Job Description P46883 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:04:33 GMT 2012 Rank 8 Aligned Residues 600 % Identity 22% Template c3pgbA_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: A: PDB Molecule:putative uncharacterized protein; PDBTitle: crystal structure of aspergillus nidulans amine oxidase Resolution 2.45 Å

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		122	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.											.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.
Predicted Secondary structure																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	P	H	P	L	N	A	L	T	A	D	E	I	K	Q	A	V	E	I	V	K	A	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	D	F	K	P	N	T	R	F	T	E	I	S	L	L	P	P	D	K	E	A	V	W	A	F	A	L	E	N	K	P	V	D	Q	P	R	K	A	D	V	I	M	L	D	G	K	H
Query Conservation																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.																			.	.	.	.
Template Conservation																																												.																			.	.	.	.
Template Sequence		K	E	N	V	W	Y	G	L	T	D	D	E	T	A	D	V	A	K	W	L	F	G	R	P	E	L	N	L	T	T	T	E	N	A	G	E	W	D	N	T	I	A	.	L	I	E	L	H	R	P	N	K	S	E	A	I	P	Y	L	D	G	.	.	.	.	A	P	T	R	H	A	H	V	R	L	N	N	R	A	T
Template Known Secondary structure		S			S	S	S																T		T	T	T					T	T	T			S	S	S					.																			.	.	.	.														S	S
Template Predicted Secondary structure																																												.																			.	.	.	.
Template SS confidence
		84	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.		.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.					.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.
		192	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.														.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.					.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.
Query SS confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.
Query Sequence		I	I	E	A	V	V	D	L	Q	N	N	K	L	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	W	Q	P	I	K	D	A	H	G	M	V	L	L	D	D	F	A	S	V	Q	N	I	I	N	N	S	E	E	F	A	A	A	V	K	K	R	.	.	.	.	G	I	T	D	A	K	K	V	I	T	T	P
Query Conservation																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.
Alig confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	D	P	Y	F	A	D	I	L	V	G	P	L	P	V	S	N	A	T	T	W	E	P	L	E	F	P	Y	T	R	K	T	Q	G	Q	V	R	N	V	E	P	D	G	E	T	V	Y	S	E	W	L	F	K	I	S	A	S	I	A	D	I	T	L	D	L	W	N	G	T	A	L	G	L	E	N	D	T	L	D	I
Template Known Secondary structure		S	S										S	S	S		S	T	T								T	T		S	S		S	T	T					S				T	T					T	T								T									S				S	S	S	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		162	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.
		255	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280		.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							310	.
Predicted Secondary structure																												.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																												.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	T	V	G	Y	F	D	G	K	D	G	L	K	Q	D	A	R	L	L	K	V	I	S	Y	L	D	.	V	G	D	G	N	Y	W	A	H	P	I	E	N	L	V	A	V	V	D	L	E	Q	K	K	I	V	K	I	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	G
Query Conservation																												.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence												.	.	.														.												.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation												.	.	.																										.
Template Sequence		W	G	I	D	P	L	W	Q	D	D	.	.	.	G	R	I	I	R	W	D	M	F	W	N	M	A	D	D	E	F	D	S	E	T	L	L	P	L	.	G	L	Y	L	K	S	D	V	T	G	R	D	P	S	Q	W	K	L	L	G	W	M	Y	N	D	I	F	Y	E	T	T	E	E	F	R	K	A	Y	W	S	P
Template Known Secondary structure					S	S		B		S	T	.	.	.	T														T	T				G	G	G				.										S	S		G	G	G									T	T				S	S									T	S	T
Template Predicted Secondary structure												.	.	.																										.
Template SS confidence
		242	.	.	.	.	.	.	.	250	.				.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.		.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.
		312	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.							.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350			.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.
Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.	.																													.	.
Query SS confidence													.	.	.	.	.	.																													.	.
Query Sequence		P	V	V	P	V	P	M	T	A	R	P	.	.	.	.	.	.	F	D	G	R	D	R	V	A	P	A	V	K	P	M	Q	I	I	E	P	E	G	K	N	Y	T	I	T	G	.	.	D	M	I	H	W	R	N	W	D	F	H	L	S	M	N	S	R	V	G	P	M	I	S	T	V	T	Y	N	D	N	G	T	K
Query Conservation													.	.	.	.	.	.																													.	.
Alig confidence													.	.	.	.	.	.																													.	.																														.	.	.	.
Template Conservation																																																																														.	.	.	.
Template Sequence		G	F	V	K	L	K	P	N	V	D	G	A	W	A	H	T	E	Q	R	G	P	V	P	P	Q	D	R	K	Q	P	P	V	M	I	A	P	D	G	A	R	Y	S	V	D	A	E	R	K	Y	V	T	W	M	D	F	S	F	Y	I	A	F	N	R	D	T	G	L	S	L	F	D	I	K	Y	K	G	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		T											G	G	G			S			S				T	T	T	T	S								T	T				S				T	T	T	T					T	T									T	T	T										T	T	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																														.	.	.	.
Template SS confidence
		318	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.
		384	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	K	V	M	Y	E	G	S	L	G	G	M	I	V	P	Y	G	D	P	D	I	G	W	Y	F	K	A	Y	L	D	S	G	D	Y	G	M	G	T	L	T	S	P	I	A	R	G	K	D	A	P	S	N	A	V	L	L	N	E	T	I	A	D	Y	T	G	V	P	M	E	I	P	R	A	I	A	V	F	E	R	Y
Query Conservation
Alig confidence																					.																																											.
