Job Description P24240 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:41:32 GMT 2012 Rank 32 Aligned Residues 407 % Identity 29% Template d1vffa1 SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Family 1 of glycosyl hydrolase Resolution 2.50

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		1	.	.		.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure					.
Query SS confidence					.
Query Sequence		M	S	V	.	F	P	E	S	F	L	W	G	G	A	L	A	A	N	Q	S	E	G	A	F	R	E	G	D	K	G	L	T	T	V	D	M	I	P	H	G	E	H	R	M	A	V	K	L	G	L	E	K	R	F	Q	L	R	D	D	E	F	Y	P	S	H	E	A	T	D	F	Y	H	R	Y	K	E	D	I	A	L
Query Conservation					.
Alig confidence					.																					.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																										.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		M	P	L	K	F	P	E	M	F	L	F	G	T	A	T	S	S	H	Q	I	E	G	N	N	.	.	.	.	R	W	N	D	W	W	Y	Y	E	Q	I	G	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	P	Y	R	S	G	K	A	C	N	H	W	E	L	Y	R	D	D	I	Q	L
Template Known Secondary structure								T	T									S	T	T	T	S	S			.	.	.	.	T	T	B								T	T	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S			S				T	T
Template Predicted Secondary structure																										.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.					.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.
		80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	A	E	M	G	F	K	V	F	R	T	S	I	A	W	S	R	L	F	P	Q	G	D	E	I	T	P	N	Q	Q	G	I	A	F	Y	R	S	V	F	E	E	C	K	K	Y	G	I	E	P	L	V	T	L	C	H	F	D	V	P	M	H	L	V	T	E	Y	G	S	W	R	N	R	K	L	V	E	F	F	S	R
Query Conservation
Alig confidence																								.	.																																										.
Template Conservation																								.	.																																										.
Template Sequence		M	T	S	L	G	Y	N	A	Y	R	F	S	I	E	W	S	R	L	F	P	E	E	.	.	N	K	F	N	E	D	A	F	M	K	Y	R	E	I	I	D	L	L	L	T	R	G	I	T	P	L	V	T	L	H	H	F	T	S	P	L	W	F	M	K	K	.	G	G	F	L	R	E	E	N	L	K	H	W	E	K
Template Known Secondary structure						T															S	B	T	.	.	T	B																			T	T									S	S			B						T	.	T	G	G	G	S	G	G	G
Template Predicted Secondary structure																								.	.																																										.
Template SS confidence
		59	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80			.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.		.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.
		160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	A	R	T	C	F	E	A	F	D	G	L	V	K	Y	W	L	T	F	N	E	I	N	I	M	L	H	S	P	F	S	G	A	G	L	V	F	E	E	G	E	N	Q	D	Q	V	K	Y	Q	A	A	H	H	Q	L	V	A	S	A	L	A	T	K	I	A	H	E	V	N	P	Q	N	Q	V	G	C	M	L	A	G
Query Conservation
Alig confidence								.																											.	.																																.	.	.
Template Conservation								.																											.	.																																.	.	.
Template Sequence		Y	I	E	K	V	A	.	E	L	L	E	K	V	K	L	V	A	T	F	N	E	P	M	V	Y	V	M	M	G	Y	L	T	A	.	.	Y	W	P	P	F	I	R	S	P	F	K	A	F	K	V	A	A	N	L	L	K	A	H	A	I	A	Y	E	L	L	H	.	.	.	G	K	F	K	V	G	I	V	K	N	I
Template Known Secondary structure								.			T	T	T																			T	S		.	.	S	S	T	T																											T	.	.	.	T	T	S
Template Predicted Secondary structure								.																											.	.																																.	.	.
Template SS confidence
		136	.	.	.	140	.		.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.			.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.				.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.		260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																						.
Query SS confidence																						.
Query Sequence		G	N	F	Y	P	Y	S	C	K	P	E	D	V	W	A	A	L	E	K	D	.	R	E	N	L	F	F	I	D	V	Q	A	R	G	T	Y	P	A	Y	S	A	R	V	F	R	E	K	G	V	T	I	N	K	A	P	G	D	D	E	I	L	K	N	T	V	D	F	V	S	F	S	Y	Y	A	S	R	C	A	S	A
Query Conservation																						.
Alig confidence																						.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	I	I	L	P	A	S	D	K	E	R	D	R	K	A	A	E	K	A	D	N	L	F	N	W	H	F	L	D	A	I	W	S	G	K	Y	R	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	F	K	T	Y	R	I	P	Q	S	D	A	D	F	I	G	V	N	Y	Y	T	A	S	E	V	R	H
Template Known Secondary structure							S	S	S	S															T															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S											S
Template Predicted Secondary structure																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.																.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.
		319	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	M	N	A	N	N	S	S	A	A	N	V	V	K	S	L	R	N	P	Y	L	Q	V	S	D	W	G	W	G	I	D	P	L	G	L	R	I	T	M	N	M	M	Y	D	R	Y	Q	K	P	L	F	L	V	E	N	G	L	G	A	K	D	E	F	A	A	N	G	E	I	N	D	D	Y	R	I	S	Y	L	R	E
Query Conservation
Alig confidence												.	.	.																														.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation												.	.	.																														.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	W	N	P	L	K	F	F	F	E	.	.	.	V	K	L	A	D	I	S	E	R	K	T	Q	M	G	W	S	V	Y	P	K	G	I	Y	M	A	L	K	K	A	.	S	R	Y	G	R	P	L	Y	I	T	E	N	G	I	A	T	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	D	E	W	R	V	E	F	I	I	Q
Template Known Secondary structure			S		G	G	G	T	T			.	.	.							S	S	S			T	T						T											.	G	G	G		S												S	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure												.	.	.																														.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		275	.	.	.	.	280	.	.	.	.				.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.		.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330										.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.
		399	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		H	I	R	A	M	G	E	A	I	A	D	G	I	P	L	M	G	Y	T	T	W	G	C	I	D	L	V	S	A	S	T	G	E	M	S	K	R	Y	G	F	V	F	V	D	R	D	D	A	G	N	G	T	L	T	R	T	R	K	K	S	F	W	W	Y	K	K	V	I	A	S	N	G	E	D
Query Conservation
Alig confidence																																		.														.	.	.	.	.
Template Conservation																																		.														.	.	.	.	.
Template Sequence		H	L	Q	Y	V	H	K	A	I	E	D	G	L	D	V	R	G	Y	F	Y	W	S	F	M	D	N	Y	E	W	K	E	G	.	F	G	P	R	F	G	L	V	E	V	D	Y	Q	.	.	.	.	.	T	F	E	R	R	P	R	K	S	A	Y	V	Y	G	E	I	A	R	S	K	E	I	K
Template Known Secondary structure												T	T											S	B					G	G	G	T	.	T						S					T	T	.	.	.	.	.	T																			T
Template Predicted Secondary structure																																		.														.	.	.	.	.
Template SS confidence
		342	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.		.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.						.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.