Job Description P24240 Confidence 98.37% Date Thu Jan 5 11:41:32 GMT 2012 Rank 118 Aligned Residues 233 % Identity 19% Template c1nofA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:xylanase; PDBTitle: the first crystallographic structure of a xylanase from2 glycosyl hydrolase family 5: implications for catalysis Resolution 1.42 Å

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		83	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.					.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																	.	.	.	.
Query Sequence		M	G	F	K	V	F	R	T	S	I	A	W	S	R	L	F	P	Q	G	D	E	I	T	P	N	Q	Q	G	I	A	F	Y	R	S	V	F	E	E	C	K	K	Y	G	I	E	P	L	V	T	L	C	H	F	D	V	P	M	H	L	V	T	E	Y	.	.	.	.	G	S	W	R	N	R	K	L	V	E	F	F	S
Query Conservation																																																																	.	.	.	.
Alig confidence												.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.																			.	.												.	.	.	.
Template Conservation												.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.																			.	.
Template Sequence		I	G	L	S	I	M	R	V	R	I	.	.	.	.	.	.	.	D	P	D	S	S	K	W	N	I	Q	.	.	.	.	.	L	P	S	A	R	Q	A	V	S	L	G	A	K	I	M	A	T	P	.	.	W	S	P	P	A	Y	M	K	S	N	N	S	L	I	N	G	G	R	L	L	P	A	N	Y	S	A	Y	T
Template Known Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.		S	S	G	G	G	G	G	G	G	.	.	.	.	.										T	T								.	.	S				G	G	G	B	T	T	S	S	S	B	S			B	B		G	G	G
Template Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.																			.	.
Template SS confidence
		75	.	.	.	.	80	.	.	.	.								.	.	.	.	.	90	.	.	.	.						.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.			.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140
		159	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170				.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure														.	.	.
Query SS confidence														.	.	.
Query Sequence		R	Y	A	R	T	C	F	E	A	F	D	G	.	.	.	L	V	K	Y	W	L	T	F	N	E	I	N	I	M	L	H	S	P	F	S	G	A	G	L	V	F	E	E	G	E	N	Q	D	Q	V	K	Y	Q	A	A	H	H	Q	L	V	A	S	A	L	A	T	K	I	A	H	E	V	N	P	Q	N	Q	V	G	C
Query Conservation														.	.	.
Alig confidence														.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																													.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	H	L	L	D	F	S	K	Y	M	Q	T	N	G	A	P	L	Y	A	I	S	I	Q	N	E	P	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	K	P	D	Y	E	S	C	E	W	S	G	D	E	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	S	Y	L	K	S	Q	G	S	K	F	G	S	L	K	V	I	V
Template Known Secondary structure														T	T				S				S		S		T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.				S	S	B			B							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								G	G	G	G	T	T	S
Template Predicted Secondary structure																													.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		141	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.										.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.												.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200
		236	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	L	A	G	G	N	F	Y	P	Y	S	C	K	P	E	D	V	W	A	A	L	E	K	D	R	E	N	L	F	F	I	D	V	Q	A	R	G	T	Y	P	A	Y	S	A	R	V	F	R	E	K	G	V	T	I	N	K	A	P	G	D	D	E	I	L	K	N	T	V	D	F	V	S	F	S	Y	Y	A	S	R	C
Query Conservation
Alig confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	E	S	L	G	F	N	P	A	L	T	D	P	V	L	K	D	S	D	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	K	Y	V	S	I	I	G	G	H	L	Y	G	T	T	P
Template Known Secondary structure					T	T			G	G	G	T					T					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T									T	T	S
Template Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		201	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.
		316	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	S	A	E	M	N	A	N	N	S	S	A	A	N	V	V	K	S	L	R	N	P	Y	L	Q	V	S	D	W	G	W	G	I	D	P	L	G	L	R	I	T	M	N	M	M	Y	D	R	Y	Q	K	P	L	F	L	V	E	N	G	L	G	A	K	D	E	F	A	A	N	G	E	I	N	D	D	Y	R	I	S	Y
Query Conservation
Alig confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.
Template Conservation						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	P	Y	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	A	Q	N	A	G	K	Q	L	W	M	T	E	H	Y	V	D	S	K	Q	S	A	.	.	.	.	.	.	N	N	W	T	S	A	I	E
Template Known Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					T	T										S		T	T	S		T	.	.	.	.	.	.	T
Template Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		237	.	.	240																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.							.	.	.	.	.	.	.	270
		396	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	R	E	H	I	R	A	M	G	E	A	I	A	D	G	I	P	L	M	G	Y	T	T	W	G	C	I	D	L	V	S	A	S	T	G	E	M	S	K	R	Y	G	F	V	F	V	D	R	D	D	A	G	N	G	T	L	T	R	T	R	K	K	S	F	W	W	Y	K	K	V
Query Conservation
Alig confidence													.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation													.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	G	T	E	L	N	A	S	M	V	S	.	.	.	.	.	N	Y	S	A	Y	V	W	W	Y	I	R	R	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	G	L	L	T	E	D	G	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	S	K	R	G	Y	V	M	S	Q	Y
Template Known Secondary structure												T	.	.	.	.	.	T									S	B	S	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S	S	B		T	T	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	B
Template Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		271	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.						.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.												.	.	.	.	.	300	.	.	.											.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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