Job Description P11875 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:32:57 GMT 2012 Rank 30 Aligned Residues 382 % Identity 20% Template c1obhA_ PDB info PDB header:synthetase Chain: A: PDB Molecule:leucyl-trna synthetase; PDBTitle: leucyl-trna synthetase from thermus thermophilus complexed2 with a pre-transfer editing substrate analogue in both3 synthetic active site and editing site Resolution 2.2 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		88	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.			110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																								.	.
Query SS confidence																								.	.
Query Sequence		D	P	A	F	L	A	E	H	V	Q	Q	A	L	A	S	D	R	L	G	V	A	T	.	.	P	E	K	Q	T	I	V	V	D	Y	S	A	P	N	V	A	K	E	M	H	V	G	H	L	R	S	T	I	I	G	D	A	A	V	R	T	L	E	F	L	G	H	K	V	I	R	A	N	H	V	G	D	W	G	T	Q
Query Conservation																								.	.
Alig confidence																								.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	P	H	A	I	E	A	K	W	Q	R	F	W	E	E	K	G	F	M	K	A	K	D	L	P	G	G	G	K	Q	Y	V	L	V	M	F	P	Y	P	S	G	D	L	H	M	G	H	L	K	N	Y	T	M	G	D	V	L	A	R	F	R	R	M	Q	G	Y	E	V	L	H	P	M	G	W	D	A	F	G	L	P
Template Known Secondary structure				T	T													T	T	T				S	S																	S	S		B																					T									B				S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		5	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.
		166	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	G	M	L	I	A	W	L	E	K	Q	Q	Q	E	N	A	G	E	M	E	L	A	D	L	E	G	F	Y	R	D	A	K	K	H	Y	D	E	D	E	E	F	A	E	R	A	R	N	Y	V	V	K	L	Q	S	G	D	E	Y	F	R	E	M	W	R	K	L	V	D	I	T	M	T	Q	N	Q	I	T	Y	D	R
Query Conservation
Alig confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	E	N	A	A	L	K	F	G	V	H	P	K	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	T	Y	A	N	I	R	Q	A	K	E	S	L	R	L
Template Known Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		86	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																				100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.
		246	.	.	.	250	.			.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure								.	.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence								.	.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	N	V	T	L	T	.	.	R	D	D	V	M	G	E	S	L	Y	N	P	M	L	P	G	I	V	A	D	L	K	A	K	G	L	A	V	E	S	E	G	A	T	V	V	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation								.	.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence								.	.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		M	G	I	L	Y	D	W	D	R	E	V	T	T	C	E	P	E	Y	Y	R	W	N	Q	W	I	F	L	K	M	W	E	K	G	L	A	Y	R	A	K	E	Q	W	Y	L	R	I	T	A	Y	A	E	R	L	L	K	D	L	E	G	L	N	W	P	E	K	V	K	A	M	Q	R	A	W	I	G	R	S	E	G	A
Template Known Secondary structure		T	T					G	G	G			B	T	T	S																	T	T													G	G	G	G							T	T	T	T			S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		115	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	I	L	F	P	V	E	G	K	E	V	R	I	P	V	F	T	T	R	P	D	T	L	F	G	A	T	F	L	V	L	A	P	E	H	P	L	T	L	E	L	A	A	P	E	K	R	E	E	V	L	A	Y	V	E	A	A	K	R	K	T	E	I	E	R	Q	A	E	G	R	E	K	T	G	V	F	L	G	A	Y
Template Known Secondary structure							B	T	T		S								S		G	G	G	G	G	G								T	T		T	T	T	T	T	S			G	G	G													T	S						S		T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		231	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	L	N	P	A	T	G	E	R	I	P	I	W	T	A	D	Y	V	L	F	G	Y	G	T	G	A	I	M	A	V	P	A	H	D	Q	R	D	Y	E	F	A	R	K	F	G	L	P	I	K	K	V	I	E	R	P	G	E	P	L	P	E	P	L	E	R	A	Y	E	E	P	G	I	M	V	N	S	G	P	F	D
Template Known Secondary structure					T	T	T										T	T	S		S	S	S	T	T	S						G	G	G												T									B	T	T	B				S	S		S	S				S						S	S	G	G	G	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		311	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390
																														289	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	D	E	F	K	N	K	E	G	E	P	M	G	V	I	I	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	T	E	S	E	E	G	K	R	K	V	I	A	W	L	E	E	K	G	L	G	K	G	R	V	T	Y	R	L	R	D	W	L	I	S	R	Q	R	Y	W	G	T	P	I	P	M	V	H	C	V	V	P	V	P	E	E	E	L	P	V	L	L	P	D	L	K	D	V	E	D	I	S	P	L	E	A	H	P	E	F
Template Known Secondary structure		T		B																T	S								S											S	S	S														G	G	G									S		S	T	T			G	G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		391	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470
