	K	N	P	L	E	I	K	D	G	K	I	K	L	N	D	K	P	G	L	G	I	E	L	N	X	D	N	V	L	K	A	H	E	L	H	K	K	L	P	N	G	A	R	N	D	A	I	P	X	Q	F	Y	Y	P	G	W
Template Known Secondary structure								T	T	T			S	B	S	S						T	T						S		S	B	T				B														T	S	S		S	S			T					T	T	T	S	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		368	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.