Job Description P24240 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:41:32 GMT 2012 Rank 28 Aligned Residues 442 % Identity 30% Template d1wcga1 SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Family 1 of glycosyl hydrolase Resolution 1.10

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		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	V	F	P	E	S	F	L	W	G	G	A	L	A	A	N	Q	S	E	G	A	F	R	E	G	D	K	G	L	T	T	V	D	M	I	P	H	G	E	H	R	M	A	V	K	L	G	L	E	K	R	F	Q	L	R	D	D	E	F	Y	P	S	H	E	A	T	D	F	Y	H	R	Y	K	E	D	I	A	L	M	A
Query Conservation
Alig confidence																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	K	F	P	K	D	F	M	F	G	T	S	T	A	S	Y	Q	I	E	G	G	W	N	E	D	G	K	G	E	N	I	W	D	R	L	V	H	T	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	E	V	I	K	D	G	T	N	G	D	I	A	C	D	S	Y	H	K	Y	K	E	D	V	A	I	I	K
Template Known Secondary structure						T	T																T	T	S	T	T				B										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	G	S	T	T	S			S	S	S	T	T
Template Predicted Secondary structure																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.														.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		82	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	M	G	F	K	V	F	R	T	S	I	A	W	S	R	L	F	P	Q	G	D	E	I	T	P	N	Q	Q	G	I	A	F	Y	R	S	V	F	E	E	C	K	K	Y	G	I	E	P	L	V	T	L	C	H	F	D	V	P	M	H	L	V	T	E	Y	G	S	W	R	N	R	K	L	V	E	F	F	S	R	Y	A
Query Conservation
Alig confidence																																																																	.
Template Conservation																																																																	.
Template Sequence		D	L	N	L	K	F	Y	R	F	S	I	S	W	A	R	I	A	P	S	G	V	M	N	S	L	E	P	K	G	I	A	Y	Y	N	N	L	I	N	E	L	I	K	N	D	I	I	P	L	V	T	M	Y	H	W	D	L	P	Q	Y	L	Q	D	L	.	G	G	W	V	N	P	I	M	S	D	Y	F	K	E	Y	A
Template Known Secondary structure				T		S												S	T	T	S		T	T	S																			T	T									S	S			B						T	.	T	G	G	G	S	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																																	.
Template SS confidence
		70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.		.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.
		162	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.				230	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																						.	.	.
Query SS confidence																																																																						.	.	.
Query Sequence		R	T	C	F	E	A	F	D	G	L	V	K	Y	W	L	T	F	N	E	I	N	I	M	L	H	S	P	F	S	G	A	G	L	V	F	E	E	G	E	N	Q	D	Q	V	K	Y	Q	A	A	H	H	Q	L	V	A	S	A	L	A	T	K	I	A	H	E	V	N	P	.	.	.	Q	N	Q	V	G	C	M	L	A
Query Conservation																																																																						.	.	.
Alig confidence																																	.	.																																				.	.	.
Template Conservation																																	.	.
Template Sequence		R	V	L	F	T	Y	F	G	D	R	V	K	W	W	I	T	F	N	E	P	I	A	V	C	K	G	Y	S	I	K	A	.	.	Y	A	P	N	L	N	L	K	T	T	G	H	Y	L	A	G	H	T	Q	L	I	A	H	G	K	A	Y	R	L	Y	E	E	M	F	K	P	T	Q	N	G	K	I	S	I	S	I	S
Template Known Secondary structure									T	T	T																			S	S	S	.	.	S	T	T																															T
Template Predicted Secondary structure																																	.	.
Template SS confidence
		149	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.			180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.
		239	240	.	.	.	.	.	.		.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.		260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.									.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure										.														.																											.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence										.														.																											.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	G	N	F	Y	P	Y	S	.	C	K	P	E	D	V	W	A	A	L	E	K	D	.	R	E	N	L	F	F	I	D	V	Q	A	R	G	T	Y	P	A	Y	S	A	R	V	F	R	E	K	.	.	.	.	.	.	.	.	G	V	T	I	N	K	A	P	G	D	D	E	I	L	K	N	T	V	D	F	V	S	F
Query Conservation										.														.																											.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence										.														.																											.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	V	F	F	M	P	K	N	A	E	S	D	D	D	I	E	T	A	E	R	A	N	Q	F	E	R	G	W	F	G	H	P	V	Y	K	G	D	Y	P	P	I	M	K	K	W	V	D	Q	K	S	K	E	E	G	L	P	W	S	K	L	P	K	F	T	K	D	E	I	K	L	L	K	G	T	A	D	F	Y	A	L
Template Known Secondary structure								S	S	T	T																T									T	S	S	S															T	T		S	S		S	S												T	T			S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		227	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.
		309	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.			.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.		.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.		.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																		.	.																							.																						.
Query SS confidence																		.	.																							.																						.
Query Sequence		S	Y	Y	A	S	R	C	A	S	A	E	M	N	A	N	N	.	.	S	S	A	A	N	V	V	K	S	L	R	N	P	Y	L	Q	V	S	D	W	G	W	.	G	I	D	P	L	G	L	R	I	T	M	N	M	M	Y	D	R	Y	Q	K	P	.	L	F	L	V	E	N	G	L	G	A	K	D	E	F	A	A	N
Query Conservation																		.	.																							.																						.
Alig confidence																		.	.																							.																						.															.	.	.
Template Conservation																																																																															.	.	.
Template Sequence		N	H	Y	S	S	R	L	V	T	F	G	S	D	P	N	P	N	F	N	P	D	A	S	Y	V	T	S	V	D	E	A	W	L	K	P	N	E	T	P	Y	I	I	P	V	P	E	G	L	R	K	L	L	I	W	L	K	N	E	Y	G	N	P	Q	L	L	I	T	E	N	G	Y	G	D	D	G	Q	L	.	.	.
Template Known Secondary structure												S			S	S	T	T	S		G	G	G								G	G	G			S	S				S	S																			T	S												B	S			S	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																															.	.	.
Template SS confidence
		307	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.
		385	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.		.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.
Predicted Secondary structure																									.
Query SS confidence																									.
Query Sequence		G	E	I	N	D	D	Y	R	I	S	Y	L	R	E	H	I	R	A	M	G	E	A	I	.	A	D	G	I	P	L	M	G	Y	T	T	W	G	C	I	D	L	V	S	A	S	T	G	E	M	S	K	R	Y	G	F	V	F	V	D	R	D	D	A	G	N	G	T	L	T	R	T	R	K	K	S	F	W	W	Y	K
Query Conservation																									.
Alig confidence		.	.	.																					.																								.																.	.	.
Template Conservation		.	.	.																																													.																.	.	.
Template Sequence		.	.	.	D	D	F	E	K	I	S	Y	L	K	N	Y	L	N	A	T	L	Q	A	M	Y	E	D	K	C	N	V	I	G	Y	T	V	W	S	L	L	D	N	F	E	W	F	Y	G	.	Y	S	I	H	F	G	L	V	K	I	D	F	N	D	P	.	.	.	Q	R	T	R	T	K	R	E	S	Y	T	Y	F	K
Template Known Secondary structure		.	.	.	S																																		S	B					G	G	G	G	.	G	G	S	B			S					T	T	S	T	.	.	.	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.																																													.																.	.	.
Template SS confidence
					384	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.		.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.				.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.
		464	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	V	I	A	S	N
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		N	V	V	S	T	G
Template Known Secondary structure							S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		457	.	.	460	.	.