Job Description P24240 Confidence 99.93% Date Thu Jan 5 11:41:32 GMT 2012 Rank 56 Aligned Residues 294 % Identity 18% Template d1vjza_ SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases beta-glycanases Resolution 2.05

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		74	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.				.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150
Predicted Secondary structure																																																															.	.	.
Query SS confidence																																																															.	.	.
Query Sequence		K	E	D	I	A	L	M	A	E	M	G	F	K	V	F	R	T	S	I	A	W	S	R	L	F	P	Q	G	D	E	I	T	P	N	Q	Q	G	I	A	F	Y	R	S	V	F	E	E	C	K	K	Y	G	I	E	P	L	V	T	L	C	H	.	.	.	F	D	V	P	M	H	L	V	T	E	Y	G	S	W	R	N
Query Conservation																																																															.	.	.
Alig confidence																																																															.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	E	D	F	L	W	X	A	Q	W	D	F	N	F	V	R	I	P	X	C	H	L	L	W	S	D	R	G	N	P	F	I	I	R	E	D	F	F	E	K	I	D	R	V	I	F	W	G	E	K	Y	G	I	H	I	C	I	S	L	H	R	A	P	G	Y	S	V	N	K	E	V	E	E	K	T	N	L	W	K	D
Template Known Secondary structure											T	T										G	G	G	T	S		S	S		T	T				G	G	G															T											T	T			S		T	T	S			S	S		T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		27	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.
		151	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.				.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																							.	.	.
Query SS confidence																							.	.	.
Query Sequence		R	K	L	V	E	F	F	S	R	Y	A	R	T	C	F	E	A	F	D	G	L	.	.	.	V	K	Y	W	L	T	F	N	E	I	N	I	M	L	H	S	P	F	S	G	A	G	L	V	F	E	E	G	E	N	Q	D	Q	V	K	Y	Q	A	A	H	H	Q	L	V	A	S	A	L	A	T	K	I	A	H	E	V
Query Conservation																							.	.	.
Alig confidence																							.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	T	A	Q	E	A	F	I	H	H	W	S	F	I	A	R	R	Y	K	G	I	S	S	T	H	L	S	F	N	L	I	N	E	P	P	F	P	D	P	Q	I	X	S	V	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	H	N	S	L	I	K	R	T	I	T	E	I	R	K	I
Template Known Secondary structure																				T	T	S		T	T	T						S	S						B	T	T	T	B				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		107	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.
		228	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	P	Q	N	Q	V	G	C	M	L	A	G	G	N	F	Y	P	Y	S	C	K	P	E	D	V	W	A	A	L	E	K	D	R	E	N	L	F	F	I	D	V	Q	A	R	G	T	Y	P	A	Y	S	A	R	V	F	R	E	K	G	V	T	I	N	K	A	P	G	D	D	E	I	L	K	N	T	V	D	F	V	S
Query Conservation
Alig confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	P	E	R	L	I	I	I	D	G	L	G	Y	G	N	I	P	V	D	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	T	I	E	N	T	V	Q	S
Template Known Secondary structure			T	T												T	B			T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				S	S
Template Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		168	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.																																																				.	.	190	.	.	.	.	.	.
		308	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	S	Y	Y	A	S	R	C	A	S	A	E	M	N	A	N	N	S	S	A	A	N	V	V	K	S	L	R	N	P	Y	L	Q	V	S	D	W	G	W	G	I	D	P	L	G	L	R	I	T	M	N	M	M	Y	D	R	Y	Q	K	P	L	F	L	V	E	N	G	L	G	A	K	D	E	F	A	A	N	G	E	I
Query Conservation
Alig confidence																																																									.	.																.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																									.	.																.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		C	R	G	Y	I	P	F	S	V	T	H	Y	K	A	E	W	V	D	S	K	D	F	P	V	P	E	W	P	N	G	W	H	F	G	E	Y	W	N	R	E	K	L	L	E	H	Y	L	T	W	I	K	L	R	Q	K	.	.	G	I	E	V	F	C	G	E	X	G	A	Y	N	K	T	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure							S					S	T	T		T	T	T	T		T	T						S	S	S				T	T																	G	G	G	G	G	.	.	T												T	T	S	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																									.	.																.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		197	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.			.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.
		388	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.			.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																			.	.
Query SS confidence																																																																			.	.
Query Sequence		N	D	D	Y	R	I	S	Y	L	R	E	H	I	R	A	M	G	E	A	I	A	D	G	I	P	L	M	G	Y	T	T	W	G	C	I	D	L	V	S	A	S	T	G	E	M	S	K	R	Y	G	F	V	F	V	D	R	D	D	A	G	N	G	T	L	T	.	.	R	T	R	K	K	S	F	W	W	Y	K	K
Query Conservation																																																																			.	.
Alig confidence																					.	.	.			.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.
Template Conservation																					.	.	.			.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	H	D	V	V	L	K	W	L	E	D	L	L	E	I	F	K	T	L	.	.	.	N	I	.	.	.	G	F	A	L	W	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	R	G	P	F	G	I	L	D	S	E	R	K	D	V	E	Y	E	E	W	Y	G	H	K	L	D	R	K	X	L	E	L	L	R	K
Template Known Secondary structure																				T	.	.	.	T		.	.	.					S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	B	S	T	T	S	S	B	S				T	T							T	T
Template Predicted Secondary structure																					.	.	.			.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		267	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.				.	.				.	.	290	.	.	.												.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

---

Phyre is for academic use only

Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
© Structural Bioinformatics Group, Imperial College, London Lawrence Kelley, Benjamin Jefferys   Disclaimer Terms and Conditions