Job Description P0AAE2 Confidence 99.65% Date Thu Jan 5 11:12:41 GMT 2012 Rank 4 Aligned Residues 430 % Identity 11% Template c2xq2A_ PDB info PDB header:transport protein Chain: A: PDB Molecule:sodium/glucose cotransporter; PDBTitle: structure of the k294a mutant of vsglt Resolution 2.73 Å

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		9	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	G	L	S	T	R	H	I	R	F	M	A	L	G	S	A	I	G	T	G	L	F	Y	G	S	A	D	A	I	K	M	A	G	P	S	V	L	L	A	Y	I	I	G	G	I	A	A	Y	I	I	M	R	A	L	G	E	M	S	V	H	N	P	A	A	S	S	F	S	R	Y	A	Q	E	N	L	G	P	L	A	G
Query Conservation
Alig confidence																																																																		.
Template Conservation																																																																		.
Template Sequence		V	S	L	P	W	W	A	V	G	A	S	L	I	A	A	N	I	S	A	E	Q	F	I	G	M	S	G	S	G	Y	S	I	G	L	A	I	A	S	Y	E	W	M	S	A	I	T	L	I	I	V	G	K	Y	F	L	P	I	F	I	E	K	G	I	Y	.	T	I	P	E	F	V	E	K	R	F	N	K	K	L	K
Template Known Secondary structure															G	G	G	S	S														T		G	G	G	G																T								T	T			.	S									T
Template Predicted Secondary structure																																																																		.
Template SS confidence
		30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.		.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.
		89	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.		.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																.
Query SS confidence																.
Query Sequence		Y	I	T	G	W	T	Y	C	F	E	I	L	I	V	.	A	I	A	D	V	T	A	F	G	I	Y	M	G	V	W	F	P	T	V	P	H	W	I	W	V	L	S	V	V	L	I	I	C	A	V	N	L	M	S	V	K	V	F	G	E	L	E	F	W	F	S	F	F	K	V	A	T	I	I	I	M	I	V	A	G
Query Conservation																.
Alig confidence																.
Template Conservation
Template Sequence		T	I	L	A	V	F	W	I	S	L	Y	I	F	V	N	L	T	S	V	L	Y	L	G	G	L	A	L	E	T	I	L	G	I	P	L	M	Y	S	I	L	G	L	A	L	F	A	L	V	Y	S	I	Y	G	G	V	V	W	T	D	V	I	Q	V	F	F	L	V	L	G	G	F	M	T	T	Y	M	A	V	S	F
Template Known Secondary structure															T																																						T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		128	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.
		168										.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	I	I	I	W	G	I	G	N	G	G	Q	P	T	G	I	H	N	L	W	S	N	G	G	F	F	S	N	G	W	L	G	M	V	M	S	L	Q	M	V	M	F	A	Y	G	G	I	E	I	I	G	I	T	A	G	E	A	K	D	P	E	K	S	I	P	R	A	I	N	S
Query Conservation			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence			.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																												.
Template Conservation																																																																							.
Template Sequence		I	G	G	T	D	G	W	F	A	G	V	S	K	M	V	D	A	A	P	G	H	F	E	M	I	L	D	Q	S	N	P	Q	Y	M	N	L	P	G	I	A	V	L	I	G	G	L	W	V	A	N	L	Y	Y	W	G	F	N	Q	Y	I	I	Q	R	T	L	A	A	K	S	.	V	S	E	A	Q	K	G	I	V	F
Template Known Secondary structure				G	G	G														G	G	G	S		S	S			S	S	S	G	G	G	G	T	S		T	T					S	T										T	T	T		S							T	T	S		.
Template Predicted Secondary structure																																																																							.
Template SS confidence
		211	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.		280	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		239	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.													.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	P	M	R	I	L	V	F	Y	V	G	T	L	F	V	I	M	S	I	Y	P	W	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	V	G	T	A	G	S	P	F	V	L	T	F	Q	H	M	G	I	T	F	A	A	S	I	L	N	F	V	V	L	T	A	S	L	S	A	I	N	S	D	V	F	G	V	G
Query Conservation																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	A	F	L	A	L	I	V	P	F	L	V	V	L	P	G	I	A	A	Y	V	I	T	S	D	P	Q	L	M	A	S	L	G	N	L	P	S	A	A	N	A	D	K	A	Y	P	W	L	T	Q	F	L	P	V	G	V	K	G	V	V	F	A	A	L	A	A	A	I	V	S	S	L	A	S	M	L	N	S	T	A
Template Known Secondary structure						T	T	T						T											T														S	T	B	G	G	G								T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		307	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.			.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																															.	.
Query SS confidence																																															.	.
Query Sequence		R	M	L	H	G	M	A	E	Q	G	S	A	P	K	I	F	S	K	T	S	R	R	G	I	P	W	V	T	V	L	V	M	T	T	A	L	L	F	A	V	Y	L	N	Y	I	.	.	M	P	E	N	V	F	L	V	I	A	S	L	A	T	F	A	T	V	W	V	W	I	M	I	L	L	S	Q	I	A	F	R	R
Query Conservation																																															.	.
Alig confidence					.	.	.																																								.	.																														.	.	.	.
Template Conservation					.	.	.																																																																							.	.	.	.
Template Sequence		T	I	F	.	.	.	T	M	D	I	Y	K	E	Y	I	S	P	D	S	G	D	H	K	L	V	N	V	G	R	T	A	A	V	V	A	L	I	I	A	A	L	I	A	P	M	L	G	G	I	G	Q	C	F	Q	Y	I	Q	E	Y	T	G	L	V	S	P	G	I	L	A	V	F	L	L	G	L	F	.	.	.	.
Template Known Secondary structure					.	.	.				T					T		S																										G	G	G	G	G	G		B											T	T	T														.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure					.	.	.																																																																							.	.	.	.
Template SS confidence
		375	.	.				.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.
		385	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	L	P	P	E	E	V	K	A	L	K	F	K	V	P	G	G	V	A	T	T	I	G	G	L	I	F	L	L	F	I	I	G	L	I	G	Y	H	P	D	T	R	I	S	L	Y	V	G	F	A	W	I	V	V	L	L	I	G	W	M	F	K	R	R	H	D	R	Q	L	A	E
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	W	K	K	T	T	S	K	G	A	I	I	G	V	V	A	S	I	P	F	A	L	F	L	K	F	M	P	L	S	M	P	F	M	D	Q	M	L	Y	T	L	L	F	T	M	V	V	I	A	F	T	S	L	S	T	S	I	N	D	D	D	P	K	G
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.		T	T																							S	S																													S	S	S	S		T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
										448	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510