Job Description P24240 Confidence 99.95% Date Thu Jan 5 11:41:32 GMT 2012 Rank 52 Aligned Residues 281 % Identity 16% Template d1rh9a1 SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases beta-glycanases Resolution 1.50

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		71	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.					.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																								.	.	.	.
Query SS confidence																								.	.	.	.
Query Sequence		H	R	Y	K	E	D	I	A	L	M	A	E	M	G	F	K	V	F	R	T	S	I	.	.	.	.	A	W	S	R	L	F	P	Q	G	D	E	I	T	P	N	Q	Q	G	I	A	F	Y	R	S	V	F	E	E	C	K	K	Y	G	I	E	P	L	V	T	L	C	H	F	D	V	P	M	H	L	V	T	E	Y	G
Query Conservation																								.	.	.	.
Alig confidence																								.	.	.	.										.	.
Template Conservation																																					.	.
Template Sequence		I	K	V	T	N	T	F	Q	Q	A	S	K	Y	K	M	N	V	A	R	T	W	A	F	S	H	G	G	S	R	P	L	Q	S	A	P	.	.	G	V	Y	N	E	Q	M	F	Q	G	L	D	F	V	I	S	E	A	K	K	Y	G	I	H	L	I	M	S	L	V	N	N	W	D	A	F	G	G	K	K	Q	Y	V
Template Known Secondary structure														T	T								S	S		S	S	S	S	S		S				T	.	.	T																				T	T									B	S	S	S	S	S	S	B
Template Predicted Secondary structure																																					.	.
Template SS confidence
		68	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.			.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.
		147	.																.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.											.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.
Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	N	R	K	L	V	E	F	F	S	R	Y	A	R	T	C	F	E	A	F	D	G	L	V	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	W	L	T	F	N	E	I	N	I	M	L	H	S	P	F	S	G	A	G	L	V	F	E	E	G	E	N
Query Conservation				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	W	A	V	Q	R	G	Q	K	L	T	S	D	D	D	F	F	T	N	P	M	V	K	G	F	Y	K	N	N	V	K	V	V	L	T	R	V	N	T	I	T	K	V	A	Y	K	D	D	P	T	I	L	S	W	E	L	I	N	E	P	R	C	P	S	D	L	S	G	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure							T	T						G	G	G	G	G	T																			B		T	T	T		S	B	G	G	G		T	T						S		B	S				T	T		T	T	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		146	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.
		202	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	D	Q	V	K	Y	Q	A	A	H	H	Q	L	V	A	S	A	L	A	T	K	I	A	H	E	V	N	P	Q	N	Q	V	G	C	M	L	A	G	G	N	F	Y	P	Y	S	C	K	P	E	D	V	W	A	A	L	E	K	D	R	E	N	L	F	F	I	D	V	Q	A	R	G	T	Y	P	A	Y	S	A	R	V
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	F	Q	N	W	V	L	E	M	A	G	Y	L	K	S	I	D	S	N	H	L	L	E	I	G	L	E	G	F	Y	G	N	D	M	R	Q	Y	N	P	N	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			S	S												G	G	G	G	G	G	S	G	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
												215	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.
		282	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	R	E	K	G	V	T	I	N	K	A	P	G	D	D	E	I	L	K	N	T	V	D	F	V	S	F	S	Y	Y	A	S	R	C	A	S	A	E	M	N	A	N	N	S	S	A	A	N	V	V	K	S	L	R	N	P	Y	L	Q	V	S	D	W	G	W	G	I	D	P	L	G	L	R	I	T	M	N	M	M	Y
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	Y	I	F	G	T	N	F	I	S	N	N	Q	V	Q	G	I	D	F	T	T	I	H	M	Y	P	N	Q	W	L	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	L	T	Q	E	A	Q	D	K	W	A	S	Q	W	I	Q	V	H	I	D	D	S
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.				S								T	S	T	T														S	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
								256	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.
		362	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	R	Y	Q	K	P	L	F	L	V	E	N	G	L	G	A	K	D	E	F	A	A	N	G	E	I	N	D	D	Y	R	I	S	Y	L	R	E	H	I	R	A	M	G	E	A	I	A	D	G	I	P	L	M	G	Y	T	T	W	G	C	I	D	L	V	S	A	S	T	G	E	M	S	K	R	Y	G	F	V
Query Conservation
Alig confidence																			.	.	.	.	.																																									.	.						.
Template Conservation																			.	.	.	.	.																																									.	.						.
Template Sequence		K	M	L	K	K	P	L	L	I	A	E	F	G	K	S	T	K	.	.	.	.	.	T	P	G	Y	T	V	A	K	R	D	N	Y	F	E	K	I	Y	G	T	I	F	N	C	A	K	S	G	G	P	C	G	G	G	L	F	W	Q	V	L	G	.	.	Q	G	M	S	S	.	F	D	D	G	Y	Q	V	V
Template Known Secondary structure					T	S											T	T	.	.	.	.	.	S	T	T																							T	T		S							S		B			.	.	T	T		G	G	.	G			S			B
Template Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.																																									.	.						.
Template SS confidence
		308	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.						.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.			.	.	.	.	.		370	.	.	.	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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