Job Description P24240 Confidence 99.71% Date Thu Jan 5 11:41:32 GMT 2012 Rank 80 Aligned Residues 280 % Identity 21% Template c1uhvD_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: D: PDB Molecule:beta-xylosidase; PDBTitle: crystal structure of beta-d-xylosidase from2 thermoanaerobacterium saccharolyticum, a family 393 glycoside hydrolase Resolution 2.10 Å

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		73	.	.	.	.	.	.	80		.	.	.	.	.	.	.	.	.	90														.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure										.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence										.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	K	E	D	I	A	L	M	.	A	E	M	G	F	K	V	F	R	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	I	A	W	S	R	L	F	P	Q	G	D	E	I	T	P	N	Q	Q	G	I	A	F	Y	R	S	V	F	E	E	C	K	K	Y	G	I	E	P	L	V	T	L	C	H	F	D	V	P
Query Conservation										.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence										.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.
Template Conservation																																															.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.
Template Sequence		Y	I	E	T	L	K	Y	V	K	E	N	I	D	F	K	Y	I	R	G	H	G	L	L	C	D	D	V	G	I	Y	R	E	D	V	V	G	D	E	V	K	P	F	Y	N	F	.	.	.	.	.	.	.	.	T	Y	I	D	R	I	F	D	S	F	L	E	I	G	I	R	P	F	V	E	I	G	.	.	F	M	P
Template Known Secondary structure											T	T	S								S		T	T	S	T	T	T	T								T	T									.	.	.	.	.	.	.	.														T									.	.		B
Template Predicted Secondary structure																																															.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.
Template SS confidence
		35	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.									80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.			.	.	.
		139	140	.	.	.									.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.						.	.	.	.			.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.
Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.					.	.
Query SS confidence							.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.					.	.
Query Sequence		M	H	L	V	T	.	.	.	.	.	.	.	.	E	Y	G	S	W	R	N	R	K	L	V	E	F	F	S	R	Y	A	R	T	C	F	E	A	F	D	G	L	.	.	.	.	.	V	K	Y	W	.	.	L	T	F	N	E	I	N	I	M	L	H	S	P	F	S	G	A	G	L	V	F	E	E	G	E	N	Q	D
Query Conservation							.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.					.	.
Alig confidence							.	.	.	.	.	.	.	.		.																											.	.	.	.	.					.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																.																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	K	L	A	S	G	T	Q	T	V	F	Y	W	E	.	G	N	V	T	P	P	K	D	Y	E	K	W	S	D	L	V	K	A	V	L	H	H	F	I	S	R	Y	G	I	E	E	V	L	K	W	P	F	E	I	W	N	E	P	N	L	K	E	F	W	K	D	A	D	E	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		G	G	G	B	S	S					T	T	T	T	.				S		B	S																										T	T						S	S		T	T	S	T	T	T	S	G	G	G				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																.																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		105	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.		.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.
		204	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	V	K	Y	Q	A	A	H	H	Q	L	V	A	S	A	L	A	T	K	I	A	H	E	V	N	P	Q	N	Q	V	G	C	M	L	A	G	G	N	F	Y	P	Y	S	C	K	P	E	D	V	W	A	A	L	E	K	D	R	E	N	L	F	F	I	D	V	Q	A	R	G	T	Y	P	A	Y	S	A	R	V	F	R
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	E	Y	F	K	L	Y	K	V	T	A	K	A	I	K	E	V	N	E	N	L	K	V	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	A	I	C	G	G	A	D	Y	W	I	E	D	F	L	N
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.																		T	T	S					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					S	S		T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
										174	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.
		284	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	K	G	V	T	I	N	K	A	P	G	D	D	E	I	L	K	N	T	V	D	F	V	S	F	S	Y	Y	A	S	R	C	A	S	A	E	M	N	A	N	N	S	S	A	A	N	V	V	K	S	L	R	N	P	Y	L	Q	V	S	D	W	G	W	G	I	D	P	L	G	L	R	I	T	M	N	M	M	Y	D	R
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	C	Y	E	E	N	V	P	V	D	F	V	S	R	H	A	Y	T	S	K	Q	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	Y	T	P	H	L	I	Y	Q	E	I	M	P	S	E	Y	M	L	N	E	F	K	T	V	R	E	I
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				T	T	T				S									B				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				S	S						B
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
													214	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.
		364							.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.
Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.																																																																							.	.	.
Query SS confidence			.	.	.	.	.	.																																																																							.	.	.
Query Sequence		Y	.	.	.	.	.	.	Q	K	P	L	F	L	V	E	N	G	L	G	A	K	D	E	F	A	A	N	G	E	I	N	D	D	Y	R	I	S	Y	L	R	E	H	I	R	A	M	G	E	A	I	A	D	G	I	P	L	M	G	Y	T	T	W	G	C	I	D	L	V	S	A	S	T	G	E	M	S	K	.	.	.
Query Conservation			.	.	.	.	.	.																																																																							.	.	.
Alig confidence			.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.																							.	.																	.	.	.
Template Conservation																																.	.	.	.	.	.	.																							.	.
Template Sequence		I	K	N	S	H	F	P	N	L	P	F	H	I	T	E	Y	N	T	S	Y	S	P	Q	N	P	V	H	D	T	P	.	.	.	.	.	.	.	F	N	A	A	Y	I	A	R	I	L	S	E	G	G	D	Y	V	D	S	F	S	Y	.	.	W	T	F	S	D	V	F	E	E	R	D	V	P	R	S	Q	F	H	G
Template Known Secondary structure				T	S	S	S	T	T										S		S		T	T		G	G	G	G	S		.	.	.	.	.	.	.																		S					.	.	S		S	B	S				T	T	S	S			S	S		S
Template Predicted Secondary structure																																.	.	.	.	.	.	.																							.	.
Template SS confidence
		263	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.								.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.			.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.
		435	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	Y	G	F	V	F	V	D	R	D	D	A	G	N	G	T	L	T	R	T	R	K	K	S	F	W	W	Y	K
Query Conservation
Alig confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	F	G	L	V	A	L	N	M	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	K	P	T	F	Y	T	F	K
Template Known Secondary structure			S		S			T	T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		334	.	.	.	.	.	340	.	.	.											.	.	.	.	.	.	350	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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