Job Description P11868 Confidence 95.50% Date Thu Jan 5 11:32:55 GMT 2012 Rank 40 Aligned Residues 319 % Identity 14% Template c3gbtA_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:gluconate kinase; PDBTitle: crystal structure of gluconate kinase from lactobacillus acidophilus Resolution 2.40 Å

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		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	F	P	V	V	L	V	I	N	C	G	S	S	S	I	K	F	S	V	L	D	A	S	D	C	E	V	L	M	S	G	I	A	D	G	I	N	S	E	N	A	F	L	S	V	N	G	G	E	P	A	P	L	A	H	H	S	Y	E	G	A	L	K	A	I	A	F	E	L	E	K	R	N	L	N	D	S	V	A	L
Query Conservation
Alig confidence																							.													.	.	.	.	.	.																																	.
Template Conservation																							.													.	.	.	.	.	.																																	.
Template Sequence		S	L	K	Y	I	I	G	X	D	V	G	T	T	A	T	K	G	V	L	Y	D	.	I	N	G	K	A	V	A	S	V	S	K	G	.	.	.	.	.	.	Y	P	L	I	Q	T	K	V	G	Q	A	E	E	D	P	K	L	I	F	D	A	V	Q	E	I	I	F	D	L	T	Q	K	.	I	D	G	K	I	A	A
Template Known Secondary structure													S	S									.	T	T	S										.	.	.	.	.	.				B		S	S	T	T																							T	.		S	S
Template Predicted Secondary structure																							.													.	.	.	.	.	.																																	.
Template SS confidence
		0	.	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20		.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.							.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.		.	.	.	.	.	70	.
		83	.	.	.	.	.	.	90	.								.	.	.	.	.	.	.	.	100						.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.									.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140
Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.
Query SS confidence											.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.
Query Sequence		I	G	H	R	I	A	H	G	G	.	.	.	.	.	.	.	S	I	F	T	E	S	A	I	I	.	.	.	.	.	T	D	E	V	I	D	N	I	R	R	V	S	P	.	.	.	.	.	.	.	.	L	A	P	L	H	N	Y	A	N	L	S	G	I	E	S	A	Q	Q	L	F	P	G	V	T	Q	V	A	.	.
Query Conservation											.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.
Alig confidence											.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	S	W	S	S	Q	X	H	S	L	I	G	L	G	S	D	D	E	L	L	T	N	S	I	T	W	A	D	N	C	A	K	S	I	V	Q	D	A	K	N	R	G	F	A	Q	Q	I	Y	R	K	T	G	X	P	X	H	P	X	A	P	I	Y	K	L	L	W	L	K	N	K	K	T	E	V	F	S	Q	A	Q	K
Template Known Secondary structure								S	S		B					T	T	S		B	S	S					T	T			T	T										T	T													S		T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		72	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.
																													141	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.		.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.														.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.														.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	F	D	T	S	F	H	Q	T	M	A	P	E	A	Y	L	Y	G	L	P	W	K	Y	Y	E	E	L	G	V	R	R	Y	G	.	F	H	G	T	S	H	R	Y	V	S	Q	R	A	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.														.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.						.														.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																							.	.
Template Sequence		W	I	G	I	K	E	Y	I	I	F	R	L	T	G	K	L	V	T	D	T	T	X	A	A	G	T	G	I	L	N	L	K	T	L	T	W	D	Q	E	L	L	D	I	L	K	I	K	K	E	Q	L	P	K	.	.	I	A	Q	P	T	K	V	I	F	P	I	K	T	E	Y	V	K	K	L	G	I	D	S	D	T
Template Known Secondary structure															S										T	T	T	T		B		T	T	T	S	S	B									T			G	G	G	S			.	.				T	T														T	T			T	T
Template Predicted Secondary structure																																																							.	.
Template SS confidence
		152	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.			.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.
												187	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.							.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	S	L	L	N	L	A	E	D	D	S	G	L	V	V	A	H	L	G	N	G	A	S	I	C	A	V	R	N	G	Q	S	V	D	T	S	M	G	M	T	P	L	E	G	L	M	M	.	.	.	.	.	.	G	T	R	S	G	D	V	D	F	G	A	M	S	W	V	A	S
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	I	I	L	G	A	S	D	G	Y	L	S	T	I	G	V	N	A	I	D	S	D	H	C	A	L	N	V	G	T	S	G	A	I	R	T	I	V	D	Q	P	K	I	D	P	S	A	S	Y	F	C	Y	P	A	D	K	T	H	Y	L	L	G	G	P	V	N	N	G	G	I	V	F	N	W	A	R	Q	T	L	F
Template Known Secondary structure																T	T	T			S	T	T							S	S	S								S	S					T	T			S							T	T									S		S												T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		251	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	T	N	Q	S	L	G	D	L	E	R	V	V	N	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	S	G	L	L	G	I	S	G	L	S	S	D	L	R	V	L	E	K	A	W	H	E	G	H	E	R	A	Q	L	A	I	K	T	F	V	H	R	I
Query Conservation																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																				.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	A	D	E	T	P	Q	D	F	L	D	V	A	Q	T	A	P	A	G	S	R	N	L	I	F	L	P	Y	L	G	G	E	R	A	P	I	W	D	A	N	A	R	G	S	F	V	G	L	T	R	.	X	H	Q	K	P	E	X	A	R	A	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	E	G	I	I	F	N	L
Template Known Secondary structure			T	T												T	S		T	T	G	G	G							T	T		B		T	T	T		B	T	T							S			T	.	T											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																				.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.		360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370											.	.	.	.	.	.	.	.
		305	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	R	H	I	A	G	H	A	A	S	L	R	R	L	D	G	I	I	F	T	G	G	I	G	E	N	S	S	L	I	R	R	L	V	M	E	H	L	A
Query Conservation
Alig confidence																										.
Template Conservation																										.
Template Sequence		Y	D	A	A	S	N	L	I	K	N	T	K	K	P	V	A	I	N	A	T	G	G	F	L	.	K	S	D	F	V	R	Q	L	C	A	N	I	F	N
Template Known Secondary structure										T	T	S				S						S	G	G	G	.		S												T
Template Predicted Secondary structure																										.
Template SS confidence
		379	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.		.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.