Job Description P22106 Confidence 99.78% Date Wed Jan 25 15:20:42 GMT 2012 Rank 19 Aligned Residues 184 % Identity 26% Template d1ea0a3 SCOP info Ntn hydrolase-like N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases) Class II glutamine amidotransferases Resolution 3.0

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		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.		.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.									.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.
Predicted Secondary structure																.																		.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																.																		.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		C	S	I	F	G	V	F	D	I	K	T	D	A	V	.	E	L	R	K	K	A	L	E	L	S	R	L	M	R	H	R	G	.	.	.	.	.	.	.	.	P	D	W	S	G	I	Y	A	S	D	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																.																		.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																.																		.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		C	G	V	G	F	I	A	A	I	D	G	K	P	R	R	S	V	V	E	K	G	I	E	A	L	K	A	V	W	H	R	G	A	V	D	A	D	G	K	T	G	D	G	A	G	I	H	V	A	V	P	Q	K	F	F	K	D	H	V	K	V	I	G	H	R	A	P	D	N	K	L	A	V	G	Q	V	F	L	P	R
Template Known Secondary structure										T	T				B												T	S		G	G	G	S				T	T	S	S			S		B																		T	T					S	S											S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	S	L	D	A	Q	E	A	C	R	C	I	V	E	T	E	I	L	A	F	G	Y	Y	I	Y	G	W	R	Q	V	P	I	N	V	D	I	I	G	E	K	A	N	A	T	R	P	E	I	E	Q	I	I	V	G	N	N	K	G	V	S	D	E	Q	F	E	L	D	L	Y	I	I	R	R	R	I	E	K	A	V	K
Template Known Secondary structure		S																			T	T													G	G	G	S																			T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		81	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160
																																													44	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.			.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	I	L	A	H	E	R	L	S	I	V	D	V	N	A	.	.	G	A	Q	P	L	Y	N	Q	Q	K	T	H	V	L	A	V	N	G	E	I
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.							.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																				.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	E	Q	I	N	D	F	Y	I	C	S	L	S	A	R	S	I	I	Y	K	G	M	F	L	A	E	Q	L	T	T	F	Y	P	D	L	L	D	E	R	F	E	S	D	F	A	I	Y	H	Q	R	Y	S	T	N	T	F	P	T	W	P	L	A	Q	P	F	R	.	.	.	.	.	.	M	L	A	H	N	G	E	I
Template Known Secondary structure				T			S								S	S						B	S	S		G	G	G						G	G	G	G	S	T	T			B	S										S		S				S	T	T	S	S			S	.	.	.	.	.	.	S
Template Predicted Secondary structure																																																																				.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		161	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.							.	.	.	230	.	.	.	.
		79	80	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	N	H	Q	A	L	R	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	Y	G	D	R	Y	Q	F	Q	T	G	S	D	C	E	V	I	L	A	L	Y	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	T	V	K	G	N	V	N	W	M	K	A	H	E	T	R	M	E	H	P	A	F	G	T	H	M	Q	D	L	K	P	V	I	G	V	G	L	S	D	S	G	S	L	D	T	V	F	E	V	M	V	R	A	G	R	T	A	P	M	V	K	M	M	L	V	P	Q	A	L	T	T	T	P	D	N	H	K	A	L	I
Template Known Secondary structure		T	T												G	G	G				S	T	T	G	G	G							S	S		T	T																	T	T											S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		235	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.
		109	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.				.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																				.	.	.
Query SS confidence																																																																				.	.	.
Query Sequence		E	K	G	P	E	F	L	D	D	L	Q	G	M	F	A	F	A	L	Y	D	S	E	K	D	A	Y	L	I	G	R	D	H	L	G	I	I	P	L	Y	M	G	Y	D	E	H	G	Q	L	Y	V	A	S	E	M	K	A	L	V	P	V	C	R	T	I	K	E	.	.	.	F	P	A	G	S	Y	L	W	S	Q	D
Query Conservation																																																																				.	.	.
Alig confidence																							.	.																																												.	.	.
Template Conservation																							.	.
Template Sequence		Q	Y	C	N	S	V	M	E	P	W	D	G	P	A	A	L	A	M	T	D	G	.	.	R	W	V	V	G	G	M	D	R	N	G	L	R	P	M	R	Y	T	I	T	T	D	G	L	I	I	G	G	S	E	T	G	M	V	K	I	D	E	T	Q	V	I	E	K	G	R	L	G	P	G	E	M	I	A	V	D	L
Template Known Secondary structure													S	S							S	S	.	.	S								T	T			S								T	T	S						S	S	S	T	T	S				G	G	G									T	T							T
Template Predicted Secondary structure																							.	.
Template SS confidence
		318	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.			.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.
		186	.	.	.	190	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	E	I	R	S	Y	Y	H
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		Q	S	G	K	L	Y	R	D
Template Known Secondary structure		T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		396	.	.	.	400	.	.	.

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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