Job Description P24240 Confidence 99.49% Date Thu Jan 5 11:41:32 GMT 2012 Rank 98 Aligned Residues 255 % Identity 16% Template d7a3ha_ SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases beta-glycanases Resolution 0.95

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		74	.	.	.	.		.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.
Predicted Secondary structure							.
Query SS confidence							.
Query Sequence		K	E	D	I	A	.	L	M	A	E	M	G	F	K	V	F	R	T	S	I	A	W	S	R	L	F	P	Q	G	D	E	I	T	P	N	Q	Q	G	I	A	F	Y	R	S	V	F	E	E	C	K	K	Y	G	I	E	P	L	V	T	L	C	H	F	D	V	P	M	H	L	V	T	E	Y	G	S	W	R	N	R	K
Query Conservation							.
Alig confidence							.																.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																							.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	E	S	M	K	W	L	R	D	D	W	G	I	N	V	F	R	A	A	M	Y	.	.	.	.	.	T	S	S	G	G	Y	I	D	D	P	S	V	K	E	K	V	K	E	A	V	E	A	A	I	D	L	D	I	Y	V	I	I	D	W	H	I	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	D	N	D	P	N	I
Template Known Secondary structure												T											.	.	.	.	.	S	S	T	T	S	T	T	T		T	T																T										S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S		S	T	T	T
Template Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		46	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.						.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.											.	.	.	.	.	.	110
		153	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.		.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.
Predicted Secondary structure																							.
Query SS confidence																							.
Query Sequence		L	V	E	F	F	S	R	Y	A	R	T	C	F	E	A	F	D	G	L	V	K	.	Y	W	L	T	F	N	E	I	N	I	M	L	H	S	P	F	S	G	A	G	L	V	F	E	E	G	E	N	Q	D	Q	V	K	Y	Q	A	A	H	H	Q	L	V	A	S	A	L	A	T	K	I	A	H	E	V	N	P	Q	N
Query Conservation																							.
Alig confidence																							.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	K	E	E	A	K	D	F	F	D	E	M	S	E	L	Y	G	D	Y	P	N	V	I	Y	E	I	A	N	E	P	N	G	S	D	V	T	W	G	N	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	K	P	Y	A	E	E	V	I	P	I	I	R	N	N	D	P	N	N
Template Known Secondary structure		T																T	T		T	T							S				S	T	T			T	T	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														T	T		S	S	S
Template Predicted Secondary structure																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		111	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		232	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	V	G	C	M	L	A	G	G	N	F	Y	P	Y	S	C	K	P	E	D	V	W	A	A	L	E	K	D	R	E	N	L	F	F	I	D	V	Q	A	R	G	T	Y	P	A	Y	S	A	R	V	F	R	E	K	G	V	T	I	N	K	A	P	G	D	D	E	I	L	K	N	T	V	D	F	V	S	F	S	Y	Y
Query Conservation
Alig confidence								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	I	I	V	G	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	T	W	S	Q	D	V	H	H	A	A	D	N	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	A	D	P	N	V	M	Y	A	F	H	F	Y
Template Known Secondary structure								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					T	B						T	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S		T	T
Template Predicted Secondary structure								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		170	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.
		312	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	S	R	C	A	S	A	E	M	N	A	N	N	S	S	A	A	N	V	V	K	S	L	R	N	P	Y	L	Q	V	S	D	W	G	W	G	I	D	P	L	G	L	R	I	T	M	N	M	M	Y	D	R	Y	Q	K	P	L	F	L	V	E	N	G	L	G	A	K	D	E	F	A	A	N	G	E	I	N	D	D	Y
Query Conservation
Alig confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.																			.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.																			.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	G	T	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	Q	N	L	R	D	Q	V	D	Y	A	L	.	D	Q	G	A	A	I	F	V	S	E	W	G	T	S	A	A	T	G	.	.	.	.	.	.	.	D	G	G	V
Template Known Secondary structure		T	T	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.		T	T										S	S		T	T	S	.	.	.	.	.	.	.		S
Template Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.																			.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		203	.	.	.																																			.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.		.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.								.	.	.	240
		392	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	I	S	Y	L	R	E	H	I	R	A	M	G	E	A	I	A	D	G	I	P	L	M	G	Y	T	T	W	G	C	I	D	L	V	S	A	S	T	G	E	M	S	K	R	Y	G	F	V	F	V	D	R	D	D	A	G	N	G	T	L	T	R	T	R	K	K	S	F	W	W	Y	K	K	V	I	A	S
Query Conservation
Alig confidence																	.	.	.			.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.																							.
Template Conservation																	.	.	.			.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.																							.
Template Sequence		F	L	D	E	A	Q	V	W	I	D	F	M	D	E	R	.	.	.	N	L	.	.	.	S	W	A	N	W	S	L	T	H	.	.	.	.	.	.	.	.	K	D	E	S	S	A	A	L	M	P	G	A	N	P	T	G	G	W	T	E	A	E	.	L	S	P	S	G	T	F	V	R	E	K	I	R	E
Template Known Secondary structure																T	.	.	.	T		.	.	.								S		.	.	.	.	.	.	.	.		S	S	T	T		S	B		T	T			T	T					G	G	G	.	B
Template Predicted Secondary structure																	.	.	.			.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.																							.
Template SS confidence
		241	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.				.	.				.	.	260	.	.	.	.	.	.									.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.		.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

---

Phyre is for academic use only

Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
© Structural Bioinformatics Group, Imperial College, London Lawrence Kelley, Benjamin Jefferys   Disclaimer Terms and Conditions