Job Description P24240 Confidence 98.24% Date Thu Jan 5 11:41:32 GMT 2012 Rank 122 Aligned Residues 278 % Identity 12% Template c2vrqB_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: B: PDB Molecule:alpha-l-arabinofuranosidase; PDBTitle: structure of an inactive mutant of arabinofuranosidase from2 thermobacillus xylanilyticus in complex with a3 pentasaccharide Resolution 2.00 Å

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		74	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	E	D	I	A	L	M	A	E	M	G	F	K	V	F	R	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	I	A	W	S	R	L	F	P	Q	G	D	E	I	T	P	N	Q	Q	G	I	A	F	Y	R	S	V	F	E	E	C	K	K	Y	G	I	E	P
Query Conservation																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	D	V	L	E	A	L	K	Q	M	K	I	P	V	L	R	W	P	G	G	C	F	A	D	E	Y	H	W	K	D	G	V	G	P	R	E	K	R	K	R	M	V	N	T	H	W	G	G	V	I	E	N	N	H	F	G	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	E	F	M	M	L	C	E	L	L	G	C	E	P
Template Known Secondary structure												T							S		S	G	G	G	G	T			G	G	G	G	S	S	S	G	G	G							T	T	T	T	T							S			.	.	.	.	.	.	.	.	.											T
Template Predicted Secondary structure																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		54	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110										.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.
		129	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.												.	.	.	.	.	170					.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.
Predicted Secondary structure																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.
Query SS confidence																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.
Query Sequence		L	V	T	L	C	H	F	D	V	P	M	H	L	V	T	E	Y	G	S	W	R	N	R	K	L	V	E	F	F	S	R	Y	A	R	T	C	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	E	A	F	D	G	.	.	.	.	L	V	K	Y	W	L	T	F	N	E	I	N	I	M	L	H	S	P	F	S	G	A	G
Query Conservation																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.
Alig confidence							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.																			.	.	.	.	.
Template Conservation							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																								.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	I	S	G	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	G	S	G	T	V	Q	E	M	S	E	W	V	E	Y	I	T	F	D	G	E	S	P	M	A	N	W	R	R	E	N	G	R	E	K	P	W	R	I	K	Y	W	G	V	G	N	Q	N	W	G	C	G	G	N	M	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S	S																	S											T	T			S											S		T	T	T	T	T	T			.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																								.	.	.	.	.
Template SS confidence
		125	.	.	.	.																130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.
		194	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.		.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.
Predicted Secondary structure																																				.
Query SS confidence																																				.
Query Sequence		L	V	F	E	E	G	E	N	Q	D	Q	V	K	Y	Q	A	A	H	H	Q	L	V	A	S	A	L	A	T	K	I	A	H	E	V	.	N	P	Q	N	Q	V	G	C	M	L	A	G	G	N	F	Y	P	Y	S	C	K	P	E	D	V	W	A	A	L	E	K	D	R	E	N	L	F	F	I	D	V	Q	A	R	G
Query Conservation																																				.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	A	E	Y	Y	A	D	L	Y	R	Q	F	Q	T	Y	L	R	N	Y	G	D	N	K	L	H	K	I	A	C	G	A	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															T					T	T												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																	185	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.
		273	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	Y	P	A	Y	S	A	R	V	F	R	E	K	G	V	T	I	N	K	A	P	G	D	D	E	I	L	K	N	T	V	D	F	V	S	F	S	Y	Y	A	S	R	C	A	S	A	E	M	N	A	N	N	S	S	A	A	N	V	V	K	S	L	R	N	P	Y	L	Q	V	S	D	W	G	W	G	I	D	P	L	G
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	A	D	Y	H	W	T	E	V	L	M	K	Q	A	A	P	F	M	H	G	L	S	L	H	Y	Y	T	V	P	G	P	W	E	K	K	G	P	A	T	G	F	T	T	D	E	W	W	V	T	L	K	K	A	L	F	M	D	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T													G	G	G		S										S	S		T	T	S				S	S	S																			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
															217	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.
		353	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.					.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.					.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.
Predicted Secondary structure														.	.	.	.																					.	.	.	.
Query SS confidence														.	.	.	.																					.	.	.	.
Query Sequence		L	R	I	T	M	N	M	M	Y	D	R	Y	.	.	.	.	Q	K	P	L	F	L	V	E	N	G	L	G	A	K	D	E	F	A	A	N	.	.	.	.	G	E	I	N	D	D	Y	R	I	S	Y	L	R	E	H	I	R	A	M	G	E	A	I	A	D	G	I	P	L	M	G	Y	T	T	W	G	C	I	D	L
Query Conservation														.	.	.	.																					.	.	.	.
Alig confidence														.	.	.	.																					.	.	.	.																							.	.	.
Template Conservation																																																																.	.	.
Template Sequence		L	V	T	K	H	S	A	I	M	D	V	Y	D	P	D	K	R	I	D	L	I	V	D	E	W	G	T	W	Y	D	V	E	P	G	T	N	P	G	F	L	Y	Q	Q	N	S	I	R	D	A	L	V	A	G	A	T	L	H	I	F	H	R	H	.	.	.	C	D	R	V	R	M	A	N	I	A	Q	L	V	N	V
Template Known Secondary structure															T	T			S														S	T	T	S		G	G	G						B																	T	.	.	.	T	T	T									S	B	S	S
Template Predicted Secondary structure																																																																.	.	.
Template SS confidence
		275	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.				.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.
		425	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	S	A	S	T	G	E	M	S	K	R	Y	G	F	V	F	V	D	R	D	D	A	G	N	G	T	L	T	R	T	R	K	K	S	F	W	W	Y	K	K	V	I	A	S	N	G
Query Conservation
Alig confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	V	I	L	T	E	G	E	.	.	.	.	.	.	.	R	M	L	L	T	P	T	Y	H	V	F	N	M	F	K	V	H	Q	D
Template Known Secondary structure		S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S					T	T	.	.	.	.	.	.	.														G	G	G	G	T	T
Template Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		352	.											.	.	.	.	.	.	360	.								.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380

No model constructed - rank, confidence too low