Job Description P24240 Confidence 97.68% Date Thu Jan 5 11:41:32 GMT 2012 Rank 136 Aligned Residues 275 % Identity 14% Template d1ghsa_ SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases beta-glycanases Resolution 2.30

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		74	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	E	D	I	A	L	M	A	E	M	G	F	K	V	F	R	T	S	I	A	W	S	R	L	F	P	Q	G	D	E	I	T	P	N	Q	Q	G	I	A	F	Y	R	S	V	F	E	E	C	K	K	Y	G	I	E	P	L	V	T	L	C	H	F	D	V	P	M	H	L	V	T	E	Y	G	S	W	R	N	R	K	L
Query Conservation
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	D	V	V	Q	L	Y	R	S	K	G	I	N	G	M	R	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	F	A	D	G	.	.	.	.	.	.	.	Q	A	L	S	A	L	R	N	S	G	I	G	L	I	L	D	I	G	N	D	Q	L	A	N	I	A	A	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure												T							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S				.	.	.	.	.	.	.						T	T	T	S										G	G	G								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		16	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.														.	.	.	.	.								.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.
		154	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.			.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.
Predicted Secondary structure																	.	.
Query SS confidence																	.	.
Query Sequence		V	E	F	F	S	R	Y	A	R	T	C	F	E	A	F	.	.	D	G	L	V	K	Y	W	L	T	F	N	E	I	N	I	M	L	H	S	P	F	S	G	A	G	L	V	F	E	E	G	E	N	Q	D	Q	V	K	Y	Q	A	A	H	H	Q	L	V	A	S	A	L	A	T	K	I	A	H	E	V	N	P	Q	N
Query Conservation																	.	.
Alig confidence																	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	S	N	A	A	S	W	V	Q	N	N	V	R	P	Y	Y	P	A	V	N	I	K	Y	I	A	A	G	N	E	V	Q	G	G	A	T	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	I	L	P	A	M	R	N	L	N	A	A	L	S	A	A	G	L	G	A
Template Known Secondary structure													T	T	T	T	T	T	T	S										S			G	G	G	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G																T		T	T
Template Predicted Secondary structure																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		66	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.
			232	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310
Predicted Secondary structure		.
Query SS confidence		.
Query Sequence		.	Q	V	G	C	M	L	A	G	G	N	F	Y	P	Y	S	C	K	P	E	D	V	W	A	A	L	E	K	D	R	E	N	L	F	F	I	D	V	Q	A	R	G	T	Y	P	A	Y	S	A	R	V	F	R	E	K	G	V	T	I	N	K	A	P	G	D	D	E	I	L	K	N	T	V	D	F	V	S	F	S	Y
Query Conservation		.
Alig confidence		.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	K	V	S	T	S	I	R	F	D	E	V	A	N	S	F	P	P	S	A	G	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	K	N	A	Y	M	T	D	V	A	R	L	L	A	S	T	G	A	P	L	L	A	N	V
Template Known Secondary structure		S								G	G	G					S	S	G	G	G			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S	S	T													T
Template Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		122	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.
		311	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.				.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																							.	.	.
Query SS confidence																																																							.	.	.
Query Sequence		Y	A	S	R	C	A	S	A	E	M	N	A	N	N	S	S	A	A	N	V	V	K	S	L	R	N	P	Y	L	Q	V	S	D	W	G	W	G	I	D	P	L	G	L	R	I	T	M	N	M	M	Y	D	R	.	.	.	Y	Q	K	P	L	F	L	V	E	N	G	L	G	A	K	D	E	F	A	A	N	G	E	I
Query Conservation																																																							.	.	.
Alig confidence			.																																																				.	.	.																						.	.	.
Template Conservation			.																																																																												.	.	.
Template Sequence		Y	.	P	Y	F	A	Y	R	D	N	P	G	S	I	S	L	N	Y	A	T	F	Q	P	G	T	T	V	R	D	Q	N	N	G	L	T	Y	T	S	L	F	D	A	M	V	D	A	V	Y	A	A	L	E	K	A	G	A	P	A	V	K	V	V	V	S	E	S	G	W	P	S	A	G	G	F	A	A	S	.	.	.
Template Known Secondary structure			.									T	T	T	S							T		T	T						T	T	T																							T		T	T												S	S	S	S	T	T			.	.	.
Template Predicted Secondary structure			.																																																																												.	.	.
Template SS confidence
		168		.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.
		388	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410						.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																									.	.	.	.	.
Query SS confidence																									.	.	.	.	.
Query Sequence		N	D	D	Y	R	I	S	Y	L	R	E	H	I	R	A	M	G	E	A	I	A	D	G	.	.	.	.	.	I	P	L	M	G	Y	T	T	W	G	C	I	D	L	V	S	A	S	T	G	E	M	S	K	R	Y	G	F	V	F	V	D	R	D	D	A	G	N	G	T	L	T	R	T	R	K
Query Conservation																									.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.																					.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.																																												.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	A	G	N	A	R	T	Y	N	Q	G	L	I	N	H	V	G	G	G	T	P	K	K	R	E	A	L	E	T	Y	I	F	A	M	F	N	E	N	Q	K	T	G	D	A	.	T	E	R	S	F	G	L	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	P	D	K	S	P	A
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.													T	T	G	G	G			S	S			S									S	B			T	T			S	S	G	.	G	G	G	G			S	B	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T	S		B	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.																																												.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
							244	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.		.	.	.	290	.	.	.	.											.	.	.	.	.	300	.

No model constructed - rank, confidence too low

---

Phyre is for academic use only

Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
© Structural Bioinformatics Group, Imperial College, London Lawrence Kelley, Benjamin Jefferys   Disclaimer Terms and Conditions