Job Description P24240 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:41:32 GMT 2012 Rank 12 Aligned Residues 444 % Identity 29% Template c2rgmA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:beta-glucosidase; PDBTitle: rice bglu1 beta-glucosidase, a plant exoglucanase/beta-glucosidase Resolution 1.55 Å

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		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	V	F	P	E	S	F	L	W	G	G	A	L	A	A	N	Q	S	E	G	A	F	R	E	G	D	K	G	L	T	T	V	D	M	I	P	H	G	E	H	R	M	A	V	K	L	G	L	E	K	R	F	Q	L	R	D	D	E	F	Y	P	S	H	E	A	T	D	F	Y	H	R	Y	K	E	D	I	A	L	M	A
Query Conservation
Alig confidence																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	A	F	P	K	R	F	V	F	G	T	V	T	S	A	Y	Q	V	E	G	M	A	A	S	G	G	R	G	P	S	I	W	D	A	F	A	H	T	P	G	N	V	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	N	Q	N	G	D	V	A	T	D	Q	Y	H	R	Y	K	E	D	V	N	L	M	K
Template Known Secondary structure		G	G	S		T	T																T	T	S	T	T				B							T	S	T	T	S	S	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G			S	S	S	T	T
Template Predicted Secondary structure																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		13	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.															.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.
		82	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	M	G	F	K	V	F	R	T	S	I	A	W	S	R	L	F	P	Q	G	D	E	I	T	P	N	Q	Q	G	I	A	F	Y	R	S	V	F	E	E	C	K	K	Y	G	I	E	P	L	V	T	L	C	H	F	D	V	P	M	H	L	V	T	E	Y	G	S	W	R	N	R	K	L	V	E	F	F	S	R	Y	A
Query Conservation
Alig confidence																						.
Template Conservation																						.
Template Sequence		S	L	N	F	D	A	Y	R	F	S	I	S	W	S	R	I	F	P	D	G	.	E	G	R	V	N	Q	E	G	V	A	Y	Y	N	N	L	I	N	Y	L	L	Q	K	G	I	T	P	Y	V	N	L	Y	H	Y	D	L	P	L	A	L	E	K	K	Y	G	G	W	L	N	A	K	M	A	D	L	F	T	E	Y	A
Template Known Secondary structure			T	T														S	T	T	S	.	S	S																				T	T									S	S			B									G	G	G	S	T	T
Template Predicted Secondary structure																						.
Template SS confidence
		79	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.		.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.
		162	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.							.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.				.	.	.	230	.	.
Predicted Secondary structure																																					.	.	.	.	.	.																															.	.	.
Query SS confidence																																					.	.	.	.	.	.																															.	.	.
Query Sequence		R	T	C	F	E	A	F	D	G	L	V	K	Y	W	L	T	F	N	E	I	N	I	M	L	H	S	P	F	S	G	A	G	L	V	F	.	.	.	.	.	.	E	E	G	E	N	Q	D	Q	V	K	Y	Q	A	A	H	H	Q	L	V	A	S	A	L	A	T	K	I	A	H	E	.	.	.	V	N	P	Q	N	Q
Query Conservation																																					.	.	.	.	.	.																															.	.	.
Alig confidence																																					.	.	.	.	.	.																															.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	F	C	F	K	T	F	G	N	R	V	K	H	W	F	T	F	N	E	P	R	I	V	A	L	L	G	Y	D	Q	G	T	N	P	P	K	R	C	T	K	C	A	A	G	G	N	S	A	T	E	P	Y	I	V	A	H	N	F	L	L	S	H	A	A	A	V	A	R	Y	R	T	K	Y	Q	A	A	Q	Q	G	K
Template Known Secondary structure									T	T	T																			T	S			S	T	T				T	T		T	T				T	T	T																								T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		158	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.
		233	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.		260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.
Predicted Secondary structure																													.
Query SS confidence																													.
Query Sequence		V	G	C	M	L	A	G	G	N	F	Y	P	Y	S	C	K	P	E	D	V	W	A	A	L	E	K	D	.	R	E	N	L	F	F	I	D	V	Q	A	R	G	T	Y	P	A	Y	S	A	R	V	F	R	E	K	G	V	T	I	N	K	A	P	G	D	D	E	I	L	K	N	T	V	D	F	V	S	F	S	Y	Y
Query Conservation																													.
Alig confidence																													.																											.	.
Template Conservation																																																								.	.
Template Sequence		V	G	I	V	L	D	F	N	W	Y	E	A	L	S	N	S	T	E	D	Q	A	A	A	Q	R	A	R	D	F	H	I	G	W	Y	L	D	P	L	I	N	G	H	Y	P	Q	I	M	Q	D	L	V	K	D	R	.	.	L	P	K	F	T	P	E	Q	A	R	L	V	K	G	S	A	D	Y	I	G	I	N	Q	Y
Template Known Secondary structure														S	S	S	S															T										S	S										G	G	G	.	.	S												T	T			S	S
Template Predicted Secondary structure																																																								.	.
Template SS confidence
		238	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.			.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.
		312	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.									.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.		.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.		.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.
Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.	.	.	.																				.																						.
Query SS confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.																				.																						.
Query Sequence		A	S	R	C	A	S	A	E	M	N	A	N	N	S	S	A	.	.	.	.	.	.	.	.	A	N	V	V	K	S	L	R	N	P	Y	L	Q	V	S	D	W	G	W	.	G	I	D	P	L	G	L	R	I	T	M	N	M	M	Y	D	R	Y	Q	K	P	.	L	F	L	V	E	N	G	L	G	A	K	D	E	F
Query Conservation																		.	.	.	.	.	.	.	.																				.																						.
Alig confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.																				.																						.
Template Conservation
Template Sequence		T	A	S	Y	M	K	G	Q	Q	L	M	Q	Q	T	P	T	S	Y	S	A	D	W	Q	V	T	Y	V	F	A	K	N	G	K	P	I	G	P	Q	A	N	S	N	W	L	Y	I	V	P	W	G	M	Y	G	C	V	N	Y	I	K	Q	K	Y	G	N	P	T	V	V	I	T	E	N	G	M	D	Q	P	A	N	L
Template Known Secondary structure																							T									T	T			S	S		B		S	S	T	T		B			T														T	T															S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		316	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.
		382	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	A	N	G	E	I	N	D	D	Y	R	I	S	Y	L	R	E	H	I	R	A	M	G	E	A	I	A	D	G	I	P	L	M	G	Y	T	T	W	G	C	I	D	L	V	S	A	S	T	G	E	M	S	K	R	Y	G	F	V	F	V	D	R	D	D	A	G	N	G	T	L	T	R	T	R	K	K	S	F	W	W
Query Conservation
Alig confidence																																																			.														.	.	.	.	.
Template Conservation																																																			.														.	.	.	.	.
Template Sequence		S	R	D	Q	Y	L	R	D	T	T	R	V	H	F	Y	R	S	Y	L	T	Q	L	K	K	A	I	D	E	G	A	N	V	A	G	Y	F	A	W	S	L	L	D	N	F	E	W	L	S	G	.	Y	T	S	K	F	G	I	V	Y	V	D	F	N	.	.	.	.	.	T	L	E	R	H	P	K	A	S	A	Y	W
Template Known Secondary structure																													T	T											S	B					G	G	G	G	.	G	G					S					T	T	.	.	.	.	.	T
Template Predicted Secondary structure																																																			.														.	.	.	.	.
Template SS confidence
		396	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.		.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.						.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		462	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	K	K	V	I	A	S
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		F	R	D	M	L	K	H
Template Known Secondary structure						T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		470	.	.	.	.	.	.