Job Description P24240 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:41:32 GMT 2012 Rank 41 Aligned Residues 307 % Identity 15% Template c3emzA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:endo-1,4-beta-xylanase; PDBTitle: crystal structure of xylanase xynb from paenibacillus2 barcinonensis complexed with a conduramine derivative Resolution 2.08 Å

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		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	V	F	P	E	S	F	L	W	G	G	A	L	A	A	N	Q	S	E	G	A	F	R	E	G	D	K	G	L	T	T	V	D	M	I	P	H	G	E	H	R	M	A	V	K	L	G	L	E	K	R	F	Q	L	R	D	D	E	F	Y	P	S	H	E	A	T	D	F	Y	H	R	Y	K	E	D	I	A	L	M	A
Query Conservation
Alig confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	S	Y	A	N	S	F	K	I	G	A	A	V	H	T	R	M	L	Q	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	G	E	F	I	A	K
Template Known Secondary structure		G	G	G	T	T	T															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																						30	.	.	.	.	.	.
		82	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.			130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.			.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																		.	.																.	.
Query SS confidence																																																		.	.																.	.
Query Sequence		E	M	G	F	K	V	F	R	T	S	I	A	W	S	R	L	F	P	Q	G	D	E	I	T	P	N	Q	Q	G	I	A	F	Y	R	S	V	F	E	E	C	K	K	Y	G	I	E	P	L	.	.	V	T	L	C	H	F	D	V	P	M	H	L	V	T	E	.	.	Y	G	S	W	R	N	R	K	L	V	E	F	F
Query Conservation																																																		.	.																.	.
Alig confidence																											.	.	.	.	.																			.	.																.	.
Template Conservation																											.	.	.	.	.
Template Sequence		H	Y	N	S	V	T	A	E	N	Q	M	K	F	E	E	V	H	P	R	E	H	E	Y	T	F	.	.	.	.	.	E	A	A	D	E	I	V	D	F	A	V	A	R	G	I	G	V	R	G	H	T	L	V	W	H	N	Q	T	P	A	W	M	F	E	D	A	S	G	G	T	A	S	R	E	M	M	L	S	R	L
Template Known Secondary structure				S					S	S	T	T	S						S	B	T	T	B				.	.	.	.	.												T	T	T								S	B		S	S	S			G	G	G	G	B		T	T	S	S	B
Template Predicted Secondary structure																											.	.	.	.	.
Template SS confidence
		37	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.						.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.
		158	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	R	Y	A	R	T	C	F	E	A	F	D	G	L	V	K	Y	W	L	T	F	N	E	I	N	I	M	L	H	S	P	F	S	G	A	G	L	V	F	E	E	G	E	N	Q	D	Q	V	K	Y	Q	A	A	H	H	Q	L	V	A	S	A	L	A	T	K	I	A	H	E	V	N	P	Q	N	Q	V	G	C	M	L
Query Conservation
Alig confidence																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.
Template Conservation																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.
Template Sequence		K	Q	H	I	D	T	V	V	G	R	Y	K	D	Q	I	Y	A	W	D	V	V	N	E	A	I	E	D	K	T	D	L	I	M	R	D	T	K	W	L	R	L	L	G	E	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	L	V	Q	A	F	N	M	A	H	E	A	D	P	N	A	L	L	F	Y	N	.
Template Known Secondary structure												T	T	T	T		S									B		S	S	T	T			B									T		T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														T	T	S						.
Template Predicted Secondary structure																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.
Template SS confidence
		112	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.														.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.
		238	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	G	G	N	F	Y	P	Y	S	C	K	P	E	D	V	W	A	A	L	E	K	D	R	E	N	L	F	F	I	D	V	Q	A	R	G	T	Y	P	A	Y	S	A	R	V	F	R	E	K	G	V	T	I	N	K	A	P	G	D	D	E	I	L	K	N	T	V	D	F	V	S	F	S	Y	Y	A	S	R	C	A	S
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	D	Y	N	E	T	D	P	V	K	R	E	K	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	N	L	V	R	S	L	L	D	Q	G	A	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	H	G	I	G	M	Q	G	H	W	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.		S	S		S	S								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											T			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.
Template SS confidence
								178	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.															.	.	.	.	.	.	210	.	.	.
		318	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390			.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																											.	.
Query SS confidence																																																																											.	.
Query Sequence		A	E	M	N	A	N	N	S	S	A	A	N	V	V	K	S	L	R	N	P	Y	L	Q	V	S	D	W	G	W	G	I	D	P	L	G	L	R	I	T	M	N	M	M	Y	D	R	Y	Q	K	P	L	F	L	V	E	N	G	L	G	A	K	D	E	F	A	A	N	G	E	I	N	D	D	.	.	Y	R	I	S	Y
Query Conservation																																																																											.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.																											.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	I	H	G	P	S	M	D	E	I	R	Q	A	I	E	R	Y	A	S	L	.	D	V	Q	L	H	V	T	E	L	D	L	S	V	F	R	H	E	D	Q	R	T	D	L	T	E	P	T	A	E	M	A	E	L
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T	B	S														T	T	.	S												S	S		T	T							S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.
Template SS confidence
																												214	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.		.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.
		396	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.		.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.						.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.
Predicted Secondary structure														.																										.	.	.	.	.
Query SS confidence														.																										.	.	.	.	.
Query Sequence		L	R	E	H	I	R	A	M	G	E	A	I	.	A	D	G	I	P	L	M	G	Y	T	T	W	G	C	I	D	L	V	S	A	S	T	G	E	M	.	.	.	.	.	S	K	R	Y	G	F	V	F	V	D	R	D	D	A	G	N	G	T	L	T	R	T	R	K	K	S	F	W	W	Y
Query Conservation														.																										.	.	.	.	.
Alig confidence														.																								.		.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																						.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	Q	K	R	Y	E	D	I	F	G	L	F	R	E	Y	R	S	N	I	T	S	V	T	F	W	G	V	A	D	N	Y	T	W	L	D	N	.	F	P	V	R	G	R	K	N	W	P	F	V	F	D	T	E	L	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	K	D	S	F	W	R	I
Template Known Secondary structure																T	T	T	T							S	S	S	S	T	T			G	G	G	S	.	S	S	S	T	T						S	S	B		T	T	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	B
Template Predicted Secondary structure																																						.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		267	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.		.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320											.	.	.	.	.	.	.	.