Job Description P24240 Confidence 98.11% Date Thu Jan 5 11:41:32 GMT 2012 Rank 126 Aligned Residues 277 % Identity 16% Template d1aq0a_ SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases beta-glycanases Resolution 2.00

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		74	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	E	D	I	A	L	M	A	E	M	G	F	K	V	F	R	T	S	I	A	W	S	R	L	F	P	Q	G	D	E	I	T	P	N	Q	Q	G	I	A	F	Y	R	S	V	F	E	E	C	K	K	Y	G	I	E	P	L	V	T	L	C	H	F	D	V	P	M	H	L	V	T	E	Y	G	S	W	R	N	R	K	L
Query Conservation
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	T	V	V	S	M	F	K	S	N	G	I	K	S	M	R	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	A	P	N	Q	.	.	.	.	.	.	.	A	A	L	Q	A	V	G	G	T	G	I	N	V	V	V	G	A	P	N	D	V	L	S	N	L	A	A	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure												T							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S				.	.	.	.	.	.	.							T	T	S										G	G	G								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		16	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.														.	.	.	.	.								.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.
		154	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.		.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.
Predicted Secondary structure																	.																																																																.
Query SS confidence																	.																																																																.
Query Sequence		V	E	F	F	S	R	Y	A	R	T	C	F	E	A	F	.	D	G	L	V	K	Y	W	L	T	F	N	E	I	N	I	M	L	H	S	P	F	S	G	A	G	L	V	F	E	E	G	E	N	Q	D	Q	V	K	Y	Q	A	A	H	H	Q	L	V	A	S	A	L	A	T	K	I	A	H	E	V	N	P	Q	N	.
Query Conservation																	.																																																																.
Alig confidence																	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.
Template Conservation																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	A	A	A	A	S	W	V	K	S	N	I	Q	A	Y	P	K	V	S	F	R	Y	V	C	V	G	N	E	V	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	A	T	R	N	L	V	P	A	M	K	N	V	H	G	A	L	V	A	A	G	L	G	H	I
Template Known Secondary structure													T	T	T		T	T	S										S			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	G	G	G	G															T	T		T	T	S
Template Predicted Secondary structure																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		66	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.
		232	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	V	G	C	M	L	A	G	G	N	F	Y	P	Y	S	C	K	P	E	D	V	W	A	A	L	E	K	D	R	E	N	L	F	F	I	D	V	Q	A	R	G	T	Y	P	A	Y	S	A	R	V	F	R	E	K	G	V	T	I	N	K	A	P	G	D	D	E	I	L	K	N	T	V	D	F	V	S	F	S	Y	Y
Query Conservation
Alig confidence																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	V	T	T	S	V	S	Q	A	I	L	G	V	F	S	P	P	S	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	S	F	T	G	E	A	A	A	F	M	G	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	V	Q	F	L	A	R	T	N	A	P	L	M	A	N	I	Y
Template Known Secondary structure									G	G	G					S	S	G	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									T
Template Predicted Secondary structure																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		122	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.											.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170
		312	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.				.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																								.	.	.
Query SS confidence																																																								.	.	.
Query Sequence		A	S	R	C	A	S	A	E	M	N	A	N	N	S	S	A	A	N	V	V	K	S	L	R	N	P	Y	L	Q	V	S	D	W	G	W	G	I	D	P	L	G	L	R	I	T	M	N	M	M	Y	D	R	Y	Q	.	.	.	K	P	L	F	L	V	E	N	G	L	G	A	K	D	E	F	A	A	N	G	E	I	N
Query Conservation																																																								.	.	.
Alig confidence		.	.																																																					.	.	.																				.	.	.	.
Template Conservation		.	.																																																																											.	.	.	.
Template Sequence		.	.	P	Y	L	A	W	A	Y	N	P	S	A	M	D	M	G	Y	A	L	F	N	A	S	G	T	V	V	R	D	G	A	Y	G	Y	Q	N	L	F	D	T	T	V	D	A	F	Y	T	A	M	G	K	H	G	G	S	S	V	K	L	V	V	S	E	S	G	W	P	S	G	G	G	T	A	A	T	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.									T	T	S	S							T				S		S				T	T					S															T	T	T		T	T												S	S	S	S	T	T			.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.																																																																											.	.	.	.
Template SS confidence
				171	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.
		389	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.					.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																													.	.	.	.
Query SS confidence																													.	.	.	.
Query Sequence		D	D	Y	R	I	S	Y	L	R	E	H	I	R	A	M	G	E	A	I	A	D	G	I	P	L	M	G	.	.	.	.	Y	T	T	W	G	C	I	D	L	V	S	A	S	T	G	E	M	S	K	R	Y	G	F	V	F	V	D	R	D	D	A	G	N	G	T	L	T	R	T	R	K
Query Conservation																													.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.																								.	.	.	.										.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.																																					.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	P	A	N	A	R	F	Y	N	Q	H	L	I	N	H	V	G	R	G	T	P	R	H	P	G	A	I	E	T	Y	I	F	A	M	F	N	E	.	N	Q	K	D	S	G	V	E	Q	N	W	G	L	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	P	N	M	Q	H	V
Template Known Secondary structure		.	.	.	.															T	T	T	B		S	S	S	B	S				B			S		S	B			.	T	T	S		S	S	G	G	G				S	B	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T	S		B	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.																																					.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
						245	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280		.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.											.	.	.	.	.	300	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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