Job Description P24240 Confidence 99.83% Date Thu Jan 5 11:41:32 GMT 2012 Rank 69 Aligned Residues 309 % Identity 17% Template d1r85a_ SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases beta-glycanases Resolution 1.45

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	F	P	E	S	F	L	W	G	G	A	L	A	A	N	Q	S	E	G	A	F	R	E	G	D	K	G	L	T	T	V	D	M	I	P	H	G	E	H	R	M	A	V	K	L	G	L	E	K	R	F	Q	L	R	D	D	E	F	Y	P	S	H	E	A	T	D	F	Y	H	R	Y	K	E	D	I	A	L	M	A	E
Query Conservation
Alig confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					.	.
Template Conservation																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					.	.
Template Sequence		R	Y	K	N	E	F	T	I	G	A	A	V	E	P	Y	Q	L	Q	N	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	D	V	Q	.	.	M	L	K	R	H
Template Known Secondary structure				T	T	T									G	G	G	G	G			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					.	.
Template Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					.	.
Template SS confidence
		23	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.																																																		.	.	.	.			.	.	.	50	.
		83	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.			.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		M	G	F	K	V	F	R	T	S	I	A	W	S	R	L	F	P	Q	G	D	E	I	T	P	N	Q	Q	G	I	A	F	Y	R	S	V	F	E	E	C	K	K	Y	G	I	E	P	.	.	L	V	T	L	C	H	F	D	V	P	M	H	L	V	T	E	Y	G	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																										.	.	.	.	.																		.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																										.	.	.	.	.
Template Sequence		F	N	S	I	V	A	E	N	V	M	K	P	I	S	I	Q	P	E	E	G	K	F	N	F	.	.	.	.	.	E	Q	A	D	R	I	V	K	F	A	K	A	N	G	M	D	I	R	F	H	T	L	V	W	H	S	Q	V	P	Q	W	F	F	L	D	K	E	G	K	P	M	V	N	E	T	D	P	V	K	R	E
Template Known Secondary structure			S					S	S	T	T	S						S	B	T	T	B				.	.	.	.	.													T	T								S			S	T	T			G	G	G	G	B		T	T	S	S	B	G	G	G
Template Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.
Template SS confidence
		52	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.						.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.
		148	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		W	R	N	R	K	L	V	E	F	F	S	R	Y	A	R	T	C	F	E	A	F	D	G	L	V	K	Y	W	L	T	F	N	E	I	N	I	M	L	H	S	P	F	S	G	A	G	L	V	F	E	E	G	E	N	Q	D	Q	V	K	Y	Q	A	A	H	H	Q	L	V	A	S	A	L	A	T	K	I	A	H	E	V
Query Conservation
Alig confidence																																						.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																						.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	N	K	Q	L	L	L	K	R	L	E	T	H	I	K	T	I	V	E	R	Y	K	D	D	I	K	Y	W	D	V	V	N	E	V	V	G	.	.	.	.	.	.	D	D	G	K	L	R	N	S	P	W	Y	Q	I	A	G	I	D	Y	I	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	A	F	Q	A	A	R	K	Y
Template Known Secondary structure																							T	T	T									S		B		.	.	.	.	.	.	T	T	S	S	B										T	T					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																						.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		127	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.							.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.										.	.	.	.	.	.	.	190	.
		228	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	P	Q	N	Q	V	G	C	M	L	A	G	G	N	F	Y	P	Y	S	C	K	P	E	D	V	W	A	A	L	E	K	D	R	E	N	L	F	F	I	D	V	Q	A	R	G	T	Y	P	A	Y	S	A	R	V	F	R	E	K	G	V	T	I	N	K	A	P	G	D	D	E	I	L	K	N	T	V	D	F	V	S
Query Conservation
Alig confidence																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	G	D	N	I	K	L	Y	M	N	D	Y	N	T	E	V	E	P	K	R	T	A	L	Y	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	V	K	Q	L	K	E	E	G	V	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	D	G	I	G
Template Known Secondary structure				T	T	S							S		T	T	S	T	T								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								T	T			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		192	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.															.	.	230	.	.
		308	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	S	Y	Y	A	S	R	C	A	S	A	E	M	N	A	N	N	S	S	A	A	N	V	V	K	S	L	R	N	P	Y	L	Q	V	S	D	W	G	W	G	I	D	P	L	G	L	R	I	T	M	N	M	M	Y	D	R	Y	Q	K	P	L	F	L	V	E	N	G	L	G	A	K	D	E	F	A	A	N	G	E	I
Query Conservation
Alig confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.														.
Template Conservation						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.														.
Template Sequence		H	Q	S	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	Q	I	G	W	P	.	.	.	S	E	A	E	I	E	K	T	I	N	M	F	A	.	A	L	G	L	D	N	Q	I	T	E	L	D	V	S	M	Y	G	W	P	P	R	A	Y	P	T
Template Known Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			S	S	S	S	.	.	.														.		T	T												S	S		S	S					S	S
Template Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.														.
Template SS confidence
		233	.	.	.																													.	.	.	240	.	.				.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.		.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280
		388	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.					410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																								.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																								.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		N	D	D	Y	R	I	S	Y	L	R	E	H	I	R	A	M	G	E	A	I	A	D	.	.	.	.	G	I	P	L	M	G	Y	T	T	W	G	C	I	D	L	V	S	A	S	T	G	E	M	S	K	R	Y	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																								.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																								.	.	.	.																						.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																	.
Template Sequence		Y	D	A	I	P	K	Q	K	F	L	D	Q	A	A	R	Y	D	R	L	F	K	L	Y	E	K	L	S	D	K	I	S	N	V	T	F	W	G	I	A	D	N	H	T	W	L	D	S	.	R	A	D	V	Y	Y	D	A	N	G	N	V	V	V	D	P	N	A	P	Y	A	K	V	E	K	G	K	G	K	D	A	P
Template Known Secondary structure		G	G	G	S																						T	G	G	G							S	S	S	S	T	T	S		G	G	G	G	.	G							T	T	S						T	T	S			S				T	T		S
Template Predicted Secondary structure																																																	.
Template SS confidence
		281	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.		.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.
			438	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.
Query SS confidence		.
Query Sequence		.	F	V	F	V	D	R	D	D	A	G	N	G	T	L	T	R	T	R	K	K	S	F	W	W	Y	K	K
Query Conservation		.
Alig confidence		.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	V	F	G	P	D	Y	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	K	P	A	Y	W	A	I	I	D
Template Known Secondary structure		S	S	B		T	T	S	B	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	B									S
Template Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		360	.	.	.	.	.	.	.											.	.	370	.	.	.	.	.	.	.