Job Description P24240 Confidence 99.86% Date Thu Jan 5 11:41:32 GMT 2012 Rank 66 Aligned Residues 308 % Identity 17% Template c2fglA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:alkaline thermostable endoxylanase; PDBTitle: an alkali thermostable f/10 xylanase from alkalophilic2 bacillus sp. ng-27 Resolution 2.20 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		4	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	P	E	S	F	L	W	G	G	A	L	A	A	N	Q	S	E	G	A	F	R	E	G	D	K	G	L	T	T	V	D	M	I	P	H	G	E	H	R	M	A	V	K	L	G	L	E	K	R	F	Q	L	R	D	D	E	F	Y	P	S	H	E	A	T	D	F	Y	H	R	Y	K	E	D	I	A	L	M	A	E	M
Query Conservation
Alig confidence																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.
Template Conservation																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.
Template Sequence		Y	E	E	S	F	D	I	G	A	A	V	E	P	H	Q	L	N	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	Q	G	K	V	L	K	.	.	H	H	Y
Template Known Secondary structure		T	T	T	T									G	G	G	S	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.
Template Predicted Secondary structure																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.
Template SS confidence
		15	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.																																																			.	.	.	.	.	.	.			40	.	.
		84	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.			130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.														.
Predicted Secondary structure																																																.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	F	K	V	F	R	T	S	I	A	W	S	R	L	F	P	Q	G	D	E	I	T	P	N	Q	Q	G	I	A	F	Y	R	S	V	F	E	E	C	K	K	Y	G	I	E	P	L	.	.	V	T	L	C	H	F	D	V	P	M	H	L	V	T	E	Y	G	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W
Query Conservation																																																.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																									.	.	.	.	.																			.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																									.	.	.	.	.
Template Sequence		N	S	I	V	A	E	N	A	M	K	P	I	S	L	Q	P	E	E	G	V	F	T	W	.	.	.	.	.	D	G	A	D	A	I	V	E	F	A	R	K	N	N	M	N	L	R	F	H	T	L	V	W	H	N	Q	V	P	D	W	F	F	L	D	E	E	G	N	P	M	V	E	E	T	N	E	A	K	R	Q	A
Template Known Secondary structure		S					S	S	T	T	S						S	B	T	T	B				.	.	.	.	.													T	T								S			S	S	S			G	G	G	G	B		T	T	S	S	B	G	G	G
Template Predicted Secondary structure																									.	.	.	.	.
Template SS confidence
		43	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.						.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.
		149	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	N	R	K	L	V	E	F	F	S	R	Y	A	R	T	C	F	E	A	F	D	G	L	V	K	Y	W	L	T	F	N	E	I	N	I	M	L	H	S	P	F	S	G	A	G	L	V	F	E	E	G	E	N	Q	D	Q	V	K	Y	Q	A	A	H	H	Q	L	V	A	S	A	L	A	T	K	I	A	H	E	V	N
Query Conservation
Alig confidence																																				.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.
Template Conservation																																				.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.
Template Sequence		N	K	E	L	L	L	E	R	L	E	T	H	I	K	T	V	V	E	R	Y	K	D	D	V	T	A	W	D	V	V	N	E	V	V	.	.	.	.	.	.	.	D	D	G	T	P	N	E	R	G	L	R	E	S	V	W	Y	Q	I	T	G	D	E	Y	I	R	V	A	F	E	T	A	R	K	Y	.	.	.	A	G
Template Known Secondary structure																						T	T	T		S							S		B	.	.	.	.	.	.	.		S	S		S	S	T	T		B			S							T	T														.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																				.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.
Template SS confidence
		118	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.								.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.				.	.
		229	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	Q	N	Q	V	G	C	M	L	A	G	G	N	F	Y	P	Y	S	C	K	P	E	D	V	W	A	A	L	E	K	D	R	E	N	L	F	F	I	D	V	Q	A	R	G	T	Y	P	A	Y	S	A	R	V	F	R	E	K	G	V	T	I	N	K	A	P	G	D	D	E	I	L	K	N	T	V	D	F	V	S	F
Query Conservation
Alig confidence															.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation															.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	D	A	K	L	F	I	N	D	Y	N	T	E	.	.	.	.	.	.	V	T	P	K	R	D	H	L	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	L	V	Q	D	L	L	A	D	G	V	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	D	G	V	G	H
Template Known Secondary structure		T	T	S							S		T	T	.	.	.	.	.	.	S	T	T							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									T	T			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure															.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		188	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200							.	.	.	.	.	.	.	.	.																					210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.															.	.	.	.	.	.
		309	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																															.	.	.
Query SS confidence																																																																															.	.	.
Query Sequence		S	Y	Y	A	S	R	C	A	S	A	E	M	N	A	N	N	S	S	A	A	N	V	V	K	S	L	R	N	P	Y	L	Q	V	S	D	W	G	W	G	I	D	P	L	G	L	R	I	T	M	N	M	M	Y	D	R	Y	Q	K	P	L	F	L	V	E	N	G	L	G	A	K	D	E	F	A	A	N	G	.	.	.
Query Conservation																																																																															.	.	.
Alig confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.																								.	.	.
Template Conservation						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.
Template Sequence		Q	A	H	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	I	D	W	P	T	I	D	E	I	R	T	S	M	E	M	F	A	.	G	L	G	L	D	N	Q	V	T	E	L	D	V	S	L	Y	G	W	P	P	R	P	A	F	P	T
Template Known Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S	S	S	S														.	T	T	T												S	S		S	S			S			S	S
Template Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.
Template SS confidence
		228	.	230	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.		250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.
							386	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.										.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	E	I	N	D	D	Y	R	I	S	Y	L	R	E	H	I	R	A	M	G	E	A	I	A	D	G	I	P	L	M	G	Y	T	T	W	G	C	I	D	L	V	S	A	S	T	G	E	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	K	R	Y	G	F	V	F	V	D	R	D	D	A	G	N	G	T	L
Query Conservation		.	.	.	.	.																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.																						.	.	.																						.		.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																												.	.	.																						.																							.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	D	A	I	P	Q	E	R	F	Q	A	Q	A	D	R	Y	N	Q	L	F	E	L	Y	E	E	L	.	.	.	D	A	D	L	S	S	V	T	F	W	G	I	A	D	N	H	T	W	L	D	D	.	R	A	R	E	Y	N	D	G	V	G	K	D	A	P	F	V	F	D	P	N	Y	R	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		S	T	T	S																						T	.	.	.	T	T	T							S	S	S	S	T	T	S		T				.						T	T	T							S	S	B		T	T	S	B	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																												.	.	.																						.																							.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		276	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.				.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.		.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.
		452	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	R	T	R	K	K	S	F	W	W	Y	K	K
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.
Template Conservation		.	.	.
Template Sequence		.	.	.	V	K	P	A	F	W	R	I	I	D
Template Known Secondary structure		.	.	.	B
Template Predicted Secondary structure		.	.	.
Template SS confidence
					345	.	.	.	.	350	.	.	.	.