Job Description Q47689 Confidence 17.38% Date Thu Jan 5 12:37:03 GMT 2012 Rank 18 Aligned Residues 404 % Identity 11% Template d1pw4a_ SCOP info MFS general substrate transporter MFS general substrate transporter Glycerol-3-phosphate transporter Resolution 3.30

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		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.						.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																													.	.	.	.	.
Query SS confidence																																													.	.	.	.	.
Query Sequence		M	Q	T	T	Q	Q	N	A	P	L	K	R	T	M	K	T	R	H	L	I	M	L	S	L	G	G	V	I	G	T	G	L	F	F	N	T	G	Y	I	I	S	T	T	.	.	.	.	.	G	A	A	G	T	L	L	A	Y	L	I	G	A	L	V	V	W	L	V	M	Q	C	L	G	E	L	S	V	A	M	P	E
Query Conservation																																													.	.	.	.	.
Alig confidence														.																															.	.	.	.	.																															.	.
Template Conservation														.																																																																		.	.
Template Sequence		L	P	A	A	E	I	D	P	T	Y	R	R	.	L	R	W	Q	I	F	L	G	I	F	F	G	Y	A	A	Y	Y	L	V	R	K	N	F	A	L	A	M	P	Y	L	V	E	Q	G	F	S	R	G	D	L	G	F	A	L	S	G	I	S	I	A	Y	G	F	S	K	F	I	M	G	S	V	S	D	R	S	.	.
Template Known Secondary structure					S									.																					T	S								T	T	S	S	T	T		S	S																											S	.	.
Template Predicted Secondary structure														.																																																																		.	.
Template SS confidence
		14	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.		.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90
		76	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.														.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.
Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	G	A	F	H	V	Y	A	A	R	Y	L	G	P	A	T	G	Y	T	V	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	L	Y	W	L	T	W	T	V	A	L	G	S	S	F	T	A	A	G	F	C	M	Q	Y	W	F	P	Q	V	P	V	W	V	W	C	V	V	F	C	A	I	I	F	G	L	N
Query Conservation																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.
Template Sequence		.	N	P	R	V	F	L	P	A	G	L	I	L	A	A	A	V	M	L	F	M	G	F	V	P	W	A	T	S	S	I	A	V	M	F	V	L	L	F	L	C	G	W	F	Q	G	M	G	W	P	P	C	G	R	T	M	V	H	W	W	S	Q	K	E	R	G	G	I	V	S	V	W	N	C	A	H	N	V	G	G
Template Known Secondary structure		.																												S	S	S	S																T										T	T		T	T	T
Template Predicted Secondary structure		.
Template SS confidence
			91	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		143	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	I	S	T	R	F	F	A	E	G	E	F	W	F	S	L	V	K	V	V	T	I	I	A	F	I	I	L	G	G	A	A	I	F	G	F	I	P	M	Q	D	G	S	P	A	P	G	L	S	N	I	T	A	E	G	W	F	P	H	G	G	L	P	I	L	M	T	M	V	A	V	N	F	A	F	S	G	T	E	L
Query Conservation
Alig confidence																																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	I	P	P	L	L	F	L	L	G	M	A	W	F	N	D	W	H	A	A	L	Y	M	P	A	F	C	A	I	L	V	A	L	F	A	F	A	M	M	R	D	T	P	Q	S	C	G	L	P	P	I	E	E	Y	K	N	D	T	A	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		T	S												T			S	T	T		T																					S	S	T	T	T				S		T	T	T						T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		223	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	G	I	A	A	G	E	T	E	N	P	R	K	V	I	P	V	A	I	R	T	T	I	A	R	L	I	I	F	F	I	G	T	V	F	V	L	A	A	L	I	P	M	Q	Q	V	G	V	E	K	S	P	F	V	L	V	F	E	K	V	G	I	P	Y	A	A	D	I	F	N	F	V	I	L	T	A	I	L	S	A
Query Conservation
Alig confidence		.	.																																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.																																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	Q	I	F	M	Q	Y	V	L	P	N	K	L	L	W	Y	I	A	I	A	N	V	F	V	Y	L	L	R	Y	G	I	L	D	W	S	P	T	Y	L	K	E	V	K	H	F	A	L	D	K	S	S	W	A	Y	F	L	Y	E	Y	A	G	I	P	G	T	L	L	C	G	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.							T	S	S																													B	T	T	B	S																												.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.																																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
				243	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.
		303	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	N	S	G	L	Y	A	S	G	R	M	L	W	S	L	S	N	E	R	T	L	P	A	C	F	A	R	V	T	K	N	G	V	P	L	T	A	L	S	V	S	M	L	G	G	V	L	A	L	F	S	S	V	V	A	P	D	T	V	F	V	A	L	S	A	I	S	G	F	A	V	V	A	V	W	L	S	I	C	A
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	S	D	K	V	F	R	G	N	R	G	A	T	G	V	F	F	M	T	L	V	T	I	A	T	I	V	Y	W	M	N	P	A	G	N	P	T	V	D	M	I	C	M	I	V	I	G	F	L	I	Y	G	P	V	M	L
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					T	S	T	T																				T	T	S			T	T																	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																										312	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.
		383	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	H	F	V	F	R	R	R	H	L	Q	Q	G	K	A	L	S	E	L	H	Y	R	A	P	W	Y	P	L	V	P	V	L	G	F	V	L	C	L	V	A	C	V	G	L	A	F	D	P	A	Q	R	I	A	L	W	C	G	L	P	F	V	A	L	C	Y	G	A	Y	F	L	T	Q	P	R	N	A	K	Q	E	P
Query Conservation
Alig confidence																					.	.	.	.
Template Conservation																					.	.	.	.
Template Sequence		I	G	L	H	A	L	E	L	A	P	K	K	A	A	G	T	A	A	G	.	.	.	.	F	T	G	L	F	G	Y	L	G	G	S	V	A	A	S	A	I	V	G	Y	T	V	D	F	F	G	W	D	G	G	F	M	V	M	I	G	G	S	I	L	A	V	I	L	L	I	V	V	M	I	G	E	K	R	R	H	E
Template Known Secondary structure									T	S		T	T								.	.	.	.																								S	S		S
Template Predicted Secondary structure																					.	.	.	.
Template SS confidence
		368	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.					.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.
		463	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	H	V	A	E
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		Q	L	L	Q	E
Template Known Secondary structure		G	G	G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		444	.	.	.	.