Job Description P24240 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:41:32 GMT 2012 Rank 8 Aligned Residues 438 % Identity 33% Template c3ahxC_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: C: PDB Molecule:beta-glucosidase a; PDBTitle: crystal structure of beta-glucosidase a from bacterium clostridium2 cellulovorans Resolution 1.90 Å

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		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	V	F	P	E	S	F	L	W	G	G	A	L	A	A	N	Q	S	E	G	A	F	R	E	G	D	K	G	L	T	T	V	D	M	I	P	H	G	E	H	R	M	A	V	K	L	G	L	E	K	R	F	Q	L	R	D	D	E	F	Y	P	S	H	E	A	T	D	F	Y	H	R	Y	K	E	D	I	A	L	M	A
Query Conservation
Alig confidence																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	R	F	P	K	D	F	I	F	G	T	A	T	A	A	Y	Q	I	E	G	A	Y	K	E	D	E	K	G	E	S	I	W	D	R	F	S	H	I	P	G	N	V	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	M	H	N	G	D	I	A	C	D	H	Y	H	R	Y	K	E	D	V	Q	L	L	K
Template Known Secondary structure						T	T																T	T	G	G	G				B							T	S	T	T	S	S	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G			T	T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		4	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.															.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		82	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	M	G	F	K	V	F	R	T	S	I	A	W	S	R	L	F	P	Q	G	D	E	I	T	P	N	Q	Q	G	I	A	F	Y	R	S	V	F	E	E	C	K	K	Y	G	I	E	P	L	V	T	L	C	H	F	D	V	P	M	H	L	V	T	E	Y	G	S	W	R	N	R	K	L	V	E	F	F	S	R	Y	A
Query Conservation
Alig confidence																						.																																											.
Template Conservation																						.																																											.
Template Sequence		S	L	G	I	K	S	Y	R	F	S	I	A	W	P	R	I	F	P	K	G	.	F	G	E	I	N	Q	K	G	I	Q	F	Y	R	D	L	I	D	E	L	I	K	N	D	I	E	P	A	I	T	I	Y	H	W	D	L	P	Q	K	L	Q	D	I	.	G	G	W	A	N	P	Q	V	A	D	Y	Y	V	D	Y	A
Template Known Secondary structure			T	T															T	T	S	.	S	S	S																			T	T									S	S			B					T	T	.	T	G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure																						.																																											.
Template SS confidence
		70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.		90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.		.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.
		162	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	T	C	F	E	A	F	D	G	L	V	K	Y	W	L	T	F	N	E	I	N	I	M	L	H	S	P	F	S	G	A	G	L	V	F	E	E	G	E	N	Q	D	Q	V	K	Y	Q	A	A	H	H	Q	L	V	A	S	A	L	A	T	K	I	A	H	E	V	N	P	Q	N	Q	V	G	C	M	L	A	G	G	N
Query Conservation
Alig confidence																																	.	.
Template Conservation																																	.	.
Template Sequence		N	L	L	F	R	E	F	G	D	R	V	K	T	W	I	T	H	N	E	P	W	V	A	S	Y	L	G	Y	A	L	G	.	.	V	H	A	P	G	I	K	D	M	K	M	A	L	L	A	A	H	N	I	L	L	S	H	F	K	A	V	K	A	Y	R	E	L	E	Q	D	G	Q	I	G	I	T	L	N	L	S	T
Template Known Secondary structure									T	T	T																			T	S		.	.	S	S	T	T																													T	T		S	S
Template Predicted Secondary structure																																	.	.
Template SS confidence
		148	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.			.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.
		242	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.		260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320
Predicted Secondary structure																				.
Query SS confidence																				.
Query Sequence		F	Y	P	Y	S	C	K	P	E	D	V	W	A	A	L	E	K	D	.	R	E	N	L	F	F	I	D	V	Q	A	R	G	T	Y	P	A	Y	S	A	R	V	F	R	E	K	G	V	T	I	N	K	A	P	G	D	D	E	I	L	K	N	T	V	D	F	V	S	F	S	Y	Y	A	S	R	C	A	S	A	E	M
Query Conservation																				.
Alig confidence																				.
Template Conservation
Template Sequence		C	Y	S	N	S	A	D	E	E	D	I	A	A	A	H	R	S	D	G	W	N	N	R	W	F	L	D	A	A	L	K	G	T	Y	P	E	D	M	I	K	I	F	S	D	T	N	I	M	P	E	L	P	K	E	L	F	T	E	V	F	E	T	S	D	F	L	G	I	N	Y	Y	T	R	Q	V	V	K	N	N	S
Template Known Secondary structure					S	S	S																T										S	S												T	T							T	T	T	T	T	T	T					S																T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		226	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.
		321	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.		.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																														.
Query SS confidence																																														.
Query Sequence		N	A	N	N	S	S	A	A	N	V	V	K	S	L	R	N	P	Y	L	Q	V	S	D	W	G	W	G	I	D	P	L	G	L	R	I	T	M	N	M	M	Y	D	R	Y	.	Q	K	P	L	F	L	V	E	N	G	L	G	A	K	D	E	F	A	A	N	G	E	I	N	D	D	Y	R	I	S	Y	L	R	E	H
Query Conservation																																														.
Alig confidence					.	.	.	.	.	.																																				.
Template Conservation					.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	A	F	.	.	.	.	.	.	I	G	A	E	S	V	A	M	D	N	P	K	T	E	M	G	W	E	I	Y	P	Q	G	L	Y	D	L	L	T	R	I	H	R	D	Y	G	N	I	D	L	Y	I	T	E	N	G	A	A	F	N	D	M	V	N	R	D	G	K	V	E	D	E	N	R	L	D	Y	L	Y	T	H
Template Known Secondary structure		T	S	G	.	.	.	.	.	.	G	G								S		B		T	T			B			T														S																				T	T	S		B
Template Predicted Secondary structure					.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		306	.	.							.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	R	A	M	G	E	A	I	A	D	G	I	P	L	M	G	Y	T	T	W	G	C	I	D	L	V	S	A	S	T	G	E	M	S	K	R	Y	G	F	V	F	V	D	R	D	D	A	G	N	G	T	L	T	R	T	R	K	K	S	F	W	W	Y	K	K	V	I	A	S	N
Query Conservation
Alig confidence																																	.														.	.	.	.	.
Template Conservation																																	.														.	.	.	.	.
Template Sequence		F	A	A	A	L	S	A	I	E	A	G	V	P	L	K	G	Y	Y	I	W	S	F	M	D	N	F	E	W	A	E	G	.	Y	E	K	R	F	G	I	V	H	V	N	Y	K	.	.	.	.	.	T	Q	E	R	T	I	K	K	S	A	Y	W	Y	K	E	L	I	E	R	S
Template Known Secondary structure											T	T											S	B					G	G	G	G	.	G	G	S				S					T	T	.	.	.	.	.	T						B													T
Template Predicted Secondary structure																																	.														.	.	.	.	.
Template SS confidence
		380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410		.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.						.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.