Job Description P45464 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:02:41 GMT 2012 Rank 20 Aligned Residues 329 % Identity 13% Template c1jdpA_ PDB info PDB header:signaling protein Chain: A: PDB Molecule:atrial natriuretic peptide clearance receptor; PDBTitle: crystal structure of hormone/receptor complex Resolution 2.00 Å

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		253	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	A	S	T	N	K	I	A	L	L	L	P	L	N	G	Q	A	A	V	F	G	R	T	I	Q	Q	G	F	E	A	A	K	N	I	G	T	Q	P	V	A	A	Q	V	A	A	A	P	A	A	D	V	A	E	Q	P	Q	P	Q	T	V	D	G	V	A	S	P	A	Q	A	S	V	S	D	L	T	G	E	Q	P	A
Query Conservation
Alig confidence																																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	P	Q	K	I	E	V	L	V	L	L	P	Q	D	D	S	Y	L	F	S	L	T	R	V	R	P	A	I	E	Y	A	L	R	S	V	E	G	R	L	L	P	P	G	T	R	F	Q	V	A	Y	E	D	S	D	C	G	N	R	A	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure														S	S	T	T	S	T	T																					S		T	T											T	T	S	T				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		4	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.
		333	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.			.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.			.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																.	.																				.	.
Query SS confidence																																																.	.																				.	.
Query Sequence		A	Q	P	V	P	V	S	A	P	A	T	S	T	A	A	V	S	A	P	A	N	P	S	A	E	L	K	I	Y	D	T	S	S	Q	P	L	S	Q	I	L	S	Q	V	Q	Q	D	.	.	G	A	S	I	V	V	G	P	L	L	K	N	N	V	E	E	L	L	K	.	.	S	N	T	P	L	N	V	L	A	L	N
Query Conservation																																																.	.																				.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.																				.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	S	L	V	D	R	V	A	A	A	R	G	A	K	P	D	L	I	L	G	P	V	C	E	Y	A	A	A	P	V	A	R	L	A	S	H	W	D	L	P	M	L	S	A	G
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										T	T	T				S							S															T						S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																					69	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.
		409	410	.	.	.						.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.				.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.																																													.	.	.
Query SS confidence							.	.	.	.	.																																													.	.	.
Query Sequence		Q	P	E	N	I	.	.	.	.	.	E	N	R	V	N	I	C	Y	F	A	L	S	P	E	D	E	A	R	D	A	A	R	H	I	R	D	Q	G	K	Q	A	P	L	V	L	I	P	R	S	S	L	G	D	R	.	.	.	V	A	N	A	F	A	Q	E	W	Q	K	L	G	G	G	T	V	L	Q	Q	K	F	G
Query Conservation							.	.	.	.	.																																													.	.	.
Alig confidence							.	.	.	.	.																																													.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	L	A	A	G	F	Q	H	K	D	S	E	Y	S	H	L	T	R	V	A	P	A	Y	A	K	M	G	E	M	M	L	A	L	F	R	H	H	H	W	S	R	A	A	L	V	Y	S	D	D	K	L	E	R	N	C	Y	F	T	L	E	G	V	H	E	V	F	Q	E	E	G	L	H	T	S	I	Y	S	F	D	E
Template Known Secondary structure				S	G	G	G	G		T	T	T	T	T	T	T					S																		T												S	S	S																		T										T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		114	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.
		481	.		.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure				.
Query SS confidence				.
Query Sequence		S	T	.	S	E	L	R	A	G	V	N	G	G	S	G	I	A	L	T	G	S	P	I	T	L	R	A	T	T	D	S	G	M	T	T	N	N	P	T	L	Q	T	T	P	T	D	D	Q	F	T	N	N	G	G	R	V	D	A	V	Y	I	V	A	T	P	G	E	I	A	F	I	K	P	M	I	A	M	R	N	G
Query Conservation				.
Alig confidence				.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	K	D	L	D	L	E	D	I	V	R	N	I	Q	A	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	R	V	V	I	M	C	A	S	S	D	T	I	R	S	I	M	L	V	A	H	R	H	G	M
Template Known Secondary structure		T	S															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S						S															T	T
Template Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		194	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																								210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.
		560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.												.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	Q	S	G	A	T	L	Y	A	S	S	R	S	A	Q	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	A	G	P	D	F	R	L	E	M	E	G	L	Q	Y	S	E	I	P	M	L	A	G	G	N	L	P	L	M	Q	Q	A	L	S	A	V	N	N	D	Y	S	L	A	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																												.	.	.
Template Sequence		T	S	G	D	Y	A	F	F	N	I	E	L	F	N	S	S	S	Y	G	D	G	S	W	K	R	G	D	K	H	D	F	E	A	K	Q	A	Y	S	S	L	Q	T	.	.	.	V	T	L	L	R	T	V	K	P	E	F	E	K	F	S	M	E	V	K	S	S	V	E	K	Q	G	L	N	M	E	D	Y	V	N	M
Template Known Secondary structure		T	T	T	T								S	S				S	T	T	T		T	T			S	S	T	T								G	G	G				.	.	.																								T	T	T					S	S
Template Predicted Secondary structure																																												.	.	.
Template SS confidence
		235	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.				.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.
		620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.																.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.				.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.
Query SS confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.
Query Sequence		M	Y	A	M	G	V	D	A	W	S	L	A	N	H	F	S	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	R	Q	V	Q	G	F	E	I	N	G	N	T	G	S	L	T	A	N	P	D	C	V	I	N	R	N	.	.	.	L	S	W	L	Q	Y	Q	Q	G	Q	V	V	P	V	S
Query Conservation																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	V	E	G	F	H	D	A	I	L	L	Y	V	L	A	L	H	E	V	L	R	A	G	Y	S	K	K	D	G	G	K	I	I	Q	Q	T	W	N	R	T	F	E	G	I	A	G	Q	V	S	I	D	A	N	G	D	R	Y	G	D	F	S	V	I	A	M	T	D	V	E	A	G	T	Q	E	V	I	G
Template Known Secondary structure																							T	T			T	T										S	S						T	T							T	T	S	B	B												T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		312	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.