Job Description P45464 Confidence 99.97% Date Thu Jan 5 12:02:41 GMT 2012 Rank 27 Aligned Residues 342 % Identity 15% Template c2e4zA_ PDB info PDB header:signaling protein Chain: A: PDB Molecule:metabotropic glutamate receptor 7; PDBTitle: crystal structure of the ligand-binding region of the group iii2 metabotropic glutamate receptor Resolution 3.30 Å

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		249	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.											.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.		.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.
Query SS confidence																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.
Query Sequence		K	A	F	K	P	A	S	T	N	K	I	A	L	L	L	P	L	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	Q	A	A	V	F	G	R	T	I	Q	Q	G	F	E	A	A	K	N	I	G	T	Q	P	V	A	A	Q	.	V	A	A	A	P	A	A	D	V	A	E	Q	P	Q	P	Q	T	V	D	G	V	A	S
Query Conservation																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.
Alig confidence																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.
Template Conservation
Template Sequence		H	S	I	R	I	E	G	D	V	T	L	G	G	L	F	P	V	H	A	K	G	P	S	G	V	P	C	G	D	I	K	R	E	N	G	I	H	R	L	E	A	M	L	Y	A	L	D	Q	I	N	S	D	P	N	L	L	P	N	V	T	L	G	A	R	I	L	D	T	C	S	R	D	T	Y	A	L	E	Q	S	L
Template Known Secondary structure									S														S	S	S		S																											S	S	S	S	S	S											T	T									G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		41	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
		318	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	A	Q	A	S	V	S	D	L	T	G	E	Q	P	A	A	Q	P	V	P	V	S	A	P	A	T	S	T	A	A	V	S	A	P	A	N	P	S	A	E	L	K	I	Y	D	T	S	S	Q	P	L	S	Q	I	L	S	Q	V	Q	Q	D	G	A	S	I	V	V	G	P	L	L	K	N	N	V	E	E	L	L	K
Query Conservation
Alig confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	F	V	Q	A	L	I	Q	K	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	K	V	V	G	V	I	G	A	S	G	S	S	V	S	I	M	V	A	N
Template Known Secondary structure		G	G	G	G	G	G					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										S	S								T	T
Template Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		121	.	.	.	.	.	.	.	.	130																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150
				398	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.					.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.
Predicted Secondary structure		.	.																	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.																	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	S	N	T	P	L	N	V	L	A	L	N	Q	P	E	N	I	.	.	.	.	E	N	R	V	N	I	C	Y	F	A	L	S	P	E	D	E	A	R	D	A	A	R	H	I	R	D	Q	G	K	Q	A	P	L	V	L	I	P	R	S	S	L	G	D	R	V	A	N	A	F	A	Q	E	W	Q	K	L	G	G
Query Conservation		.	.																	.	.	.	.
Alig confidence		.	.																	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	L	R	L	F	Q	I	P	Q	I	S	Y	A	S	T	A	P	E	L	S	D	D	R	R	Y	D	F	F	S	R	V	V	P	P	D	S	F	Q	A	Q	A	M	V	D	I	V	K	A	L	G	W	N	Y	V	S	T	L	A	S	E	G	S	Y	G	E	K	G	V	E	S	F	T	Q	I	S	K	E	A	G	G
Template Known Secondary structure						T	T						S	S				G	G	G	G		T	T	T	T	S	S				S	S																	T	T										S	S																	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		168	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.
		472	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	T	V	L	Q	Q	K	F	G	S	T	S	E	L	R	A	G	V	N	G	G	S	G	I	A	L	T	G	S	P	I	T	L	R	A	T	T	D	S	G	M	T	T	N	N	P	T	L	Q	T	T	P	T	D	D	Q	F	T	N	N	G	G	R	V	D	A	V	Y	I	V	A	T	P	G	E	I	A	F	I	K
Query Conservation
Alig confidence																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	C	I	A	Q	S	V	R	I	P	T	I	D	F	D	R	I	I	K	Q	L	L	D	T	P	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	R	A	V	V	I	F	A	N	D	E	D	I	K	Q	I	L
Template Known Secondary structure																							T	T	S	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		248	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290
		552	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.																.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.
Predicted Secondary structure																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.
Query SS confidence																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.
Query Sequence		P	M	I	A	M	R	N	G	S	Q	S	G	A	T	L	Y	A	S	S	R	S	A	Q	G	T	A	G	P	D	F	R	L	E	M	E	G	L	Q	Y	S	E	I	P	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	A	G	G	N	L	P	L	M	Q	Q	A	L	S	A	V	N	N	.	.	.
Query Conservation																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.
Alig confidence																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	A	A	K	R	A	D	Q	V	G	H	F	L	W	V	G	S	D	S	W	G	S	K	I	N	P	L	H	Q	H	E	D	I	A	E	G	A	I	T	I	Q	P	K	R	A	T	V	E	G	F	D	A	Y	F	T	S	R	T	L	E	N	N	R	R	N	V	W	F	A	E	Y	W	E	E	N	F	N	C	K	K
Template Known Secondary structure							T	T		T	T	T	S						T	T	T	T	T		S	G	G	G	S	S						T	T							S												T	T			T	T	T			S		T	T									T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		297	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.
													614	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650		.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	Y	S	L	A	R	M	Y	A	M	G	V	D	A	W	S	L	A	N	H	F	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	M	R	Q	V	Q	G	F	E	I	N	G	N	T	G	.	S	L	T	A	N	P	D	C
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.
Template Conservation
Template Sequence		C	T	G	Q	E	R	I	G	K	D	S	N	Y	E	Q	E	G	K	V	Q	F	V	I	D	A	V	Y	A	M	A	H	A	L	H	H	M	N	K	D	L	C	Y	R	G	V	C	P	E	M	E	Q	A	G	G	K	K	L	L	K	Y	I	R	H	V	N	F	N	G	S	A	G	T	P	V	M	F	N	K	N	G
Template Known Secondary structure					S	G	G	G	G			S	S					T	T																										S	S		T	T	T	T	T	T										T	T						T	T	S							T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		659	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670						.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.
Query SS confidence														.	.	.	.	.
Query Sequence		V	I	N	R	N	L	S	W	L	Q	Y	Q	.	.	.	.	.	Q	G	Q	V	V	P	V
Query Conservation														.	.	.	.	.
Alig confidence														.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	A	P	G	R	Y	D	I	F	Q	Y	Q	T	T	N	T	T	N	P	G	Y	R	L	I
Template Known Secondary structure		B													S	S	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		472	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.