Job Description P24240 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:41:32 GMT 2012 Rank 20 Aligned Residues 442 % Identity 36% Template d1pbga_ SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Family 1 of glycosyl hydrolase Resolution 2.30

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		1	.	.		.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure					.
Query SS confidence					.
Query Sequence		M	S	V	.	F	P	E	S	F	L	W	G	G	A	L	A	A	N	Q	S	E	G	A	F	R	E	G	D	K	G	L	T	T	V	D	M	I	P	H	G	E	H	R	M	A	V	K	L	G	L	E	K	R	F	Q	L	R	D	D	E	F	Y	P	S	H	E	A	T	D	F	Y	H	R	Y	K	E	D	I	A	L
Query Conservation					.
Alig confidence					.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		M	T	K	T	L	P	K	D	F	I	F	G	G	A	T	A	A	Y	Q	A	E	G	A	T	H	T	D	G	K	G	P	V	A	W	D	K	Y	L	E	D	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	W	Y	T	A	E	P	A	S	D	F	Y	H	K	Y	P	V	D	L	E	L
Template Known Secondary structure								T	T																T	T	S	T	T				B								T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S			S	S	S	T	T
Template Predicted Secondary structure																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.
		80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	A	E	M	G	F	K	V	F	R	T	S	I	A	W	S	R	L	F	P	Q	G	D	E	I	T	P	N	Q	Q	G	I	A	F	Y	R	S	V	F	E	E	C	K	K	Y	G	I	E	P	L	V	T	L	C	H	F	D	V	P	M	H	L	V	T	E	Y	G	S	W	R	N	R	K	L	V	E	F	F	S	R
Query Conservation
Alig confidence																								.																																											.
Template Conservation																								.																																											.
Template Sequence		A	E	E	Y	G	V	N	G	I	R	I	S	I	A	W	S	R	I	F	P	T	G	.	Y	G	E	V	N	E	K	G	V	E	F	Y	H	K	L	F	A	E	C	H	K	R	H	V	E	P	F	V	T	L	H	H	F	D	T	P	E	A	L	H	S	N	.	G	D	F	L	N	R	E	N	I	E	H	F	I	D
Template Known Secondary structure					T	T														S	T	T	S	.	S	S	S																				T									S	S			B						T	.	T	G	G	G	S	T
Template Predicted Secondary structure																								.																																											.
Template SS confidence
		63	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.		.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.		.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140
		160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	A	R	T	C	F	E	A	F	D	G	L	V	K	Y	W	L	T	F	N	E	I	N	I	M	L	H	S	P	F	S	G	A	G	L	V	F	E	E	G	E	N	Q	D	Q	V	K	Y	Q	A	A	H	H	Q	L	V	A	S	A	L	A	T	K	I	A	H	E	V	N	P	Q	N	Q	V	G	C	M	L	A	G
Query Conservation
Alig confidence													.																							.
Template Conservation													.																							.
Template Sequence		Y	A	A	F	C	F	E	E	F	P	E	.	V	N	Y	W	T	T	F	N	E	I	G	P	I	G	D	G	Q	Y	L	V	G	K	.	F	P	P	G	I	K	Y	D	L	A	K	V	F	Q	S	H	H	N	M	M	V	S	H	A	R	A	V	K	L	Y	K	D	K	G	Y	K	G	E	I	G	V	V	H	A	L
Template Known Secondary structure											T	T	.								S											T	S			.	S	T	T				S																										T	T		S	S
Template Predicted Secondary structure													.																							.
Template SS confidence
		141	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.		.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.		.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.
		240	.	.	.	.	.	.		.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.		260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280					.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.				300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310
Predicted Secondary structure									.														.																						.	.	.	.																				.	.	.
Query SS confidence									.														.																						.	.	.	.																				.	.	.
Query Sequence		G	N	F	Y	P	Y	S	.	C	K	P	E	D	V	W	A	A	L	E	K	D	.	R	E	N	L	F	F	I	D	V	Q	A	R	G	T	Y	P	A	Y	S	A	R	.	.	.	.	V	F	R	E	K	G	V	T	I	N	K	A	P	G	D	D	E	I	L	.	.	.	K	N	T	V	D	F	V	S	F	S	Y
Query Conservation									.														.																						.	.	.	.																				.	.	.
Alig confidence									.														.																						.	.	.	.																				.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	T	K	Y	P	Y	D	P	E	N	P	A	D	V	R	A	A	E	L	E	D	I	I	H	N	K	F	I	L	D	A	T	Y	L	G	H	Y	S	D	K	T	M	E	G	V	N	H	I	L	A	E	N	G	G	E	L	D	L	R	D	E	D	F	Q	A	L	D	A	A	K	D	L	N	D	F	L	G	I	N	Y
Template Known Secondary structure							S	S	T	T																T									T	S	S																																		T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		219	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.
		311	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.			.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																									.	.
Query SS confidence																																																									.	.
Query Sequence		Y	A	S	R	C	A	S	A	E	M	N	A	N	N	S	S	A	A	N	V	V	K	S	L	R	N	P	Y	L	Q	V	S	D	W	G	W	G	I	D	P	L	G	L	R	I	T	M	N	M	M	Y	D	R	Y	Q	.	.	K	P	L	F	L	V	E	N	G	L	G	A	K	D	E	F	A	A	N	G	E	I	N
Query Conservation																																																									.	.
Alig confidence													.																																												.	.																	.
Template Conservation													.																																																														.
Template Sequence		Y	M	S	D	W	M	Q	A	F	D	G	.	E	T	E	I	I	K	Y	Q	I	K	G	V	G	R	R	V	A	P	D	Y	V	P	R	W	I	I	Y	P	E	G	L	Y	D	Q	I	M	R	V	K	N	D	Y	P	N	Y	K	K	I	Y	I	T	E	N	G	L	G	Y	K	D	E	F	.	V	D	N	T	V	Y
Template Known Secondary structure		S											.			B		.					T	T	T							T	T			.					T															T	T													B					.		T	T
Template Predicted Secondary structure													.																																																														.
Template SS confidence
		299	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.		310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370		.	.	.	.	.	.
		389	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	D	Y	R	I	S	Y	L	R	E	H	I	R	A	M	G	E	A	I	A	D	G	I	P	L	M	G	Y	T	T	W	G	C	I	D	L	V	S	A	S	T	G	E	M	S	K	R	Y	G	F	V	F	V	D	R	D	D	A	G	N	G	T	L	T	R	T	R	K	K	S	F	W	W	Y	K	K	V	I	A	S
Query Conservation
Alig confidence																																												.														.	.	.	.	.
Template Conservation																																												.														.	.	.	.	.
Template Sequence		D	D	G	R	I	D	Y	V	K	Q	H	L	E	V	L	S	D	A	I	A	D	G	A	N	V	K	G	Y	F	I	W	S	L	M	D	V	F	S	W	S	N	G	.	Y	E	K	R	Y	G	L	F	Y	V	D	F	D	.	.	.	.	.	T	Q	E	R	Y	P	K	K	S	A	H	W	Y	K	K	L	A	E	T
Template Known Secondary structure																						T	T											S	B				B	T	T	T	B	.	T	T	S	B			S					T	T	.	.	.	.	.	T	T
Template Predicted Secondary structure																																												.														.	.	.	.	.
Template SS confidence
		391	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.		.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.						.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.
		469	470	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	G	E	D
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		Q	V	I	E
Template Known Secondary structure
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		465	.	.	.