Template Conservation																					.																																											.
Template Sequence		Q	R	V	L	Y	E	L	G	L	Q	E	A	L	A	H	Y	A	A	N	.	D	P	V	Q	S	S	V	A	Y	L	D	S	Y	Y	G	F	G	P	Y	A	F	E	L	L	K	G	Y	D	C	P	S	Y	A	S	Y	L	N	T	S	F	Y	K	.	D	E	E	T	H	T	H	V	D	S	L	C	L	F	E	F	D
Template Known Secondary structure																				S	.	S										G	G	G	T		S	G	G	G						B	T	T	T	B		T	T											.	T	T
Template Predicted Secondary structure																					.																																											.
Template SS confidence
		394	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.		.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.		.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.
		464	.		.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.
Predicted Secondary structure				.
Query SS confidence				.
Query Sequence		A	G	.	P	E	Y	K	H	Q	E	M	G	Q	P	N	V	S	T	E	R	R	E	L	V	V	R	W	I	S	T	V	G	N	Y	D	Y	I	F	D	W	I	F	H	E	N	G	T	I	G	I	D	A	G	A	T	G	I	E	A	V	K	G	V	K	A	K	T	M	H	D	E	T	A	K	D	D	T	R	Y	G
Query Conservation				.
Alig confidence				.										.																					.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation														.																					.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	D	Y	P	M	A	R	H	S	T	S	E	.	F	V	S	V	T	K	N	V	Y	F	T	L	R	S	V	S	T	I	G	N	.	D	Y	M	F	S	Y	N	F	H	M	D	G	T	I	G	V	E	V	R	A	S	G	Y	I	Q	S	A	Y	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	N	N	Q	D	F	G
Template Known Secondary structure			S	S		S						S	S	.																					.										T	T	S										B								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T		G	G	G
Template Predicted Secondary structure														.																					.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		472	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.		.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.		.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.											.	.	.	.	.	.	.
		543	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.				.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.			.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																														.	.	.																										.	.
Query SS confidence																																														.	.	.																										.	.
Query Sequence		T	L	I	D	H	N	I	V	G	T	T	H	Q	H	I	Y	N	F	R	L	D	L	D	V	D	G	E	N	N	S	L	V	A	M	D	P	V	V	K	P	N	T	A	G	.	.	.	G	P	R	T	S	T	M	Q	V	N	Q	Y	N	I	G	N	E	Q	D	A	A	Q	K	F	D	.	.	P	G	T	I	R	L
Query Conservation																																														.	.	.																										.	.
Alig confidence																																														.	.	.																										.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	Q	I	H	D	S	L	S	G	S	M	H	D	H	V	L	N	F	K	A	D	F	D	I	L	G	P	N	N	T	I	E	L	V	S	V	V	P	V	T	K	Q	F	S	W	S	G	N	K	T	R	N	T	M	Q	L	G	R	S	F	I	H	S	E	D	E	A	R	L	N	W	G	F	N	G	Q	T	Q	L	H
Template Known Secondary structure						T	T																		T	T	S	S																	T	T	T	T	T															B	G	G	G							G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		541	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620
		618	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																													.
Query SS confidence																																													.
Query Sequence		L	S	N	P	N	K	E	N	R	M	G	N	P	V	S	Y	Q	I	I	P	Y	A	G	G	T	H	P	V	A	K	G	A	Q	F	A	P	D	E	W	I	Y	H	R	.	L	S	F	M	D	K	Q	L	W	V	T	R	Y	H	P	G	E	R	F	P	E	G	K	Y	P	N	R	S	T	H	D	T	G	L	G	Q
Query Conservation																																													.
Alig confidence																									.	.	.	.	.	.															.																															.
Template Conservation																									.	.	.	.	.	.																																														.
Template Sequence		V	V	N	Q	D	K	P	N	K	F	G	E	P	R	G	Y	R	I	L	P	S	A	G	.	.	.	.	.	.	T	A	H	L	T	V	L	N	S	S	N	L	V	H	A	A	H	W	A	E	Y	D	V	Q	V	T	R	Q	H	D	F	E	P	T	S	A	H	P	Y	N	S	Q	D	I	H	.	N	P	P	V	D
Template Known Secondary structure										T	T	S										S	S		.	.	.	.	.	.							S	S		T	T	T	T	T	T	T	G	G	G	G		S								T	T				S			T	T	G	G	G		T	T	.	S		S
Template Predicted Secondary structure																									.	.	.	.	.	.																																														.
Template SS confidence
		621	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.							.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.		.	690	.	.	.
		697	.	.			700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.			.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure					.	.																													.	.
Query SS confidence					.	.																													.	.
Query Sequence		Y	S	K	.	.	D	N	E	S	L	D	N	T	D	A	V	V	W	M	T	T	G	T	T	H	V	A	R	A	E	E	W	P	.	.	I	M	P	T	E	W	V	H	T	L	L	K	P	W	N	F	F	D	E	T	P	T	L	G	A	L	K	K
Query Conservation					.	.																													.	.
Alig confidence					.	.																													.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	S	T	F	F	N	G	E	S	L	N	Q	T	D	L	V	V	W	L	N	L	G	M	H	H	V	P	H	T	G	D	L	P	N	T	V	F	T	T	A	H	S	G	V	A	F	T	P	L	N	Y	L	P	G	D	P	S	R	E	T	V	N	M
Template Known Secondary structure		G	G	G	G		S			B		S	S																	G	G	G	S	S		B		T	T	T	S										S		S	S	S		G	G	G	G		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		694	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.