Job Description P24240 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:41:32 GMT 2012 Rank 33 Aligned Residues 310 % Identity 12% Template c2cncA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:endoxylanase; PDBTitle: family 10 xylanase Resolution 2.4 Å

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		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	F	P	E	S	F	L	W	G	G	A	L	A	A	N	Q	S	E	G	A	F	R	E	G	D	K	G	L	T	T	V	D	M	I	P	H	G	E	H	R	M	A	V	K	L	G	L	E	K	R	F	Q	L	R	D	D	E	F	Y	P	S	H	E	A	T	D	F	Y	H	R	Y	K	E	D	I	A	L	M	A	E
Query Conservation
Alig confidence																						.	.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																						.	.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	Y	K	D	N	F	L	I	G	A	A	L	N	A	T	I	A	S	G	A	.	.	.	.	.	.	D	E	R	L	N	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	I	A	K	E
Template Known Secondary structure			T	T	T	T													T	S		.	.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		39	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.							.	60	.	.	.	.																																												.	.	.	.	.
		83	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.			.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.			.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																															.	.																.	.
Query SS confidence																																															.	.																.	.
Query Sequence		M	G	F	K	V	F	R	T	S	I	A	W	S	R	L	F	P	Q	G	D	E	I	T	P	N	Q	Q	G	I	A	F	Y	R	S	V	F	E	E	C	K	K	Y	G	I	E	.	.	P	L	V	T	L	C	H	F	D	V	P	M	H	L	V	.	.	T	E	Y	G	S	W	R	N	R	K	L	V	E	F	F	S
Query Conservation																																															.	.																.	.
Alig confidence																										.	.	.	.	.																	.	.																.	.
Template Conservation																										.	.	.	.	.
Template Sequence		F	N	S	I	T	P	E	N	C	M	K	W	G	V	L	R	D	A	Q	G	Q	W	N	W	.	.	.	.	.	K	D	A	D	A	F	V	A	F	G	T	K	H	N	L	H	M	V	G	H	T	L	V	W	H	S	Q	I	H	D	E	V	F	K	N	A	D	G	S	Y	I	S	K	A	A	L	Q	K	K	M	E
Template Known Secondary structure			S					S	S	T	T	S					B		T	T	S		B			.	.	.	.	.														T											S	S	S			G	G	G	T	B		T	T	S		B
Template Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.
Template SS confidence
		70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.						.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.
		159	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	Y	A	R	T	C	F	E	A	F	D	G	L	V	K	Y	W	L	T	F	N	E	I	N	I	M	L	H	S	P	F	S	G	A	G	L	V	F	E	E	G	E	N	Q	D	Q	V	K	Y	Q	A	A	H	H	Q	L	V	A	S	A	L	A	T	K	I	A	H	E	V	N	P	Q	N	Q	V	G	C	M	L	A
Query Conservation
Alig confidence																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	H	I	T	T	L	A	G	R	Y	K	G	K	L	A	A	W	D	V	V	N	E	A	V	G	D	D	L	K	M	R	D	S	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	Y	K	I	M	G	D	D	F	I	Y	N	A	F	T	L	A	N	E	V	D	P	K	A	H	L	M	Y	N	D	Y
Template Known Secondary structure												B	T	T	B	S									B		T	T	S	S	B					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						T	T															T	T								S
Template Predicted Secondary structure																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		145	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.																.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		239	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	G	N	F	Y	P	Y	S	C	K	P	E	D	V	W	A	A	L	E	K	D	R	E	N	L	F	F	I	D	V	Q	A	R	G	T	Y	P	A	Y	S	A	R	V	F	R	E	K	G	V	T	I	N	K	A	P	G	D	D	E	I	L	K	N	T	V	D	F	V	S	F	S	Y	Y	A	S	R	C	A	S	A
Query Conservation
Alig confidence																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.
Template Conservation																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	I	E	R	T	G	K	R	E	A	T	V	E	M	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	R	L	Q	K	R	G	M	P	I	H	G	L	G	I	Q	G	H	L	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		S	T	T	S	T	T										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					T	T	T													.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.																																									.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.
		319	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	M	N	A	N	N	S	S	A	A	N	V	V	K	S	L	R	N	P	Y	L	Q	V	S	D	W	G	W	G	I	D	P	L	G	L	R	I	T	M	N	M	M	Y	D	R	Y	Q	K	P	L	F	L	V	E	N	G	L	G	A	K	D	E	F	A	A	N	G	E	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	I	D	T	P	P	I	A	E	I	E	K	S	I	I	A	F	A	.	K	L	G	L	R	V	H	F	T	S	L	D	V	D	V	L	P	S	V	W	E	L	P	V	A	E	V	S	T	R	F	E	Y	K	P	E
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S	S		S														.	T	T	T													S			S	T	T			G	G	G	T	T	T	T	T	S			G	G
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.
Template SS confidence
																											244	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.		.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.
													388	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.						.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	D	D	Y	R	I	S	Y	L	R	E	H	I	R	A	M	G	E	A	I	A	D	G	I	P	L	M	G	Y	T	T	W	G	C	I	D	L	V	S	A	S	T	G	E	M	S	K	.	.	.	.	.	R	Y	G	F	V	F	V	D	R	D	D	A	G	N	G	T	L
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.																													.				.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																									.	.	.																													.																			.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	D	P	Y	T	K	G	L	P	Q	E	M	Q	D	K	L	A	K	R	Y	E	D	L	.	.	.	F	K	L	F	I	K	H	S	D	K	I	D	R	V	T	F	W	G	V	S	D	D	A	S	W	L	N	D	.	F	S	I	P	G	R	T	N	Y	P	L	L	F	D	R	K	L	Q	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		G	S	T	T	T	T																		.	.	.							T	T	T	T							S		S	B	G	G	G		G	G	G	T	.	S	S	S	T	T						S	S	B		T	T	S		.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																									.	.	.																													.																			.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		298	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320				.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.		.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.
		452	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	R	T	R	K	K	S	F	W	W	Y	K	K	V	I	A
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.
Template Conservation		.	.	.
Template Sequence		.	.	.	P	K	D	A	Y	F	R	L	L	D	L	K	R
Template Known Secondary structure		.	.	.	B
Template Predicted Secondary structure		.	.	.
Template SS confidence
					367	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.