								306	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.															330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.						.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	K	K	D	G	G	Y	L	Y	T	T	T	D	I	A	C	A	K	Y	R	Y	E	T	L	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	D	R	V	L	Y	Y	I	D	S	R	Q	H	Q	H	L	M	Q	A	.	.	.	.	.	W	A	I	V	R	K	A	G	Y	V	P	E
Query Conservation		.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	E	T	T	C	P	K	R	D	T	D	T	M	D	T	F	F	D	S	S	W	Y	Y	L	R	Y	T	D	P	H	N	D	R	L	P	F	D	P	E	K	A	N	A	W	M	P	V	D	Q	Y	I	G	G	V	E	H	A	V	L	H	L	L	Y	S	R	F	F	T	K	F	L	H	D	L	G	M	V	K	V	E
Template Known Secondary structure									B												T	T					T	T	S	T	T		S	S	S	S											S	B	S							T	T																		T	T	S		S		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		361	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.																																																						.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	V	P	L	E	H	H	M	F	G	M	M	L	G	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	G	K	P	F	K	T	R	A	G	G	T
Query Conservation																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	P	F	Q	G	L	F	T	Q	G	M	V	L	A	W	T	D	F	G	P	V	E	V	E	G	S	V	V	R	L	P	E	P	T	R	I	R	L	E	I	P	E	S	A	L	S	L	E	D	V	R	K	M	G	A	E	L	R	P	H	E	D	G	T	L	H	L	W	K	P	A	V	M	S	K	S	K	G	N	G
Template Known Secondary structure			S	B	S																					T	T													T		S		S										T	T							T	T	S	S											T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		566	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.
		388	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.		.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																					.
Query SS confidence																																																					.
Query Sequence		V	K	L	A	D	L	L	D	E	A	L	E	R	A	R	R	L	V	A	E	K	N	P	D	M	P	A	D	E	L	E	K	L	A	N	A	V	G	I	G	A	V	K	Y	A	D	L	S	K	N	R	.	T	T	D	Y	I	F	D	W	D	N	M	L	A	F	E	G	N	T	A	P	Y	M	Q	Y	A	Y	T	R
Query Conservation																																																					.
Alig confidence											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.																	.	.	.	.
Template Conservation											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.
Template Sequence		V	M	V	G	P	F	V	K	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	G	A	D	I	A	R	I	T	I	L	F	A	A	P	P	E	N	E	M	V	W	T	E	E	G	V	Q	G	A	W	R	.	.	.	.	F	L	N	R	I	Y	R	R
Template Known Secondary structure			B								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S													S		T	T	S															.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.
Template SS confidence
		646	.	.	.	650	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.					.	.	.	690	.	.	.	.
		467	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	L	S	V	F	R	K	A	E	I	D	E	E	Q	L	A	A	A	P	V	I	I	R	E	D	R	E	A	Q	L	A	A	R	L	L	Q	F	E	E	T	L	T	V	V	A	R	E	G	T	P	H	V	M	C	A	Y	L	Y	D	L	A	G	L	F	S	G	F	Y	E	H	C	P	I	L	S	A	E	N	E	E
Query Conservation
Alig confidence																						.	.	.																																																				.	.	.	.	.	.
Template Conservation																						.	.	.																																																				.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	A	E	D	R	E	A	L	L	E	T	S	G	V	F	Q	A	E	A	L	.	.	.	E	G	K	D	R	E	L	Y	G	K	L	H	E	T	L	K	K	V	T	E	D	L	E	A	L	R	F	N	T	A	I	A	A	L	M	E	F	L	N	A	L	Y	E	Y	R	K	D	R	P	V	T	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure					T						T							G	G	G		.	.	.																								T	T																							S		S		.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																						.	.	.																																																				.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		695	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.				.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.
		547	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	R	N	S	R	L	K	L	A	Q	L	T	A	K	T	L	K	L	G	L	D	T	L
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	V	Y	R	T	A	I	R	Y	Y	L	Q	M	L
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
											766	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.