Job Description P24240 Confidence 99.66% Date Thu Jan 5 11:41:32 GMT 2012 Rank 85 Aligned Residues 293 % Identity 18% Template c1iszA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:endo-1,4-beta-d-xylanase; PDBTitle: crystal structure of xylanase from streptomyces2 olivaceoviridis e-86 complexed with galactose Resolution 2.00 Å

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		5	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	E	S	F	L	W	G	G	A	L	A	A	N	Q	S	E	G	A	F	R	E	G	D	K	G	L	T	T	V	D	M	I	P	H	G	E	H	R	M	A	V	K	L	G	L	E	K	R	F	Q	L	R	D	D	E	F	Y	P	S	H	E	A	T	D	F	Y	H	R	Y	K	E	D	I	A	L	M	A	E	M	G
Query Conservation
Alig confidence																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.
Template Conservation																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.
Template Sequence		Q	S	G	R	Y	F	G	T	A	I	A	S	G	K	L	G	D	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	Y	T	T	I	A	S	.	.	R	E	F	N
Template Known Secondary structure		T	T	T									G	G	G	T	T			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.				S
Template Predicted Secondary structure																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.
Template SS confidence
		11	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.																																																		.	30	.	.	.	.	.			.	.	.	.
		85	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.			.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.
Predicted Secondary structure																																														.	.
Query SS confidence																																														.	.
Query Sequence		F	K	V	F	R	T	S	I	A	W	S	R	L	F	P	Q	G	D	E	I	T	P	N	Q	Q	G	I	A	F	Y	R	S	V	F	E	E	C	K	K	Y	G	I	E	P	.	.	L	V	T	L	C	H	F	D	V	P	M	H	L	V	T	E	Y	G	S	W	R	N	R	K	L	V	E	F	F	S	R	Y	A	R
Query Conservation																																														.	.
Alig confidence																											.	.	.	.	.															.	.																.	.	.	.
Template Conservation																											.	.	.	.	.																																.	.	.	.
Template Sequence		M	V	T	A	E	N	E	M	K	I	D	A	T	E	P	Q	R	G	Q	F	N	F	S	A	G	.	.	.	.	.	D	R	V	Y	N	W	A	V	Q	N	G	K	Q	V	R	G	H	T	L	A	W	H	S	Q	Q	P	G	W	M	Q	S	.	.	.	.	L	S	G	S	T	L	R	Q	A	M	I	D	H	I	N
Template Known Secondary structure						S	S	T	T	S						S	B	T	T	B							.	.	.	.	.										T	T											S	S	S								.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																											.	.	.	.	.																																.	.	.	.
Template SS confidence
		40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.						.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.					.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110
		163	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	C	F	E	A	F	D	G	L	V	K	Y	W	L	T	F	N	E	I	N	I	M	L	H	S	P	F	S	G	A	G	L	V	F	E	E	G	E	N	Q	D	Q	V	K	Y	Q	A	A	H	H	Q	L	V	A	S	A	L	A	T	K	I	A	H	E	V	N	P	Q	N	Q	V	G	C	M	L	A	G	G	N	F
Query Conservation
Alig confidence																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.
Template Conservation																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.
Template Sequence		G	V	M	G	H	Y	K	G	K	I	A	Q	W	D	V	V	N	E	A	F	S	D	D	G	S	G	G	R	R	D	S	N	L	Q	R	T	G	N	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	I	E	V	A	F	R	T	A	R	A	A	D	P	A	A	K	L	C	Y	N	D	Y	N	I	.	.
Template Known Secondary structure							T	T	T	T		S									B		S	S	S	S			B			S	T	T	G	G	G		T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														T	T	S							S	S		.	.
Template Predicted Secondary structure																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.
Template SS confidence
		111	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.															150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.
		243	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	P	Y	S	C	K	P	E	D	V	W	A	A	L	E	K	D	R	E	N	L	F	F	I	D	V	Q	A	R	G	T	Y	P	A	Y	S	A	R	V	F	R	E	K	G	V	T	I	N	K	A	P	G	D	D	E	I	L	K	N	T	V	D	F	V	S	F	S	Y	Y	A	S	R	C	A	S	A	E	M	N	A
Query Conservation
Alig confidence		.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.
Template Conservation		.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.
Template Sequence		.	.	E	N	W	T	W	A	K	T	Q	G	V	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	M	V	R	D	F	K	Q	R	G	V	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	D	C	V	G	F	Q	S	H	F	N	S	G	S	P	Y	N	S	N	.
Template Known Secondary structure		.	.		S	T	T	S								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									T	T			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											B	T	T	B				T	T	.
Template Predicted Secondary structure		.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.
Template SS confidence
				175	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.															.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.
		323	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	N	S	S	A	A	N	V	V	K	S	L	R	N	P	Y	L	Q	V	S	D	W	G	W	G	I	D	P	L	G	L	R	I	T	M	N	M	M	Y	D	R	Y	Q	K	P	L	F	L	V	E	N	G	L	G	A	K	D	E	F	A	A	N	G	E	I	N	D	D	Y	R	I	S	Y	L	R	E	H	I	R	A
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	R	T	T	L	Q	N	F	A	.	A	L	G	V	D	V	A	I	T	E	L	D	I	Q	G	A	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	T	Y	A	A
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	T	T	T											T	T			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																218	.	220	.	.	.	.	.	.		.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.																		.	.	.	.	.	.
		403	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	G	E	A	I	A	D	G	I	P	L	M	G	Y	T	T	W	G	C	I	D	L	V	S	A	S	T	G	E	M	S	K	R	Y	G	F	V	F	V	D	R	D	D	A	G	N	G	T	L	T	R	T	R	K	K	S	F	W	W	Y	K	K	V	I	A	S	N	G	E
Query Conservation
Alig confidence																														.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																														.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	T	N	D	C	L	A	V	S	R	C	L	G	I	T	V	W	G	V	R	D	T	D	S	W	R	S	G	.	.	.	D	T	P	L	L	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	G	D	G	S	K	K	A	A	Y	T	A	V	L	N	A	L	N	G	G	G	Q
Template Known Secondary structure								T		T	T							S		S	B	G	G	G	S	T	T	G	G	.	.	.	G			S	S	B	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T	S		B												T
Template Predicted Secondary structure																														.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.				.	.	280	.	.	.											.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.