Job Description P46883 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:04:33 GMT 2012 Rank 16 Aligned Residues 402 % Identity 25% Template d1w7ca1 SCOP info Supersandwich Amine oxidase catalytic domain Amine oxidase catalytic domain Resolution 1.23

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		331	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350			.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																						.	.
Query SS confidence																						.	.
Query Sequence		P	A	V	K	P	M	Q	I	I	E	P	E	G	K	N	Y	T	I	T	G	.	.	D	M	I	H	W	R	N	W	D	F	H	L	S	M	N	S	R	V	G	P	M	I	S	T	V	T	Y	N	D	N	G	T	K	R	K	V	M	Y	E	G	S	L	G	G	M	I	V	P	Y	G	D	P	D	I	G	W	Y	F
Query Conservation																						.	.
Alig confidence																						.	.																														.	.	.	.																								.
Template Conservation																																																					.	.	.	.																								.
Template Sequence		D	D	R	K	S	P	R	L	V	E	P	E	G	R	R	W	A	Y	D	G	D	E	E	Y	F	S	W	M	D	W	G	F	Y	T	S	W	S	R	D	T	G	I	S	F	Y	D	I	T	F	K	G	.	.	.	.	E	R	I	V	Y	E	L	S	L	Q	E	L	I	A	E	Y	G	S	D	D	P	F	N	.	Q
Template Known Secondary structure		T	T	S								T	T								T	T	T	T					T	T									T	T	T										T	T	.	.	.	.																			S	S	T	T	G	.	G
Template Predicted Secondary structure																																																					.	.	.	.																								.
Template SS confidence
		318	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.					.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.		.
		409	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.		.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																											.
Query SS confidence																																																											.
Query Sequence		K	A	Y	L	D	S	G	D	Y	G	M	G	T	L	T	S	P	I	A	R	G	K	D	A	P	S	N	A	V	L	L	N	E	T	I	A	D	Y	T	G	V	P	M	E	I	P	R	A	I	A	V	F	E	R	Y	A	G	.	P	E	Y	K	H	Q	E	M	G	Q	P	N	V	S	T	E	R	R	E	L	V	V
Query Conservation																																																											.
Alig confidence														.																												.																	.								.
Template Conservation														.																												.																									.
Template Sequence		H	T	F	Y	S	D	I	S	Y	G	V	G	.	N	R	F	S	L	V	P	G	Y	D	C	P	S	T	A	G	Y	F	T	T	D	T	F	E	Y	D	E	.	F	Y	N	R	T	L	S	Y	C	V	F	E	N	Q	E	D	Y	S	L	L	R	H	T	G	.	A	S	Y	S	A	I	T	Q	N	P	T	L	N	V
Template Known Secondary structure		G										S	S	.	S	S					B	T	T	T	B		T	T											T	T		.																S	S		S						.	T	T
Template Predicted Secondary structure														.																												.																									.
Template SS confidence
		393	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.		.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.		.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.		.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		488	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	W	I	S	T	V	G	N	Y	D	Y	I	F	D	W	I	F	H	E	N	G	T	I	G	I	D	A	G	A	T	G	I	E	A	V	K	G	V	K	A	K	T	M	H	D	E	T	A	K	D	D	T	R	Y	G	T	L	I	D	H	N	I	V	G	T	T	H	Q	H	I	Y	N	F	R	L	D	L	D	V	D
Query Conservation
Alig confidence										.																																.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation										.																																.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	F	I	S	T	I	G	N	.	D	Y	N	F	L	Y	K	F	F	L	D	G	T	L	E	V	S	V	R	A	A	G	Y	I	Q	A	G	Y	W	N	P	.	.	.	.	.	.	.	.	E	T	S	A	P	Y	G	L	K	I	H	D	V	L	S	G	S	F	H	D	H	V	L	N	Y	K	V	D	L	D	V	G
Template Known Secondary structure										.										T	T	S										B									T	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T		G	G	G						T	T																		T	T
Template Predicted Secondary structure										.																																.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		470	.	.	.	.	.	.	.		.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.									.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
		568	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.				.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.			.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.
Predicted Secondary structure																												.	.	.																					.	.
Query SS confidence																												.	.	.																					.	.
Query Sequence		G	E	N	N	S	L	V	A	M	D	P	V	V	K	P	N	T	A	G	G	P	R	T	S	T	M	.	.	.	Q	V	N	Q	Y	N	I	G	N	E	Q	D	A	A	Q	K	F	D	P	G	.	.	T	I	R	L	L	S	N	P	N	K	E	N	R	M	G	N	P	V	S	Y	Q	I	I	P	Y	A	G	G	T
Query Conservation																												.	.	.																					.	.
Alig confidence																												.	.	.																					.	.																												.	.
Template Conservation																																																																																.	.
Template Sequence		G	T	K	N	R	A	S	Q	Y	V	M	K	D	V	D	V	E	Y	P	W	A	P	G	T	V	Y	N	T	K	Q	I	A	R	E	V	F	E	N	E	D	F	N	G	I	N	W	P	E	N	G	Q	G	I	L	L	I	E	S	A	E	E	T	N	S	F	G	N	P	R	A	Y	N	I	M	P	G	G	G	.	.
Template Known Secondary structure		S	S																	T	T	S	T	T															B			T	T		B				G	G	G														T	T	S											T	T	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																																.	.
Template SS confidence
		542	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		643	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.		.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.		.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Predicted Secondary structure															.																																												.
Query SS confidence															.																																												.
Query Sequence		H	P	V	A	K	G	A	Q	F	A	P	D	E	.	W	I	Y	H	R	L	S	F	M	D	K	Q	L	W	V	T	R	Y	H	P	G	E	R	F	P	E	G	K	Y	P	N	R	S	T	H	D	T	G	L	G	Q	Y	S	.	K	D	N	E	S	L	D	N	T	D	A	V	V	W	M	T	T	G	T	T	H	V
Query Conservation															.																																												.
Alig confidence		.	.	.	.										.																																												.
Template Conservation		.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	G	V	H	R	I	V	K	N	S	R	S	G	P	E	T	Q	N	W	A	R	S	N	L	F	L	T	K	H	K	D	T	E	L	R	S	S	T	A	L	N	T	N	A	L	Y	D	P	P	V	N	F	N	A	F	L	D	D	E	S	L	D	G	E	D	I	V	A	W	V	N	L	G	L	H	H	L
Template Known Secondary structure		.	.	.	.					S		S	S		T	T		S	S	S		G	G	G	G	S	S								T	T				S			T	T		T	T		S	S	S		S			G	G	G	G		S			B		T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.
Template SS confidence
						620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.
		721	.	.	.	.	.	.			.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure									.	.
Query SS confidence									.	.
Query Sequence		A	R	A	E	E	W	P	.	.	I	M	P	T	E	W	V	H	T	L	L	K	P	W	N	F	F	D	E	T	P	T	L	G	A	L	K	K
Query Conservation									.	.
Alig confidence									.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	N	S	N	D	L	P	N	T	I	F	S	T	A	H	A	S	F	M	L	T	P	F	N	Y	F	D	S	E	N	S	R	D	T	T	Q	Q
Template Known Secondary structure				G	G	G	S	S		B		S	S	S	S										S	S	S	S	S		T	T	T	T		S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		696	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.