Job Description P24240 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:41:32 GMT 2012 Rank 14 Aligned Residues 448 % Identity 30% Template d1v08a_ SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Family 1 of glycosyl hydrolase Resolution 1.9

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		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	S	V	F	P	E	S	F	L	W	G	G	A	L	A	A	N	Q	S	E	G	A	F	R	E	G	D	K	G	L	T	T	V	D	M	I	P	H	G	E	H	R	M	A	V	K	L	G	L	E	K	R	F	Q	L	R	D	D	E	F	Y	P	S	H	E	A	T	D	F	Y	H	R	Y	K	E	D	I	A	L	M
Query Conservation
Alig confidence																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	D	W	F	P	S	D	F	T	F	G	A	A	T	S	A	Y	Q	I	E	G	A	W	N	E	D	G	K	G	E	S	N	W	D	H	F	C	H	N	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	E	R	I	L	D	G	S	N	S	D	I	G	A	N	S	Y	H	M	Y	K	T	D	V	R	L	L
Template Known Secondary structure		G	G	G	S		T	T																T	T	S	T	T				B										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	G	S	T	T	S				S	S	T	T
Template Predicted Secondary structure																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		21	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60														.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.
		81	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.		.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.				.	150	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																								.																																															.	.	.
Query SS confidence																								.																																															.	.	.
Query Sequence		A	E	M	G	F	K	V	F	R	T	S	I	A	W	S	R	L	F	P	Q	G	D	.	E	I	T	P	N	Q	Q	G	I	A	F	Y	R	S	V	F	E	E	C	K	K	Y	G	I	E	P	L	V	T	L	C	H	F	D	V	P	M	H	L	V	T	E	Y	G	S	W	.	.	.	R	N	R	K	L	V	E	F
Query Conservation																								.																																															.	.	.
Alig confidence																								.																																															.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	E	M	G	M	D	A	Y	R	F	S	I	S	W	P	R	I	L	P	K	G	T	K	E	G	G	I	N	P	D	G	I	K	Y	Y	R	N	L	I	N	L	L	L	E	N	G	I	E	P	Y	V	T	I	F	H	W	D	V	P	Q	A	L	E	E	K	Y	G	G	F	L	D	K	S	H	K	S	I	V	E	D
Template Known Secondary structure				T	T		S												S	T	T	S	S	T	T	T																				T	T									S	S			B									G	G	G		T	T	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		88	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.
		157	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.											.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		F	S	R	Y	A	R	T	C	F	E	A	F	D	G	L	V	K	Y	W	L	T	F	N	E	I	N	I	M	L	H	S	P	F	S	G	A	G	L	V	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	E	G	E	N	Q	D	Q	V	K	Y	Q	A	A	H	H	Q	L	V	A	S	A	L	A	T	K	I	A	H	E
Query Conservation																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	T	Y	F	A	K	V	C	F	D	N	F	G	D	K	V	K	N	W	L	T	F	N	D	P	Q	T	F	T	S	F	S	Y	G	T	G	V	F	A	P	G	R	C	S	P	G	L	D	C	A	Y	P	T	G	N	S	L	V	E	P	Y	T	A	G	H	N	I	L	L	A	H	A	E	A	V	D	L	Y	N	K
Template Known Secondary structure														T	T	T																			T	S			S	T	T		B			T	T	S	S	S	S	B	T	T	S		T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		168	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.
				227	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.		260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.																																		.
Query SS confidence		.	.																																		.
Query Sequence		.	.	V	N	P	Q	N	Q	V	G	C	M	L	A	G	G	N	F	Y	P	Y	S	C	K	P	E	D	V	W	A	A	L	E	K	D	.	R	E	N	L	F	F	I	D	V	Q	A	R	G	T	Y	P	A	Y	S	A	R	V	F	R	E	K	G	V	T	I	N	K	A	P	G	D	D	E	I	L	K	N	T	V
Query Conservation		.	.																																		.
Alig confidence		.	.																																		.																												.	.
Template Conservation																																																																	.	.
Template Sequence		H	Y	K	R	D	D	T	R	I	G	L	A	F	D	V	M	G	R	V	P	Y	G	T	S	F	L	D	K	Q	A	E	E	R	S	W	D	I	N	L	G	W	F	L	E	P	V	V	R	G	D	Y	P	F	S	M	R	S	L	A	R	E	R	L	.	.	P	F	F	K	D	E	Q	K	E	K	L	A	G	S	Y
Template Known Secondary structure			T			T	T															S	S	S	S															T										S	S										G	G	G	S	.	.												T	T
Template Predicted Secondary structure																																																																	.	.
Template SS confidence
		248	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310			.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.
		304	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.												.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.		.	.	.	.	.	370	.
Predicted Secondary structure																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.
Query SS confidence																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.
Query Sequence		D	F	V	S	F	S	Y	Y	A	S	R	C	A	S	A	E	M	N	A	N	N	S	S	A	A	N	V	V	K	S	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	N	P	Y	L	Q	V	S	D	W	G	W	G	I	D	P	L	G	L	R	I	T	M	N	M	M	Y	D	R	Y	.	Q	K	P	L	F	L	V
Query Conservation																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.
Alig confidence																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.
Template Conservation
Template Sequence		N	M	L	G	L	N	Y	Y	T	S	R	F	S	K	N	I	D	I	S	P	N	Y	S	P	V	L	N	T	D	D	A	Y	A	S	Q	E	V	N	G	P	D	G	K	P	I	G	P	P	M	G	N	P	W	I	Y	M	Y	P	E	G	L	K	D	L	L	M	I	M	K	N	K	Y	G	N	P	P	I	Y	I	T
Template Known Secondary structure		S																			T	T				S	S	G	G	G	G	G						S	B		T	T	S		B	S	S		B		S	S	S	S		B			T													T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		326	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.
		372	.	.	.	.	.	.	.	380					.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure											.	.	.	.
Query SS confidence											.	.	.	.
Query Sequence		E	N	G	L	G	A	K	D	E	.	.	.	.	F	A	A	N	G	E	I	N	D	D	Y	R	I	S	Y	L	R	E	H	I	R	A	M	G	E	A	I	A	D	G	I	P	L	M	G	Y	T	T	W	G	C	I	D	L	V	S	A	S	T	G	E	M	S	K	R	Y	G	F	V	F	V	D	R	D	D	A	G
Query Conservation											.	.	.	.
Alig confidence											.	.	.	.																																																			.															.	.
Template Conservation																																																																	.															.	.
Template Sequence		E	N	G	I	G	D	V	D	T	K	E	T	P	L	P	M	E	A	A	L	N	D	Y	K	R	L	D	Y	I	Q	R	H	I	A	T	L	K	E	S	I	D	L	G	S	N	V	Q	G	Y	F	A	W	S	L	L	D	N	F	E	W	F	A	G	.	F	T	E	R	Y	G	I	V	Y	V	D	R	N	N	.	.
Template Known Secondary structure											S	S	S																														T	T											S	B					G	G	G	T	.	T	S					S					T	T	T	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																	.															.	.
Template SS confidence
		406	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.		.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.
		448	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	G	T	L	T	R	T	R	K	K	S	F	W	W	Y	K	K	V	I	A	S
Query Conservation
Alig confidence		.	.
Template Conservation		.	.
Template Sequence		.	.	N	C	T	R	Y	M	K	E	S	A	K	W	L	K	E	F	N	T	A
Template Known Secondary structure		.	.	T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.
Template SS confidence
				483	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.