Job Description P36683 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:53:49 GMT 2012 Rank 6 Aligned Residues 444 % Identity 22% Template c2b3yB_ PDB info PDB header:lyase Chain: B: PDB Molecule:iron-responsive element binding protein 1; PDBTitle: structure of a monoclinic crystal form of human cytosolic aconitase2 (irp1) Resolution 1.85 Å

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		384	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.																.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430					.	.	.	.	.	.	.							.
Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	A	Q	K	M	V	G	R	A	C	G	V	K	G	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	P	G	A	Y	C	E	P	K	M	T	S	V	G	S	Q	D	T	T	G	P	M	T	R	D	E	L	K	D	L	A	C	.	.	.	.	L	G	F	S	A	D	L	.	.	.	.	.	.	V
Query Conservation																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.
Alig confidence									.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.
Template Conservation									.
Template Sequence		L	L	E	A	A	I	R	.	N	C	D	E	F	L	V	K	K	Q	D	I	E	N	I	L	H	W	N	V	T	Q	H	K	N	I	E	V	P	F	K	P	A	R	V	I	L	Q	D	F	T	G	V	P	A	V	V	D	F	A	A	M	R	D	A	V	K	K	L	G	G	D	P	E	K	I	N	P	V	C	P	A
Template Known Secondary structure									.	T			S	S	S	S										T					T	T	T	T								S																										T	T			G	G	G		S		S	S
Template Predicted Secondary structure									.
Template SS confidence
		42	.	.	.	.	.	.		.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
		439	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450																.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.		.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.		.	.											.	.	.	.	.	490	.
Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.																.			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.																.			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		M	Q	S	F	C	H	T	A	A	Y	P	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	V	D	V	N	T	H	H	T	L	P	D	F	I	M	N	R	.	G	G	V	S	L	R	P	G	D	G	V	I	H	S	W	.	L	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	M	L	L	P	D	T
Query Conservation														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.																.			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.																.			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	L	V	I	D	H	S	I	Q	V	D	F	N	R	R	A	D	S	L	Q	K	N	Q	D	L	E	F	E	R	N	R	E	R	F	E	F	L	K	W	G	S	Q	A	F	H	N	M	R	I	I	P	P	G	S	G	I	I	H	Q	V	N	L	E	Y	L	A	R	V	V	F	D	Q	D	G	Y	Y	Y	P	D	S
Template Known Secondary structure							S	S				S	S		S	S	T	T																											S	T	T						T	T	S										T	T			S					T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		121	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200
		492	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.				.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																	.	.	.
Query SS confidence																	.	.	.
Query Sequence		V	G	T	G	G	D	S	H	T	R	F	P	I	G	I	.	.	.	S	F	P	A	G	S	G	L	V	A	F	A	A	A	T	G	V	M	P	L	D	M	P	E	S	V	L	V	R	F	K	G	K	M	Q	P	G	I	T	L	R	D	L	V	H	A	I	P	L	Y	A	I	K	Q	G	L	L	T	V	E	K	K
Query Conservation																	.	.	.
Alig confidence			.														.	.	.																																																									.	.	.	.	.	.
Template Conservation			.																																																																									.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	.	V	G	T	D	S	H	T	T	M	I	D	G	L	G	I	L	G	W	G	V	G	G	I	E	A	E	A	V	M	L	G	Q	P	I	S	M	V	L	P	Q	V	I	G	Y	R	L	M	G	K	P	H	P	L	V	T	S	T	D	I	V	L	T	I	T	K	H	L	R	Q	V	G	V	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure			.			S	S	G	G	G	G	G	G	G	G	G	T																T	T																	S				T	T																				.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure			.																																																																									.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		201		.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.
		569	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.			.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure															.	.
Query SS confidence															.	.
