Job Description P52697 Confidence 94.52% Date Thu Jan 5 12:06:01 GMT 2012 Rank 170 Aligned Residues 311 % Identity 15% Template c1kv9A_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: A: PDB Molecule:type ii quinohemoprotein alcohol dehydrogenase; PDBTitle: structure at 1.9 a resolution of a quinohemoprotein alcohol2 dehydrogenase from pseudomonas putida hk5 Resolution 1.90 Å

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		4	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.													.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.
Predicted Secondary structure																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	V	Y	I	A	S	P	E	S	Q	Q	I	H	V	W	N	L	N	H	E	G	A	L	T	L	T	Q	V	V	D	V	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	Q	V	Q	P	M	V	V	S	P	D	K	R	Y	L	Y	V	G	V	R	P	E	F	R	V	L	A	Y	R	I	A	P	D	D	G	A
Query Conservation																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence									.													.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.								.
Template Conservation									.													.	.	.																																	.	.								.
Template Sequence		V	I	Y	T	S	M	S	.	W	S	R	V	I	A	V	D	A	A	S	G	.	.	.	K	E	L	W	R	Y	D	P	E	V	A	K	V	K	A	R	T	S	C	C	D	A	V	N	R	G	V	A	L	W	G	D	.	.	K	V	Y	V	G	T	L	.	D	G	R	L	I	A	L	D	A	K	T	G	K	A	I
Template Known Secondary structure								G	.	G	G							T	T	T		.	.	.												G	G	G	G	G	G		T	T		S									B	T	.	.							T	.	T	S							T	T	T
Template Predicted Secondary structure									.													.	.	.																																	.	.								.
Template SS confidence
		68	.	70	.	.	.	.		.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.				.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.			.	120	.	.	.	.	.		.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140
		72	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.						.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	T	F	A	A	E	S	A	L	P	G	S	P	T	H	I	S	T	D	H	Q	G	Q	F	V	F	V	G	S	Y	N	.	.	.	.	.	A	G	N	V	S	V	T	R	L	E	D	G	L	P	V	G	V	V	D	V	V	E	G	L	D	G	C	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		W	S	Q	Q	T	T	D	P	A	K	P	Y	S	I	T	G	A	P	R	V	V	K	G	K	V	I	I	G	N	G	G	A	E	Y	G	V	R	G	F	V	S	A	Y	D	A	D	T	G	K	L	A	W	R	F	Y	T	V	P	G	D	P	A	L	P	Y	E	H	P	E	L	R	E	A	A	K	T	W	Q	G	D
Template Known Secondary structure							S		T	T	S	S		B			S						T	T							B		T	T	T			B								T	T	T									S	S				T	T	S			S	S								T	T			S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		141	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220
														130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	S	A	N	I	S	P	D	N	R	T	L	W	V	P	A	L	K	Q	D	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	C	L	F	T	V	S	D	D	G	H	L	V	A	Q	D	P	A	E	V	T	T	V	E	G	A	G	P	R
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Q	Y	W	K	L	G	G	G	G	T	V	W	D	S	M	A	Y	D	P	E	L	D	L	L	Y	V	G	T	G	N	G	S	P	W	N	R	E	V	R	S	P	G	G	G	D	N	L	Y	L	S	S	I	L	A	I	R	P	D	T	G	K	L	A	W	H	Y	Q	V	T	P	G	D	S	W	D	F	T	A	T	Q
Template Known Secondary structure														S						T	T	T	T											S	S						S	T	T					T	T	T	T							T	T	T									S	S	T	T			S						S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		221	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
		180	.	.				.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure					.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence					.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		H	M	V	.	.	.	F	H	P	N	E	Q	Y	A	Y	C	V	N	E	L	N	S	S	V	D	V	W	E	L	K	D	P	H	G	N	I	E	C	V	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	L	D	M	M	P	E	N	F	S	D	T
Query Conservation					.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence					.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Q	I	T	L	A	E	L	N	I	D	G	K	P	R	K	V	L	M	Q	A	P	K	N	G	F	F	Y	V	L	D	R	T	N	G	K	L	I	S	A	E	K	F	G	K	V	T	W	A	E	K	V	D	L	A	T	G	R	P	V	E	A	P	G	V	R	Y	E	K	E	P	I	V	M	W	P	S	P	F	G	A
Template Known Secondary structure											T	T											T	T	S							T	T	T									S	S				S						T	T	T							T	T	T	T		S	S	S					S	S		T	T		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		301	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380
		229	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.
Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	W	A	A	D	I	H	I	T	P	D	G	R	H	L	Y	A	C	D	R	T	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	L	I	T	V	F	S	V	S	E	D	G	S	V	L	S	K	E	G	F	Q	P	T
Query Conservation																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.
Template Conservation																																																																						.	.	.	.
Template Sequence		H	N	W	H	S	M	S	F	N	P	G	T	G	L	V	Y	I	P	Y	Q	E	V	P	G	V	Y	R	N	E	G	K	D	F	V	T	R	K	A	F	N	T	A	A	G	F	A	D	A	T	D	V	P	A	A	V	V	S	G	A	L	L	A	W	D	P	V	K	Q	.	.	.	.	K	A	A	W	K	V	P	Y
Template Known Secondary structure		S		S	S						T	T	T	T																	G	G	G					S	S				S	S		G	G	G						G	G	G										T	T	T	T	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																						.	.	.	.
Template SS confidence
		381	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.					.	450	.	.	.	.	.	.
		274	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.					.	.	.									.	.	.	.	330
Predicted Secondary structure																																																			.	.	.	.				.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																			.	.	.	.				.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	T	Q	P	R	G	F	N	V	D	H	S	G	K	Y	L	I	A	A	G	Q	K	S	H	H	I	S	V	Y	E	I	V	G	E	Q	G	L	L	H	E	K	G	R	Y	A	V	G	Q	G	.	.	.	.	P	M	W	.	.	.	.	.	.	.	.	V	V	V	N	A
Query Conservation																																																			.	.	.	.				.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																				.											.	.						.	.												.	.	.	.				.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																				.											.	.						.	.
Template Sequence		P	T	H	W	N	G	G	T	L	S	T	A	G	N	L	V	F	Q	.	G	T	A	A	G	Q	M	H	A	Y	.	.	S	A	D	K	G	.	.	E	A	L	W	Q	F	E	A	Q	S	G	I	V	A	A	P	M	T	F	E	L	A	G	R	Q	Y	V	A	I	M	A
Template Known Secondary structure		S	S	S									T	T	T					.			T	T	S						.	.		T	T	T		.	.									S	S				S								T	T
Template Predicted Secondary structure																				.											.	.						.	.
Template SS confidence
		457	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.		.	.	.	.	.	480	.	.	.	.			.	.	.	.	.			490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520