Job Description P24240 Confidence 99.81% Date Thu Jan 5 11:41:32 GMT 2012 Rank 74 Aligned Residues 266 % Identity 16% Template d1h1na_ SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases beta-glycanases Resolution 1.12

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		41	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		H	R	M	A	V	K	L	G	L	E	K	R	F	Q	L	R	D	D	E	F	Y	P	S	H	E	A	T	D	F	Y	H	R	Y	K	E	D	I	A	L	M	A	E	M	G	F	K	V	F	R	T	S	I	A	W	S	R	L	F	P	Q	G	D	E	I	T	P	N	Q	Q	G	I	A	F	Y	R	S	V	F	E	E
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		A	K	V	F	Q	W	F	G	S	N	E	S	G	A	E	F	G	S	Q	N	L	P	G	V	E	G	K	D	Y	I	W	P	D	P	N	T	I	D	T	L	I	S	K	G	M	N	I	F	R	V	P	F	M	M	E	R	L	V	P	N	S	M	T	G	S	P	D	P	N	Y	L	A	D	L	I	A	T	V	N	A
Template Known Secondary structure				S	S	S									T	T		S	T	T	S	S	S			B	T	T	T	B														T	T														S		S	S	T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80
		121	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.			.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.		.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																	.	.																					.
Query SS confidence																																	.	.																					.
Query Sequence		C	K	K	Y	G	I	E	P	L	V	T	L	C	H	F	D	V	P	M	H	L	V	T	E	Y	G	S	W	R	N	R	.	.	K	L	V	E	F	F	S	R	Y	A	R	T	C	F	E	A	F	D	G	L	.	V	K	Y	W	L	T	F	N	E	I	N	I	M	L	H	S	P	F	S	G	A	G	L	V	F	E
Query Conservation																																	.	.																					.
Alig confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.																					.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	T	Q	K	G	A	Y	A	V	V	D	P	H	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	G	R	Y	Y	N	S	I	I	S	S	P	S	D	F	E	T	F	W	K	T	V	A	S	Q	F	A	S	N	P	L	V	I	F	D	T	D	N	E	Y	H	D	M	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure					T	T										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T			T	T																			T	S	T	T		T	T							S				S	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		81	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.											.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.
		198	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	G	E	N	Q	D	Q	V	K	Y	Q	A	A	H	H	Q	L	V	A	S	A	L	A	T	K	I	A	H	E	V	N	P	Q	N	Q	V	G	C	M	L	A	G	G	N	F	Y	P	Y	S	C	K	P	E	D	V	W	A	A	L	E	K	D	R	E	N	L	F	F	I	D	V	Q	A	R	G	T	Y	P	A	Y
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	T	L	V	L	N	L	N	Q	A	A	I	D	G	I	R	S	A	G	A	T	S	Q	Y	I	F	V	E	G	N	S	W	T	G	A	W	T	W	T	N	V	N	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		T	T			S	S							T	G	G	G	B	S	T	T					S	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
														139	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.
		278	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.			310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																		.	.
Query SS confidence																																		.	.
Query Sequence		S	A	R	V	F	R	E	K	G	V	T	I	N	K	A	P	G	D	D	E	I	L	K	N	T	V	D	F	V	S	F	S	.	.	Y	Y	A	S	R	C	A	S	A	E	M	N	A	N	N	S	S	A	A	N	V	V	K	S	L	R	N	P	Y	L	Q	V	S	D	W	G	W	G	I	D	P	L	G	L	R	I
Query Conservation																																		.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	M	K	S	L	T	D	P	S	D	K	I	I	Y	E	M	H	Q	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	D	S	D	G	S	G	T	S	A	T	C	V	S	S	T	I	G	Q	E
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	G	G				T	T											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S	T	T	S	S	S			S			S		T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																			182	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220
		356	.	.	.	360	.	.				.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Predicted Secondary structure									.	.	.
Query SS confidence									.	.	.
Query Sequence		T	M	N	M	M	Y	D	.	.	.	R	Y	Q	K	P	L	F	L	V	E	N	G	L	G	A	K	D	E	F	A	A	N	G	E	I	N	D	D	Y	R	I	S	Y	L	R	E	H	I	R	A	M	G	E	A	I	A	D	G	I	P	L	M	G	Y	T	T	W	G
Query Conservation									.	.	.
Alig confidence									.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.
Template Conservation																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.
Template Sequence		R	I	T	S	A	T	Q	W	L	R	A	N	G	K	K	G	I	I	G	E	F	A	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	D	N	V	C	E	T	A	I	T	G	M	L	D	Y	M	A	Q	N	.	.	.	T	D	V	W	T	G	A	I	W	W	A
Template Known Secondary structure													T	T												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S																T		.	.	.	T	T	T
Template Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.
Template SS confidence
		221	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.												.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.				.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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