Job Description P24240 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:41:32 GMT 2012 Rank 5 Aligned Residues 439 % Identity 33% Template d2j78a1 SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Family 1 of glycosyl hydrolase Resolution 1.65

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		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	S	V	F	P	E	S	F	L	W	G	G	A	L	A	A	N	Q	S	E	G	A	F	R	E	G	D	K	G	L	T	T	V	D	M	I	P	H	G	E	H	R	M	A	V	K	L	G	L	E	K	R	F	Q	L	R	D	D	E	F	Y	P	S	H	E	A	T	D	F	Y	H	R	Y	K	E	D	I	A	L	M
Query Conservation
Alig confidence																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	K	K	F	P	E	G	F	L	W	G	V	A	T	A	S	Y	Q	I	E	G	S	P	L	A	D	G	A	G	M	S	I	W	H	T	F	S	H	T	P	G	N	V	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	G	D	T	G	D	V	A	C	D	H	Y	N	R	W	K	E	D	I	E	I	I
Template Known Secondary structure							T	T																T	T	G	G	G				B							T	S	T	T	S	S	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G			S	S	S	T	T
Template Predicted Secondary structure																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.															.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.
		81	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	E	M	G	F	K	V	F	R	T	S	I	A	W	S	R	L	F	P	Q	G	D	E	I	T	P	N	Q	Q	G	I	A	F	Y	R	S	V	F	E	E	C	K	K	Y	G	I	E	P	L	V	T	L	C	H	F	D	V	P	M	H	L	V	T	E	Y	G	S	W	R	N	R	K	L	V	E	F	F	S	R	Y
Query Conservation
Alig confidence																							.																																											.
Template Conservation																							.																																											.
Template Sequence		E	K	L	G	V	K	A	Y	R	F	S	I	S	W	P	R	I	L	P	E	G	.	T	G	R	V	N	Q	K	G	L	D	F	Y	N	R	I	I	D	T	L	L	E	K	G	I	T	P	F	V	T	I	Y	H	W	D	L	P	F	A	L	Q	L	K	.	G	G	W	A	N	R	E	I	A	D	W	F	A	E	Y
Template Known Secondary structure				T	T														S	T	T	S	.	S	S																				T	T									S	S			B					T	T	.	T	G	G	G	S	T	T
Template Predicted Secondary structure																							.																																											.
Template SS confidence
		69	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.		90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.		.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.
		161	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	R	T	C	F	E	A	F	D	G	L	V	K	Y	W	L	T	F	N	E	I	N	I	M	L	H	S	P	F	S	G	A	G	L	V	F	E	E	G	E	N	Q	D	Q	V	K	Y	Q	A	A	H	H	Q	L	V	A	S	A	L	A	T	K	I	A	H	E	V	N	P	Q	N	Q	V	G	C	M	L	A	G	G
Query Conservation
Alig confidence																																		.	.
Template Conservation																																		.	.
Template Sequence		S	R	V	L	F	E	N	F	G	D	R	V	K	N	W	I	T	L	N	E	P	W	V	V	A	I	V	G	H	L	Y	G	.	.	V	H	A	P	G	M	R	D	I	Y	V	A	F	R	A	V	H	N	L	L	R	A	H	A	R	A	V	K	V	F	R	E	T	V	K	D	G	K	I	G	I	V	F	N	N	G
Template Known Secondary structure										T	T	T																			T	S		.	.	S	S	T	T																															T	T
Template Predicted Secondary structure																																		.	.
Template SS confidence
		147	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.			.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.
		241	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.			.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																							.	.
Query SS confidence																							.	.
Query Sequence		N	F	Y	P	Y	S	C	K	P	E	D	V	W	A	A	L	E	K	D	R	E	.	.	N	L	F	F	I	D	V	Q	A	R	G	T	Y	P	A	Y	S	A	R	V	F	R	E	K	G	V	T	I	N	K	A	P	G	D	D	E	I	L	K	N	T	V	D	F	V	S	F	S	Y	Y	A	S	R	C	A	S	A
Query Conservation																							.	.
Alig confidence																							.	.																										.	.
Template Conservation																																																		.	.
Template Sequence		Y	F	E	P	A	S	E	K	E	E	D	I	R	A	V	R	F	M	H	Q	F	N	N	Y	P	L	F	L	N	P	I	Y	R	G	D	Y	P	E	L	V	L	E	F	A	R	E	Y	L	.	.	P	E	N	Y	K	D	D	M	S	E	I	Q	E	K	I	D	F	V	G	L	N	Y	Y	S	G	H	L	V	K	F
Template Known Secondary structure						S	S	S																S	T										S	S										G	G	G	S	.	.		T	T	G	G	G	G					T				S
Template Predicted Secondary structure																																																		.	.
Template SS confidence
		225	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.			.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.
		319	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.		.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																			.
Query SS confidence																																																			.
Query Sequence		E	M	N	A	N	N	S	S	A	A	N	V	V	K	S	L	R	N	P	Y	L	Q	V	S	D	W	G	W	G	I	D	P	L	G	L	R	I	T	M	N	M	M	Y	D	R	Y	Q	K	P	.	L	F	L	V	E	N	G	L	G	A	K	D	E	F	A	A	N	G	E	I	N	D	D	Y	R	I	S	Y	L	R
Query Conservation																																																			.
Alig confidence										.	.	.	.	.	.	.																																			.
Template Conservation										.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	P	D	A	A	K	V	S	.	.	.	.	.	.	.	F	V	E	R	D	L	P	K	T	A	M	G	W	E	I	V	P	E	G	I	Y	W	I	L	K	K	V	K	E	E	Y	N	P	P	E	V	Y	I	T	E	N	G	A	A	F	D	D	V	V	S	E	D	G	R	V	H	D	Q	N	R	I	D	Y	L	K
Template Known Secondary structure			T	T						.	.	.	.	.	.	.					S	S		B		T	T			B			T																	S															B		T	T	S		B
Template Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		303	.	.	.	.	.	.	310								.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.
		398	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	H	I	R	A	M	G	E	A	I	A	D	G	I	P	L	M	G	Y	T	T	W	G	C	I	D	L	V	S	A	S	T	G	E	M	S	K	R	Y	G	F	V	F	V	D	R	D	D	A	G	N	G	T	L	T	R	T	R	K	K	S	F	W	W	Y	K	K	V	I	A	S	N	G	E	D
Query Conservation
Alig confidence																																			.														.	.	.	.	.
Template Conservation																																			.														.	.	.	.	.
Template Sequence		A	H	I	G	Q	A	W	K	A	I	Q	E	G	V	P	L	K	G	Y	F	V	W	S	L	L	D	N	F	E	W	A	E	G	.	Y	S	K	R	F	G	I	V	Y	V	D	Y	S	.	.	.	.	.	T	Q	K	R	I	V	K	D	S	G	Y	W	Y	S	N	V	V	K	N	N	G	L	E
Template Known Secondary structure													T	T											S	B					G	G	G	G	.	G	G					S					T	T	.	.	.	.	.	T	T																		T
Template Predicted Secondary structure																																			.														.	.	.	.	.
Template SS confidence
		377	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.		410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.						.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.