Job Description P24240 Confidence 97.33% Date Thu Jan 5 11:41:32 GMT 2012 Rank 140 Aligned Residues 213 % Identity 15% Template d2v3ga1 SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases beta-glycanases Resolution 1.20

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		115	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	S	V	F	E	E	C	K	K	Y	G	I	E	P	L	V	T	L	C	H	F	D	V	P	M	H	L	V	T	E	Y	G	S	W	R	N	R	K	L	V	E	F	F	S	R	Y	A	R	T	C	F	E	A	F	D	G	L	V	K	Y	W	L	T	F	N	E	I	N	I	M	L	H	S	P	F	S	G	A	G	L
Query Conservation
Alig confidence																				.														.	.	.	.	.																	.	.														.	.	.	.
Template Conservation																				.														.	.	.	.	.																	.	.														.	.	.	.
Template Sequence		R	P	Y	A	D	A	V	Y	N	N	G	S	I	L	M	I	T	W	.	E	P	W	E	Y	N	T	V	D	I	K	N	G	.	.	.	.	.	K	A	D	A	Y	I	T	R	M	A	Q	D	M	K	A	Y	.	.	G	K	E	I	W	L	R	P	L	H	E	A	N	.	.	.	.	G	D	W	Y	P	W	A	I
Template Known Secondary structure											T	T								.			T	T								T	T	.	.	.	.	.	T	T															.	.		S							S			T	T	.	.	.	.	S	S	S	S	T	T	S	T
Template Predicted Secondary structure																				.														.	.	.	.	.																	.	.														.	.	.	.
Template SS confidence
		52	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.		70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.						.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.			.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.					.	.	.	.	.	.	.	.
		195	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	F	E	E	G	E	N	Q	D	Q	V	K	Y	Q	A	A	H	H	Q	L	V	A	S	A	L	A	T	K	I	A	H	E	V	N	P	Q	N	Q	V	G	C	M	L	A	G	G	N	F	Y	P	Y	S	C	K	P	E	D	V	W	A	A	L	E	K	D	R	E	N	L	F	F	I	D	V	Q	A	R	G	T	Y
Query Conservation
Alig confidence																								.	.	.	.	.	.	.					.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																								.	.	.	.	.	.	.					.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	Y	S	S	R	V	N	T	N	E	T	Y	I	A	A	F	R	H	I	V	D	I	.	.	.	.	.	.	.	F	R	A	N	.	G	A	T	N	V	K	W	V	F	N	V	N	C	D	N	V	G	N	G	T	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	L	G	H	Y
Template Known Secondary structure		T		T	T																			.	.	.	.	.	.	.				T	.	T		T	T				B					S	S			S	T	T			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	T	T
Template Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.	.	.					.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.								.	.	.	.		.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	170	.
		275	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	A	Y	S	A	R	V	F	R	E	K	G	V	T	I	N	K	A	P	G	D	D	E	I	L	K	N	T	V	D	F	V	S	F	S	Y	Y	A	S	R	C	A	S	A	E	M	N	A	N	N	S	S	A	A	N	V	V	K	S	L	R	N	P	Y	L	Q	V	S	D	W	G	W	G	I	D	P	L	G	L	R
Query Conservation
Alig confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	N	Y	V	D	Y	T	S	I	D	G	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	W	G	T	T	Q	S	W	G	S	Q	W	Q	S	F	D	Q	V	F	S
Template Known Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	G		S	B							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T	T			T	T	T
Template Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		172	.																								.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.
		355	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	T	M	N	M	M	Y	D	R	Y	Q	K	P	L	F	L	V	E	N	G	L	G	A	K	D	E	F	A	A	N	G	E	I	N	D	D	Y	R	I	S	Y	L	R	E	H	I	R	A	M	G	E	A	I	A	D	G	I	P	L	M	G	Y	T	T	W	G	C	I	D	L	V	S	A
Query Conservation
Alig confidence											.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.
Template Conservation											.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.
Template Sequence		R	A	Y	Q	A	L	A	S	I	.	N	K	P	I	I	I	A	E	F	A	S	A	E	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	N	K	A	R	W	I	T	E	A	Y	N	S	I	R	T	S	.	.	.	Y	N	K	V	I	A	A	V	W	F	H	E	N	K	E	T	D	W
Template Known Secondary structure								T	T	S	.	S	S											S	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S																	.	.	.		T	T										B	S	S	S	B
Template Predicted Secondary structure											.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.
Template SS confidence
		206	.	.	.	210	.	.	.	.		.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.											.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.				.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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