Query Sequence		G	K	K	N	I	F	S	G	R	I	L	E	I	.	.	E	G	L	P	D	L	K	V	E	Q	A	F	E	L	T	D	A	S	A	E	R	S	A	A	G	C	T	I	K	L	N	K	E	P	I	I	E	Y	L	N	S	N	I	V	L	L	K	W	M	I	A	E	G	Y	G	D	R	R	T	L	E	R	R	I	Q
Query Conservation															.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.								.	.																																																															.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.																																																																								.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	V	G	K	F	V	E	F	F	G	P	G	V	A	Q	L	S	I	A	D	R	A	T	I	A	N	M	C	P	E	Y	G	A	T	A	A	F	F	P	V	D	E	V	S	I	T	Y	L	V	Q	T	G	R	D	E	E	K	L	K	Y	I	K	K	Y	L	Q	A	V	G	M	F	R	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	T	T							S	T	T	T	T	T	S											T					T		S																	T	T																	T				.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.																																																																								.	.	.
Template SS confidence
								274	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.
		647	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700
Predicted Secondary structure																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	M	E	K	W	L	A	N	P	E	L	L	E	A	D	A	D	A	E	Y	A	A	V	I	D	I	D	L	A	D	I	K	E	P	I	L	C	A	P	N	D	P	D	D	A	R	P	L	S	A	V	Q	G	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	F	N	D	P	S	Q	D	P	D	F	T	Q	V	V	E	L	D	L	K	T	V	.	V	P	C	C	S	G	P	K	R	P	Q	D	K	V	A	V	S	D	M	K	K	D	F	E	S	C	L	G	A	K	Q	G	F	K	G	F	Q	V	A	P	E	H	H	N	D	H	K	T
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T		G	G	G					S							G	G	G		.							S	S		T	T					G	G	G											S		S	B	T	T	B					G	G	G	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.
Template SS confidence
											345	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.		.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.
															701	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.		.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.							.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.													.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.													.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	I	D	E	V	F	I	G	S	C	M	T	.	N	I	G	H	F	R	A	A	G	K	L	L	.	.	.	.	.	.	D	A	H	K	G	Q	L	P	T	R	L	W	V	A	P	P	T	R	M	D	A	A	Q	L	T	E	E	G	Y	Y	S	V	F	G	K	S
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.													.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.													.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	I	Y	D	N	T	E	F	T	L	A	H	G	S	V	V	I	A	A	I	T	S	C	T	N	T	S	N	P	S	V	M	L	G	A	G	L	L	A	K	K	A	V	D	A	G	L	N	V	M	P	Y	I	K	T	S	L	S	P	G	S	G	V	V	T	Y	Y	L	Q	E	S	G	V	M	P	Y	L	S	Q	L
Template Known Secondary structure					T	T							T	T	B													T																		T	T					T	T	S							S	S										T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		415	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.
		761	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.		780	.	.	.											.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.		.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																					.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.
Query SS confidence																					.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.
Query Sequence		G	A	R	I	E	I	P	G	C	S	L	C	M	G	N	Q	A	R	V	.	A	D	G	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	V	V	S	T	S	T	R	N	F	P	N	R	L	G	.	T	G	A	N	V	F	L	A	S	A	E	L	A	A	V	A	A	L	I	G	K	L	P	T	P	E	E	Y	Q	T
Query Conservation																					.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.
Alig confidence																					.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.																												.	.
Template Conservation																																																																															.	.
Template Sequence		G	F	D	V	V	G	Y	G	C	M	T	C	I	G	N	S	G	P	L	P	E	P	V	V	E	A	I	T	Q	G	D	L	V	A	V	G	V	L	S	G	N	R	N	F	E	G	R	V	H	P	N	T	R	A	N	Y	L	A	S	P	P	L	V	I	A	Y	A	I	A	G	T	I	R	I	D	F	E	.	.	K
Template Known Secondary structure		T			B			S	S		G	G	G	G	T																	T								S	S	S				T	T	S	S		T	T		S																		B	S				T	T	.	.	T
Template Predicted Secondary structure																																																																															.	.
Template SS confidence
		495	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.			.
		829	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.				.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure															.	.	.
Query SS confidence															.	.	.
Query Sequence		Y	V	A	Q	V	D	K	T	A	V	D	T	Y	.	.	.	R	Y	L	N	F	N	Q	L	S	Q	Y	T	E	K	A
Query Conservation															.	.	.
Alig confidence															.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	P	L	G	V	N	A	K	G	Q	Q	V	F	L	K	D	I	W	P	T	R	D	E	I	Q	A	V	E	R	Q	Y
Template Known Secondary structure		S		S				T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		573	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.