Job Description P24240 Confidence 99.61% Date Thu Jan 5 11:41:32 GMT 2012 Rank 88 Aligned Residues 257 % Identity 15% Template d1egza_ SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases beta-glycanases Resolution 2.30

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		61	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	P	S	H	E	A	T	D	F	Y	H	R	Y	K	E	D	I	A	L	M	A	E	M	G	F	K	V	F	R	T	S	I	A	W	S	R	L	F	P	Q	G	D	E	I	T	P	N	Q	Q	G	I	A	F	Y	R	S	V	F	E	E	C	K	K	Y	G	I	E	P	L	V	T	L	C	H	F	D	V	P	M	H
Query Conservation
Alig confidence																																					.	.	.																																							.	.	.	.
Template Conservation																																					.	.	.																																							.	.	.	.
Template Sequence		S	N	N	G	W	G	G	E	K	F	Y	T	A	D	T	V	A	S	L	K	K	D	W	K	S	S	I	V	R	A	A	M	G	V	Q	.	.	.	E	S	G	G	Y	L	Q	D	P	A	G	N	K	A	K	V	E	R	V	V	D	A	A	I	A	N	D	M	Y	A	I	I	G	W	H	S	H	S	.	.	.	.
Template Known Secondary structure				T	T	S	S	G	G	G	G		S										T	T												S	.	.	.	S	T	T	S	T	T	T																			T	T										S		.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																					.	.	.																																							.	.	.	.
Template SS confidence
		29	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.				.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.
		141	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.		.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																	.
Query SS confidence																																	.
Query Sequence		L	V	T	E	Y	G	S	W	R	N	R	K	L	V	E	F	F	S	R	Y	A	R	T	C	F	E	A	F	D	G	L	.	V	K	Y	W	L	T	F	N	E	I	N	I	M	L	H	S	P	F	S	G	A	G	L	V	F	E	E	G	E	N	Q	D	Q	V	K	Y	Q	A	A	H	H	Q	L	V	A	S	A	L
Query Conservation																																	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	E	N	N	R	S	E	A	I	R	F	F	Q	E	M	A	R	K	Y	G	N	K	P	N	V	I	Y	E	I	Y	N	E	P	L	Q	V	S	W	S	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	I	K	P	Y	A	E	A
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	G	G																T	T	S	T	T							S				S			T	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
											102	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.																								.	.	.	.	.	.	.	.
		220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	T	K	I	A	H	E	V	N	P	Q	N	Q	V	G	C	M	L	A	G	G	N	F	Y	P	Y	S	C	K	P	E	D	V	W	A	A	L	E	K	D	R	E	N	L	F	F	I	D	V	Q	A	R	G	T	Y	P	A	Y	S	A	R	V	F	R	E	K	G	V	T	I	N	K	A	P	G	D	D	E	I	L
Query Conservation
Alig confidence																.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	I	S	A	I	R	A	I	D	P	D	N	L	I	.	I	V	G	T	P	S	W	S	Q	N	V	D	E	A	S	R	D	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I
Template Known Secondary structure											S	S	S			.									T							T	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.		.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.																																															.
		300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	N	T	V	D	F	V	S	F	S	Y	Y	A	S	R	C	A	S	A	E	M	N	A	N	N	S	S	A	A	N	V	V	K	S	L	R	N	P	Y	L	Q	V	S	D	W	G	W	G	I	D	P	L	G	L	R	I	T	M	N	M	M	Y	D	R	Y	Q	K	P	L	F	L	V	E	N	G	L	G	A	K	D
Query Conservation
Alig confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.
Template Conservation																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.
Template Sequence		N	A	K	N	I	A	Y	T	L	H	F	Y	A	G	T	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	E	S	L	R	N	K	A	R	Q	A	L	N	.	N	G	I	A	L	F	V	T	E	W	G	T	V	N	A	D
Template Known Secondary structure			S	S	S									T	T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	T	T										S	S		T	T
Template Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.
Template SS confidence
		183	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.		.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.
		380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	F	A	A	N	G	E	I	N	D	D	Y	R	I	S	Y	L	R	E	H	I	R	A	M	G	E	A	I	A	D	G	I	P	L	M	G	Y	T	T	W	G	C	I	D	L	V	S	A	S	T	G	E	M	S	K	R	Y	G	F	V	F	V	D	R	D	D	A	G	N	G	T	L	T	R	T	R	K	K	S	F
Query Conservation
Alig confidence			.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.			.	.	.																	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation			.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.			.	.	.																	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	.	.	.	.	.	.	.	N	G	G	V	N	Q	T	E	T	D	A	W	V	T	F	M	R	D	N	.	.	.	N	I	.	.	.	S	N	A	N	W	A	L	N	D	K	N	E	G	A	S	T	.	Y	Y	P	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	K	N	L	T	E	S	G
Template Known Secondary structure		S	.	.	.	.	.	.	.		S																	T	.	.	.	T		.	.	.										S	S	S	T	T		S	.	B		T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S			B
Template Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.			.	.	.																	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		228								.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.				.	.				250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.		.	.	.	.																	270	.	.	.	.	.	.	.
		460	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		W	W	Y	K	K	V	I	A	S
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		K	K	V	K	S	I	I	Q	S
Template Known Secondary structure										T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		278	.	280	.	.	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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