Job Description P38104 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:57:58 GMT 2012 Rank 67 Aligned Residues 341 % Identity 20% Template c3mznA_ PDB info PDB header:lyase Chain: A: PDB Molecule:glucarate dehydratase; PDBTitle: crystal structure of probable glucarate dehydratase from2 chromohalobacter salexigens dsm 3043 Resolution 1.85 Å

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		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.															.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	I	V	K	A	E	V	F	V	T	C	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	G	R	N	F	V	T	L	K	I	T	T	E	D	G	I	T	G	L	G	D	A	T	L	N	G	R	E	L	S	V	A	S	Y	L	Q	D	H	L	C	P	Q	L	I	G	R	D	A	H	R	I	E	D	I	W
Query Conservation													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.	.	.
Template Conservation																																																												.	.	.	.
Template Sequence		K	I	T	K	M	N	V	V	P	V	A	G	E	D	G	F	L	L	N	L	S	G	G	H	E	P	W	F	I	R	C	V	L	V	L	E	D	E	S	G	N	R	G	V	G	E	I	P	S	S	E	G	I	L	N	G	L	E	.	.	.	.	K	C	R	S	L	V	E	G	A	R	V	N	E	V	K	Q	V	L
Template Known Secondary structure		B																B			T	T					S												T	T	S																			.	.	.	.		T					T	T		B	G	G	G
Template Predicted Secondary structure																																																												.	.	.	.
Template SS confidence
		4	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.					.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		68	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.											.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110			.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.
Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	F	F	Y	K	G	A	Y	W	R	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	P	V	T	M	S	A	I	S	A	V	D	M	A	L	W	D	I	K	A	K	A	A	N	M	P	L	Y	Q	L	L	G	.	.	G	A	S	R	E	G	V	M	V	Y	C	H	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		S	R	A	R	G	L	L	A	Q	G	G	P	E	E	R	G	R	Q	T	F	D	L	R	V	A	V	H	V	I	T	A	I	E	S	A	L	F	D	L	F	G	Q	A	L	G	M	P	V	A	D	L	L	G	Q	Y	G	R	Q	R	D	E	V	E	A	L	G	Y	L	F	L	L	G	D	P	D	K	T	D	L	P
Template Known Secondary structure									G	G	G							S	S	S	S				S																					T		B	G	G	G	G	S	T	T	T					S				B							B			G	G	G	S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.
																				125	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.		.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	H	S	I	D	E	A	L	D	D	Y	A	R	H	Q	E	L	.	G	F	K	A	I	R	V	Q	C	G	I	P	G	M	K	T	T	Y	G	M	S	K	G	K	G	L	A	Y	E	P	A	T	K	G	Q	W	P	E	E	Q	L	W	S	T
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	P	R	V	A	D	P	V	D	A	W	D	E	V	R	Y	R	E	A	M	T	P	E	A	V	A	N	L	A	R	A	A	Y	D	R	Y	G	F	K	D	F	K	L	K	G	G	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure						S	S			S						T	T	S		B		S																		S							S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.
		186	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.					.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.
Predicted Secondary structure																																																															.	.	.	.
Query SS confidence																																																															.	.	.	.
Query Sequence		E	K	Y	L	D	F	M	P	K	L	F	D	A	V	R	N	K	F	G	F	N	E	H	L	L	H	D	M	H	H	R	L	T	P	I	E	A	A	R	F	G	K	S	I	E	D	Y	R	M	F	W	M	E	D	P	T	P	A	E	N	Q	.	.	.	.	E	C	F	R	L	I	R	Q	H	T	V	T	P	I	A
Query Conservation																																																															.	.	.	.
Alig confidence		.																		.																											.																.	.	.	.
Template Conservation		.																		.																											.
Template Sequence		.	L	R	G	E	E	E	A	D	C	I	R	A	L	H	E	A	F	.	P	E	A	R	L	A	L	D	P	N	G	A	W	K	L	D	E	A	V	R	V	L	E	P	I	K	.	H	L	L	S	Y	A	E	D	P	C	G	Q	E	G	G	F	S	G	R	E	T	M	A	E	F	K	K	R	T	G	L	P	T	A
Template Known Secondary structure		.	S																	.	T	T	S							T	T		B										G	G	G	G	.	G	G		S				S	S	B			B	T	T	B
Template Predicted Secondary structure		.																		.																											.
Template SS confidence
			207	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.		.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.		250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.
		262	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	G	E	V	F	N	S	I	W	D	C	K	Q	L	I	E	E	Q	L	I	D	Y	I	R	T	T	L	T	H	A	G	G	I	T	G	M	R	R	I	A	D	F	A	S	L	Y	Q	V	R	T	G	S	H	G	P	S	D	L	S	P	V	C	M	A	A	A	L	H	F	D	L	W	V	P	N	F	G	V	Q	E
Query Conservation
Alig confidence																													.																														.
Template Conservation																													.																														.
Template Sequence		T	N	M	I	A	T	D	Y	K	Q	L	Q	Y	A	V	Q	L	N	S	V	D	I	P	L	A	D	C	.	H	F	W	T	M	Q	G	A	V	A	V	G	E	L	C	N	E	W	G	M	T	W	G	S	H	S	N	N	H	.	F	D	I	S	L	A	M	M	T	H	V	A	A	A	C	P	G	E	I	T	A	I
Template Known Secondary structure			S	S	S	S	S	S											T			S			B				.																		T	T				B					S		.														T			S					B
Template Predicted Secondary structure																													.																														.
Template SS confidence
		284	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310		.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.		340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.
		342	.	.	.	.	.	.	.	350	.		.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.
Predicted Secondary structure												.
Query SS confidence												.
Query Sequence		Y	M	G	Y	S	E	Q	M	L	E	.	V	F	P	H	N	W	T	F	D	N	G	Y	M	H	P	G	D	K	P	G	L	G	I	E	F	D	E	K	L	A	A	K	Y
Query Conservation												.
Alig confidence												.
Template Conservation
Template Sequence		D	T	H	W	I	W	Q	D	G	Q	R	I	T	R	E	P	F	Q	I	R	D	G	K	L	T	V	P	K	T	P	G	L	G	I	E	L	D	D	D	K	L	M	E	A
Template Known Secondary structure									T	T			S	B	S	S					B	T	T							S	S	B	T	S			B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		362	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.