Job Description P24240 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:41:32 GMT 2012 Rank 30 Aligned Residues 430 % Identity 23% Template d1qvba_ SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Family 1 of glycosyl hydrolase Resolution 2.40

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		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	V	F	P	E	S	F	L	W	G	G	A	L	A	A	N	Q	S	E	G	A	F	R	E	G	D	K	G	L	T	T	V	D	M	I	P	H	G	E	H	R	M	A	V	K	L	G	L	E	K	R	F	Q	L	R	D	D	E	F	Y	P	S	H	E	A	T	D	F	Y	H	R	Y	K	E	D	I	A	L	M	A
Query Conservation
Alig confidence																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		M	K	F	P	K	D	F	M	I	G	Y	S	S	S	P	F	Q	F	E	A	G	I	P	G	S	E	D	P	N	S	D	W	W	V	W	V	H	D	P	E	N	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	A	G	L	V	S	G	D	F	P	E	N	G	P	G	Y	W	N	L	N	Q	N	D	H	D	L	A	E
Template Known Secondary structure			B			T	T													S			S	T	T				T	T	B													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T	S	S		S			G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.											.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70
		82	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.
Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	M	G	F	K	V	F	R	T	S	I	A	W	S	R	L	F	P	Q	G	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	I	T	P	N	Q	Q	G	I	A	F	Y	R	S	V	F	E	E	C	K	K	Y	G	I	E	P	L	V	T	L	C
Query Conservation																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	L	G	V	N	T	I	R	V	G	V	E	W	S	R	I	F	P	K	P	T	F	N	V	K	V	P	V	E	R	D	E	N	G	S	I	V	H	V	D	V	D	D	K	A	V	E	R	L	D	E	L	A	N	K	E	A	V	N	H	Y	V	E	M	Y	K	D	W	V	E	R	G	R	K	L	I	L	N	L	Y
Template Known Secondary structure			T	T															S	S			T	T	S								T	T	S																			S																	T	T	T							S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		71	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150
		134	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.												.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.
Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		H	F	D	V	P	M	H	L	V	T	E	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	S	W	R	N	R	K	L	V	E	F	F	S	R	Y	A	R	T	C	F	E	A	F	D	G	L	V	K	Y	W	L	T	F	N	E	I	N	I	M	L	H	S	P	F	S	G	A	G	L	V	F	E	E	G	E	N	Q
Query Conservation														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		H	W	P	L	P	L	W	L	H	N	P	I	M	V	R	R	M	G	P	D	R	A	P	S	G	W	L	N	E	E	S	V	V	E	F	A	K	Y	A	A	Y	I	A	W	K	M	G	E	L	P	V	M	W	S	T	M	N	E	P	N	V	V	Y	E	Q	G	Y	M	F	V	K	G	G	F	P	P	G	Y	L	S
Template Known Secondary structure			S			B	T	T	T	B										G	G	G	S		B	G	G	G	S	T																		T	T	S		S																	T		G	G	G			T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		151	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230
		203	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	Q	V	K	Y	Q	A	A	H	H	Q	L	V	A	S	A	L	A	T	K	I	A	H	E	V	N	P	Q	N	Q	V	G	C	M	L	A	G	G	N	F	Y	P	Y	S	C	K	P	E	D	V	W	A	A	L	E	K	D	R	E	N	L	F	F	I	D	V	Q	A	R	G	T	Y	P	A	Y	S	A	R	V	F
Query Conservation
Alig confidence																												.																							.	.																							.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																												.																							.	.																							.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	E	A	A	D	K	A	R	R	N	M	I	Q	A	H	A	R	A	Y	D	N	I	K	R	F	S	.	K	K	P	V	G	L	I	Y	A	F	Q	W	F	E	L	L	E	G	P	A	E	V	.	.	F	D	K	F	K	S	S	K	L	Y	Y	F	T	D	I	V	S	K	G	S	S	I	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure																												.		S														S	S	S			S		.	.									T	S	T	T	T	T					S			S	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																												.																							.	.																							.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		231	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.		.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.			.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
		283	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.					.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																						.	.	.	.
Query SS confidence																																																						.	.	.	.
Query Sequence		R	E	K	G	V	T	I	N	K	A	P	G	D	D	E	I	L	K	N	T	V	D	F	V	S	F	S	Y	Y	A	S	R	C	A	S	A	E	M	N	A	N	N	S	S	A	A	N	V	V	K	S	L	.	.	.	.	R	N	P	Y	L	Q	V	S	D	W	G	W	G	I	D	P	L	G	L	R	I	T	M	N
Query Conservation																																																						.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.																																													.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	I	N	V	E	Y	R	R	D	L	A	N	R	L	D	W	L	G	V	N	Y	Y	S	R	L	V	Y	K	I	V	D	D	K	P	I	I	L	H	G	Y	G	F	L	C	T	P	G	G	I	S	P	A	E	N	P	C	S	D	F	G	W	E	V	Y	P	E	G	L	Y	L	L	L	K
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	S						T	T	T	S	S			S																T	T						T	T	S	G	G	G	S		T	T		B		T	T	S		B	B		T	T			B			T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
										301	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.
		359	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	M	Y	D	R	Y	Q	K	P	L	F	L	V	E	N	G	L	G	A	K	D	E	F	A	A	N	G	E	I	N	D	D	Y	R	I	S	Y	L	R	E	H	I	R	A	M	G	E	A	I	A	D	G	I	P	L	M	G	Y	T	T	W	G	C	I	D	L	V	S	A	S	T	G	E	M	S	K	R	Y	G	F
Query Conservation
Alig confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.	.																																												.
Template Conservation																						.	.	.	.	.	.	.	.	.																																												.
Template Sequence		E	L	Y	N	R	Y	G	V	D	L	I	V	T	E	N	G	V	S	D	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	D	A	L	R	P	A	Y	L	V	S	H	V	Y	S	V	W	K	A	A	N	E	G	I	P	V	K	G	Y	L	H	W	S	L	T	D	N	Y	E	W	A	Q	G	.	F	R	Q	K	F	G	L
Template Known Secondary structure																					T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T		S	S																		T	T											S	B					G	G	G	T	.	T	S	S				S
Template Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.	.	.	.	.																																												.
Template SS confidence
		373	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.										.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.		.	.	.	.	440	.	.
		439	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	F	V	D	R	D	D	A	G	N	G	T	L	T	R	T	R	K	K	S	F	W	W	Y	K	K	V	I	A	S	N	G	E	D	L	E
Query Conservation
Alig confidence								.	.	.	.	.
Template Conservation								.	.	.	.	.
Template Sequence		V	M	V	D	F	K	.	.	.	.	.	T	K	K	R	Y	L	R	P	S	A	L	V	F	R	E	I	A	T	H	N	G	I	P	D	E
Template Known Secondary structure						T	T	.	.	.	.	.	T	T																		T	B			G	G
Template Predicted Secondary structure								.	.	.	.	.
Template SS confidence
		443	.	.	.	.	.						.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.