Job Description P11875 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:32:57 GMT 2012 Rank 21 Aligned Residues 279 % Identity 19% Template d1ffya3 SCOP info Adenine nucleotide alpha hydrolase-like Nucleotidylyl transferase Class I aminoacyl-tRNA synthetases (RS), catalytic domain Resolution 2.20

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		109	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	P	E	K	Q	T	I	V	V	D	Y	S	A	P	N	V	A	K	E	M	H	V	G	H	L	R	S	T	I	I	G	D	A	A	V	R	T	L	E	F	L	G	H	K	V	I	R	A	N	H	V	G	D	W	G	T	Q	F	G	M	L	I	A	W	L	E	K	Q	Q	Q	E	N	A	G	E	M	E	L	A	D
Query Conservation
Alig confidence																																																																											.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																											.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	K	G	N	E	T	F	I	L	H	D	G	P	P	Y	A	N	G	N	L	H	M	G	H	A	L	N	K	I	L	K	D	F	I	V	R	Y	K	T	M	Q	G	F	Y	A	P	Y	V	P	G	W	D	T	H	G	L	P	I	E	Q	A	L	T	K	K	G	V	D	R	K	K	M	S	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		T	T	T	S		B									B	S	S	S																						T	T	T		B								B			S											T			S	T	T	T		.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																											.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		44	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.
		189	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.			.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																	.	.
Query SS confidence																																																																	.	.
Query Sequence		L	E	G	F	Y	R	D	A	K	K	H	Y	D	E	D	E	E	F	A	E	R	A	R	N	Y	V	V	K	L	Q	S	G	D	E	Y	F	R	E	M	W	R	K	L	V	D	I	T	M	T	Q	N	Q	I	T	Y	D	R	L	N	V	T	L	T	.	.	R	D	D	V	M	G	E	S	L	Y	N	P	M	L	P
Query Conservation																																																																	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	A	E	F	R	E	K	C	K	E	F	A	L	E	Q	I	E	L	Q	K	K	D	F	R	R	L	G	V	R	G	D	F	N	D	P	Y	I	T	L	K	P	E	Y	E	A	A	Q	I
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									T	T	T			S		T	T	S				T	T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																		117	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.
		267	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.
Predicted Secondary structure																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	I	V	A	D	L	K	A	K	G	L	A	V	E	S	E	G	A	T	V	V	F	L	D	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	I	F	G	E	M	A	D	K	G	L	I	Y	K	G	K	K	P	V	Y	W	S	P	S	S	E	S	S	L	A	E	A	E	I	E	Y	P	H	D	W	R	T	K	K	P	V	I	F	R	A	T	P	Q	W	F	A	S	I	S	K	V	R	Q	D	I	L	D	A	I	E	N	T	N	F	K	V	N	W	G	K
Template Known Secondary structure										T	T													T	T	T	T					G	G	G							T	T	T			B																										T	S			S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		165	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.
																																																																						292	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	K	N	K	E	G	E	P	M	G	V	I
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	R	I	Y	N	M	V	R	D	R	G	E	W	V	I	S	R	Q	R	V	W	G	V	P	L	P	V	F	Y	A	E	N	G	E	I	I	M	T	K	E	T	V	N	H	V	A	D	L	F	A	E	H	G	S	N	I	W	F	E	R	E	A	K	D	L	L	P	E	G	F	T	H	P	G	S	P	N	G	T	F
Template Known Secondary structure																			S		S	S	S		B							T	T	S																					T						S						S	S	T	T				S	S		T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		439	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.
		304	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.			.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.		.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380
Predicted Secondary structure																									.	.																	.
Query SS confidence																									.	.																	.
Query Sequence		I	Q	K	K	D	G	G	Y	L	Y	T	T	T	D	I	A	C	A	K	Y	R	Y	E	.	.	T	L	H	A	D	R	V	L	Y	Y	I	D	S	R	Q	H	.	Q	H	L	M	Q	A	W	A	I	V	R	K	A	G	Y	V	P	E	S	V	P	L	E	H	H	M	F	G	M	M	L	G	K	D	G	K	P	F
Query Conservation																									.	.																	.
Alig confidence																									.	.																	.																												.	.
Template Conservation																																																																							.	.
Template Sequence		T	K	E	T	D	I	M	D	V	W	F	D	S	G	S	S	H	R	G	V	L	E	T	R	P	E	L	S	F	P	A	D	M	Y	L	E	G	S	D	Q	Y	R	G	W	F	N	S	S	I	T	T	S	V	A	T	R	G	V	S	P	Y	K	F	L	L	S	H	G	F	.	.	V	M	D	G	E	G	K	K	M
Template Known Secondary structure																T					T	T	T	T	S	T	T			S	S	B	S						G	G	G	G	T	T														S	S		S	B	S								.	.				T	T	S
Template Predicted Secondary structure																																																																							.	.
Template SS confidence
		519	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.			.	.	590	.	.	.	.	.	.
		381	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	T	R	A	G	G	T	V	K	L	A	D	L	L	D	E	A	L	E	R	A	R	R	L	V	A	E	K	N	P	D	M	P	A	D	E	L	E	K	L	A	N	A	V	G	I	G	A	V	K	Y	A	D	L	S	K	N	R	T	T	D	Y	I	F	D	W	D	N	M	L	A	F	E	G	N
Query Conservation
Alig confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	K	S	L	G	N	V	I	V	P	D	Q	V	V	K	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	G	A	D	I	A	R	L	W	V	S	S	T	D	Y	L	A	D	V	R	I	S	D	E	I	L	K	Q	T	S	D	D
Template Known Secondary structure			S	S	S	S												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T											T	S		T	T	S
Template Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		597	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.